ID转换大全

实际上掌握了编程的思维，任何一门语言都可以做id转换！

对于初学者来说，这个是非常实用的一个，很多人当初就是因为要做这个转换，才慢慢走入了编程的道路。

使用大部分软件的时候，第一步就是文件数据准备，基本上都是数据的拆分和整合，这个拿id转换做基础练习也挺好的！

本来应该作为第一讲，但是当初认为太基础了，而忽略掉了，放在这里也好，大部分同学已经跟我们学习两个月了，可以拿这个题目来检验自己的水平了！

ID转换简单来说，就是找到对应关系表，然后用hash或者字典对应一下即可。但也可以很复杂：

为什么要转换id？

有多少种ID？

什么id权威？

id是一一对应的吗？

ID是什么生信组织维护？

id有版本吗？

id一定正确吗？

什么情况下选择什么id？

不同数据库下载的id对应表一定一样吗？

你们看我的博客，就知道，我是如何重视ID转换的：

用R的shiny包写一个基因的ID转换小程序

gene的各种ID转换终结者-bioconductor系列包

gene的symbol与entrez ID并不是绝对的一一对应的

还有论坛里面的：生信人必须了解的各种ID表示方式

当然，我们时间有限，不可能面面俱到，很多东西都是需要自己去慢慢挖掘的！

需要集中学习的是 entrez gene ID, HUGO symbol, refseq ID, ensembl ID

作业，就是用perl,python,R来把1~1000 这1000个 entrez gene ID转为另外3个吧，如果该entrez gene ID不存在，就不用转了。

请自己下载基因ID的对应关系文件，参考，http://www.bio-info-trainee.com/75.html

最后：

请务必把下面的代码运行一下，把输出的all_gene_bioconductor.html文件好好看看！