Linux学习-环境变量和可执行属性

文件的可执行属性和环境变量

Linux下文件有一个特殊的属性即可执行属性,用来指示这个文件是一个可执行的脚本或可以运行的二进制文件。前面所提到的这些命令,都具有可执行属性。

which: 表示查看命令的路径。一般用于当我们想知道使用的命令来源于什么地方时,比如安装了多个R或多个python,但又分不清用的是哪个时,which一下,立即明了。在这儿我们用which获取的是可执行的命令所在的路径,进而查看其属性。

ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l "`which cd`"
#rwx: 文件所有者可读、可写、可执行
#r-x: 文件所有者所在组其它成员可读、可执行,不可修改
#r-x: 其它人可读、可执行,不可修改
-rwxr-xr-x 1 root root 26 12月  7 2016 /usr/bin/cd
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l "`which mkdir`"
-rwxr-xr-x. 1 root root 79768 11月  6 2016 /usr/bin/mkdir
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l "`which python`"
#l: 代表软连接
#软连接自身是所有人可读可写,但具体的权限依赖于其链接的文件
lrwxrwxrwx. 1 root root 7 3月  22 15:04 /usr/bin/python -> python2
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l "`which python2`"
#第二层链接
lrwxrwxrwx. 1 root root 9 3月  22 15:04 /usr/bin/python2 -> python2.7
#链接的原始文件
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l "`which python2.7`"
-rwxr-xr-x. 1 root root 7136 11月  6 2016 /usr/bin/python2.7

文件属性rwxr表示read (数字表示为4)、w表示write (数字表示为2)、x表示执行 (数字表示为1)。三个未一组,连续出现三次(如下面命令行中所示), 第一组表示文件的所有者拥有的权限,第二组为文件所有者所在的用户组所拥有的权限,组内所有成员都具有的权限,第三组为其它用户的权限。

chmod a+x file: 表示给文件增加所有人(a)可执行权限 (+x)

chmod u+x file: 表示给文件增加所有者(u,user,)可执行权限 (+x)

chmod g+x, chmod o+X: 表示给文件增加组内人或其它人可执行权限

chmod 755 file: 表示拥有者有可读写执行权限,其它人有可读执行权限。(7=4+2+1; 5=4+1)

具体使用man chmod查看其它参数使用。

# 新建个文件
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ cat <<END >run.sh
> echo " I am a script created by ehbio." 
> END

# 查看其权限值
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l run.sh 
-rw-rw-r-- 1 ct ct 39 6月  14 23:12 run.sh

# 更改权限值
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ chmod 755 run.sh

# 查看其权限值
# 注意多了3个x
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l run.sh 
-rwxr-xr-x 1 ct ct 39 6月  14 23:12 run.sh

# 去除其它用户的可执行权限
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ chmod o-x run.sh 

# 注意看少了个x
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l run.sh 
-rwxr-xr-- 1 ct ct 39 6月  14 23:12 run.sh

# 去除同组的可执行权限
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ chmod g-x run.sh

# 注意看又少了个x
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l run.sh 
-rwxr--r-- 1 ct ct 39 6月  14 23:12 run.sh

# 去除所有人的可执行权限
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ chmod a-x run.sh
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l run.sh 
-rw-r--r-- 1 ct ct 39 6月  14 23:12 run.sh

# 给所有人增加可执行权限
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ chmod a+x run.sh
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ ls -l run.sh 
-rwxr-xr-x 1 ct ct 39 6月  14 23:12 run.sh

如果一个文件有了可执行权限,是不是就可以执行了,我们来检测下。

ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ run.sh
-bash: run.sh: 未找到命令

事实上并非如此,输入命令,回车后,提示命令未找打,这是为什么呢?

这就涉及到环境变量的概念,通俗的讲,环境变量就是告诉电脑 (实际是操作系统)几个目录。这几个目录下存储又可执行文件,如前面显示的/usr/bin目录,大部分的系统命令都在这个目录下。

当我们输入命令mkdir时,系统就会在环境变量所代表的几个目录从前都厚去查找,哪个里面有mkdir文件,然后去执行mkdir命令。

系统中环境变量的名字是PATH,其内容可通过下面的命令显示 (根据操作系统不同和配置不同,略有差别,但格式是统一的,:分割的一堆路径):

ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ echo $PATH
/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin

所以如果我们想让自己的命令能被系统找到,就需要把命令所在的目录加到环境变量里面,怎么操作呢?

加到环境变量的路径必须是全路径,全路径指以/开头或已~开头的路径。

# 加到环境变量的路径必须是全路径,全路径指以/开头或已~开头的路径
# 注意第一个PATH不含$, 第二个PATH有$符号
# 我们后面会讲什么时候用$, 什么时候不用$
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ export PATH=$PATH:/home/ct
ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ echo $PATH
/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/home/ct

这时,我们在执行那个命令试试,成功运行了。

ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ run.sh 
I am a script created by ehbio.

所以在以后安装了新的软件,或者写了新的脚本后,都把软件的可执行程序可执行的脚本所在的目录,加到环境变量里面就可以了。

但是,在命令行中执行export,对环境变量所做的修改,只对当前终端有效,退出后就无效了。为了使得这一操作,长期有效,我们需要把这句话写入一个文件中,一个登陆服务器就会被自动读取的文件中。

对于普通用户,在远程登录终端时,家目录下的~/.bash_profile (不是~/.bashrc)会自动被读取,所以我们需要把export语句加入到这个文件中。

# 这是我的~/.bash_profile中的内容,主要是最好一行。可以连续的加入多个路径。
if [ -f ~/.bashrc ]; then
    . ~/.bashrc
fi

if [ -f ~/.bash_aliases ]; then
    . ~/.bash_aliases
fi

export PATH=$PATH:/home/ct:/home/bin:/home/soft/bowtie2/bin

前面提到,系统查找命令的顺序是从环境变量的第一个目录到最后一个目录,在第一次碰到查询的命令后,就调用执行。假如系统存在一个python命令,我们自己又安装了一个python (假如在/home/ct/anaconda/bin目录下),如果我们想执行自己的python程序,就需要把/home/ct/anaconda/bin写在$PATH前面,如下

# 注意$PATH的顺序

ct@iZ8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~$ export PATH=/home/ct/anaconda/bin:$PATH

至此,我们可以熟练使用环境变量来简化命令的输入过程了,因为如果没有环境变量,我们就得需要运行/home/ct/anaconda/bin/python来运行python命令了。

环境变量这块,自己多操作下,就会慢慢理解熟练了。

本文分享自微信公众号 - 生信宝典(Bio_data)

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原始发表时间:2017-06-15

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