R语言的数据导入与导出(write.table,CAT)

福尔·摩斯曾说过:“数据,数据,没有数据的推理是罪恶!”不过比起有意思的统计分析,数据的导入与导出显得十分的无趣,但是不得不说统计分析的数据导入与导出是个让人沮丧的任务,而且耗时巨大。 今天分享的是R中数据的输出与一些特定格式的数据读入。

一、数据的输出 R中提供了write.table(),cat()等函数来导出数据。不过值得指出的是R语言能够导出的数据格式是有限的,比如在基本包中,我们能够导出数据的格式只有txt,csv。 现在介绍一下两个函数的用法: write.table(x, file = “”, append =FALSE, quote = TRUE, sep = ” “, eol = “\n”, na = “NA”, dec = “.”,row.names = TRUE, col.names = TRUE, qmethod = c(“escape”, “double”), fileEncoding = “”) write.csv(…) write.csv2(…) write.csv(),write.csv2()可以看做write.table()的变体,我们知道write.csv(),与参数sep=“,”的write.table()是等效的。下面介绍几个常见参数: x:数据集 file:文件的路径,包括文件名如:”D:/R/data/data1.csv” quote:数据在写入文件中时我们常用引号将其隔开,当参数为F时,文件中的数据不再用引号修饰 append:是否追加,如果文件名已存在而没有选择追加,那么文件将会被覆盖。(覆盖时是没有提示的,所以命名需要注意一些。 cat(… , file = “”, sep = ” “, fill = FALSE, labels = NULL, append = FALSE) cat()作为一个输出函数与dos命令差不多,也是将数据集或数据写入文件中,常用参数和write.table()类似。 cat()函数用来输出,可以把多个参数连接起来再输出(具有paste()的功能)。 例如: > cat(c(“AB”, “C”),c(“E”, “F”), “n”, sep=”/ “) AB/ C/ E/ F/ n 还可以指定一个参数file=给一个文件名,可以把结果写到指定的文件中,如: > cat(“i = “, 1, “n”, file=”d:/R/data2.txt”)如果指定的文件已经存在则原来内容被覆盖。加上一个append=TRUE参数可以不覆盖原文件而是在文件末尾附加,这很适用于运行中的结果记录。 当然cat()的用法比较丰富,也可以用来查看文件,与format合用控制输出格式等。

二、数据的导入 先介绍R中基本的读取数据函数read.table()的用法:

read.table(file, header = FALSE, sep = “”, quote = “\”‘”,
dec = “.”, row.names, col.names,
as.is = !stringsAsFactors,
na.strings = “NA”, colClasses = NA, nrows = -1,
skip = 0, check.names = TRUE, fill = !blank.lines.skip,
strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,
comment.char = “#”,
allowEscapes = FALSE, flush = FALSE,
stringsAsFactors = default.stringsAsFactors(),
fileEncoding = “”, encoding = “unknown”, text)
read.csv(file, header = TRUE, sep = “,”, quote=”\”", dec=”.”,
fill = TRUE, comment.char=”", …)
read.csv2(file, header = TRUE, sep = “;”, quote=”\”", dec=”,”,
fill = TRUE, comment.char=”", …)
read.delim(file, header = TRUE, sep = “\t”, quote=”\”", dec=”.”,
fill = TRUE, comment.char=”", …)
read.delim2(file, header = TRUE, sep = “\t”, quote=”\”", dec=”,”,
fill = TRUE, comment.char=”", …)

介绍常用参数: File:文件路径,可以用绝对路径也可以用相对路径,R的工作目录你可以使用getwd()来查看,用setwd()来改。 Header:读取文件的第一行是否用作变量名 Sep:分隔符,参数为“,“时等价于read.csv() Scan()函数也是一个读取数据比较好的函数,但是参数较为复杂,我们可以说,read.table()函数是scan函数的设定好部分参数的结果。 Read.delim()这个可以读到剪贴板的东西,用法为read.delim(clipboard)其他参数与read.table相同。 Read.fwf()读取固定长度的数据,也可以利用这个特性截去数据的尾巴或者表格的尾巴。 自带的foreign包可以实现s-plus,sas,spss,stata的数据读入。以读stata数据为例: >Read.dta(“d:/R/data3.dta”)其他参数与read.table也是一样的。 遗憾的是,基本包与foreign包都没有办法读取excel的数据。但这并不代表我们没办法读取excel的数据。例如我们可以将excel的数据放在剪贴板中,通过read.delim(clipbroad)来读取。也可以将excel表格变成csv格式的再处理。最后指出,R中的gdata包的read.xls函数以及RODBC包中也有相应的处理函数。 本文的最后,运用R语言的帮助文档《R数据的导入与导出》中的一段话作为结束:“In general, statistical systems like R arenot particularly well suited to manipulations of large-scale data. Some othersystems are better than R at this, and part of the thrust of this manual is tosuggest that rather than duplicating functionality in R we can make anothersystem do the work! (For example Therneau & Grambsch (2000) commented thatthey preferred to do data manipulation in SAS and then use packagesurvival in S for the analysis.)”

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