10元转录组分析:首先你得有个服务器 饿第肾啊

服务器

俗称性能怪兽的计算机,至少我是这么认为的。电脑的配置真的是一分钱一分货,比如一台imac pro那样的配置不知道两个肾够不够。某宝上也有工作站,加上显示器最起码也要3万。 今天就教大家如何花最少钱去搞一台性能

怪兽驯养之路

:把某宝上的某呗开通然后,去买一台工作站。这样分期一下,提前用,分析以后拿数据跟老板要钱报销@!@#¥@%¥隔壁师兄真的这样搞了一台结果还在每天吃着泡面,分析数据。当然这不是最惨的,由于在mapping时候也就是比对数据的时候都是小的字节读取,这对机械硬盘简直是巨大的伤害,于是隔壁师兄一年换了三个硬盘。这样下去估计明年连方便面都吃不上了:学校里面有个怪兽驯养馆,自己花钱去领养一只,让他给你分析数据。国内少部分学校已经有试用的了,现在还不花钱,但不知道以后是多少钱。再就是跟隔壁生信专业的教授合作,把你辛辛苦苦收的样本测序完了以后,数据给他们分析一下,筛选出来的东西你去验证,最后他们要个并通和并一什么的,这样宝宝们心里一定会更苦。:正经的说了哈~划重点了哈~自己搭建一台属于自己的。其实这项服务很多测序都开展了,比如某禾、某迈和某大,他们将分析需要的软件要么集成在一台一体机中,配置满足分析要求价钱跟某宝一台工作站一样,或者和一些云服务器供应商比如热带雨林、企鹅,强盗的伙伴还有度娘合作,把你需要的软件指令都装好放在云服务器上,你需要上传自己的数据到云服务器然后运行指令,等待结果在copy到自己的电脑上。收费呢?每年至少3万。:就是真正的重点哈~上面的重点是留给土豪的,有钱可以去交个公司做,当然你提出了要求人家就会要你一份钱,有钱可以去烧。老板就给了5万元经费让你发一篇3分SCI毕业,咋办?对于金牛座的我一定会想到办法的~~~一个巨便宜的云服务器解决方案诞生了~1、有建立好的index2、有数据,可以是自己找公司做的,也可以是从公共数据平台下载的fastq文件。3、Mapping:运行STAR这个软件去比对4、Readcount:其实STAR可以直接输出Readcount,你也可以后期用其他软件去做比如HTseq2.5、得到了每个基因的Readcount数以后用R去分析这里面最需要用高配置的地方只有, 而其他的地方现在市面上的笔记本电脑都能完成了。之前我担心的是网速问题,传4个G的样本数据,得有一阵子。但实际操作来看,上传速率最少是(1M/s),睡觉前开始传,醒来已经传完。具体需要什么样的配置呢,参考测序公司给的最低配置,至少16核与32G内存,500GB硬盘容量,我们就参照这个去配置一台服务器。其实根据我上面的提示,大家可以自己试一试配置一台服务器,我用的是“企鹅”家的云服务器,如果看到价格不敢往下操作了,那么下一次教程告诉你们怎么省钱。希望你们能多多转发,评价公众号的硬指标就是关注人数,截止到发稿已经有61位关注。人数超过5000,是我的小目标,拜托了各位

来自于吐槽星的留言

“又拿我吃方便面的事来说,哥现在已经不吃方便面了,吃六合了,有木有!爆个料,作者曾经因为乱搞~~服务器,结果欠了热带雨林1万多,你们想资道他是怎么把钱要过来的么,想资道的留言666”——隔壁师兄“师兄还是那个师兄,去临床了还是一样的墨迹,第二篇文章画了那么多重点,都不是重点啊喂!还得去加一板96孔,筛他分析出来的差异基因希望一切顺利”——隔壁师弟“五万元咋毕业啊,买两个抗体就1万,师兄说的10元/样,啥时候能痛快点出个完整教程,毕业还能赶上么,大家转起来吧,多关注一些”——隔壁二师弟“看了师兄废话一堆,心里莫名有了些许希望。觉得似乎说了很多,但又什么也没说,去试一试自己搭一个服务器,看看跟他下次将的有没有什么差别,OT事件听说有反转了,还是主编有实力,跟WOS谈判呢,还是好方”——隔壁师妹“公众号文章写了两篇,你那两份申报书呢,来来来~到我办公室一趟”——主任

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