一、简介
上一篇中我们介绍了ggplot2的基本语法规则,为了生成各种复杂的叠加图层,需要了解ggplot2中一些基本的几何图形的构造规则,本文便就常见的基础几何图形进行说明;
二、各基础图形
2.1 abline()、hline()与vline()
在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条,在ggplot2中当然也有类似的方法:
geom_abline():
我们主要使用两个参数控制线条的位置,slope控制斜率,intercept控制截距,下面是一个简单的例子,我们在散点图层上叠加截距为20,斜率为2的直线:
library(ggplot2)
p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) +
geom_point() +
geom_abline(intercept = 20,slope = 2)
p
geom_vline():
如果你想添加的直线垂直于x轴,则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条,xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置,若传入向量则可同时添加多条线条:
library(ggplot2)
p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) +
geom_point() +
geom_vline(xintercept = 5)
p
p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) +
geom_point() +
geom_vline(xintercept = 1:5)
p
geom_hline():
同样的,我们通过在geom_hline()中传入参数yintercept来绘制垂直于y轴的线条:
p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) +
geom_point() +
geom_hline(yintercept = 20)
p
p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) +
geom_point() +
geom_hline(yintercept = 15:25)
p
2.2 area()
面积图也是一种很常用的图,多用于表现某些水平或比例类指标随时间的变化情况,下面是一个朴素的例子,以huron湖水水平变化数据为例:
library(ggplot2)
p <- ggplot(huron,aes(x=year,y=level))+
geom_area(fill='springgreen')
p
实际上面积图最有表现力的类型是堆积面积图,下面以美国5个消费指标上5个年份的数据为例绘制堆积面积图:
library(ggplot2)
library(reshape2)
#将原数据转置以处理成行对应一个年份的形式
data <- data.frame(t(USPersonalExpenditure))
#添加年份变量
data$year <- as.numeric(row.names(data))
#利用reshape2中的melt函数按照year列将原数据集伸展为“年份、变量名、对应数值”的形式
data <- melt(data, id='year')
h <- ggplot(data, aes(x=year, y=value))+
geom_area(aes(fill=variable),position = 'fill')+
theme(legend.position = 'bottom')+
labs(title='堆积面积图')+
theme(plot.title = element_text(hjust=0.5))
h
这样得到的图就比较具有美感和表现力,当然我们更改position参数也可以得到真实的水平逐年变化情况:
h <- ggplot(data, aes(x=year, y=value))+
geom_area(aes(fill=variable),position = 'identity')+
theme(legend.position = 'bottom')+
labs(title='堆积面积图')+
theme(plot.title = element_text(hjust=0.5))
h
2.3 bar()
基础的条形图我们前面一篇中已经涉及到了,所以这里我们只与上述的堆积面积图进行对比,这里注意,geom_bar()默认的统计变换为count,即计算频数,我们这里想展示真实数值需要将geom_bar()中的stat设置为'identity',即不做任何变换:
library(ggplot2)
library(reshape2)
data <- data.frame(t(USPersonalExpenditure))
data$year <- row.names(data)
data <- melt(data, id='year')
p <- ggplot(data, aes(x=year,y=value))+
geom_bar(aes(fill=factor(variable)),stat = 'identity')+
labs(title='消费水平')+
theme(plot.title=element_text(hjust=0.5))
p
可以看出这时我们的堆叠条形图便而可以看作离散的堆积面积图;
2.4 bin2d()
二维热图也是一种非常实用的图像,我们可以用来一览数据的某两个变量上的指标分布情况:
library(ggplot2)
d <- ggplot(diamonds, aes(x, y))+
geom_bin2d()+
labs(title='钻石长宽分布')+
theme(plot.title=element_text(hjust=0.5))
d
我们还可以利用bin2d()来直观的了解数据集的缺失情况:
library(ggplot2)
library(reshape2)
#载入数据
data <- airquality
#统计缺失值位置并保存为矩阵
na.count <- is.na(data[,-6])
#用1表示缺失,0表示未缺失
na.count[na.count == T] <- 1
na.count[na.count == F] <- 0
#将Day按列与na.count拼接并转为数据框
na.count <- data.frame(cbind(na.count,data[,6]))
names(na.count) <- names(airquality)
#利用melt以Day为b
na.count <- melt(na.count,id='Day')
#绘制数据集缺失情况概括图,以变量名为分面依据
p <- ggplot(na.count,aes(x=Day,y=value))+
geom_bin2d()+
facet_grid(facets = .~variable)
p
2.5 density()与density2d()
很多时候当我们获取的数据集样本数量足够时,通常我们可以绘制密度估计图来大致描述数据集数据的分布,ggplot2中当然提供了这类方法,我们先从一维的说起: geom_density():
和R基本绘图系统中的密度曲线绘制方法很接近:
library(ggplot2)
data <- data.frame(matrix(rnorm(200),nrow=100))
v <- ggplot(data, aes(x=X1))+
geom_density(alpha=0.3,fill='springgreen',colour='springgreen')
v
geom_density2d():
和density()类似,只是我们可以通过density2d来绘制二维变量的概率密度分布:
v <- ggplot(data, aes(X1, X2))+
geom_point()+
stat_density2d(aes(colour=..level..))
v
也可以不绘制等高线,将..density..作为fill的传入参数,注意这里一定要设置contour为F:
# 密度图函数,通过fill设置填充颜色数据为密度,geom设置绘制栅格图
p <- ggplot(data, aes(x = X1, y = X2)) +
stat_density2d(aes(fill = ..density..), geom = "raster", contour = F)
p
或是在透明度alpha上动手脚:
# 密度图函数:alpha设置填充透明度数据为密度,geom设置绘制栅格图
p <- ggplot(data, aes(x = X1, y = X2)) +
geom_point() +
stat_density2d(aes(alpha = ..density..), geom = "raster", contour = FALSE)
p
2.6 boxplot()
在统计学描述数据分布的图形中,箱线图是非常有代表性的,它通过图形表现五数概括的情况,在数据基本的描述性统计中具有重要意义,而ggplot2中必然可以绘制箱线图,而且可以绘制得非常精美,下面先看一个最朴素的分组箱线图形式:
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy)) +
geom_boxplot()
p
我们为其赋以分组依据以配上颜色:
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy, fill=factor(class)))
p + geom_boxplot()
为我们的填充设置透明度,并将边框也赋以对应的颜色:
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy, fill=factor(class), colour=factor(class)))+
geom_boxplot(alpha=0.55)
p
还可以将散点图与箱线图结合起来(这里施加jitter随机扰动以组织样本点重合):
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy, fill=factor(class), colour=factor(class)))+
geom_boxplot(alpha=0.55)+
geom_point(position = 'jitter')
p
2.7 histogram()
关于直方图,因为前面也说过,这里就举几个由朴素的直方图扩展开的示例:
library(ggplot2)
p <- ggplot(diamonds, aes(carat)) +
geom_histogram()
p
p <- ggplot(diamonds, aes(carat,fill=cut)) +
geom_histogram()
p
p <- ggplot(diamonds, aes(carat, fill=cut)) +
geom_histogram()+
facet_grid(facets = .~cut)
p
2.8 curve()与segment()
有时候我们需要在已绘制的图形中添加线段、曲线、小箭头之类的注解,这时候就可以用到ggplot2中的geom_curve()与geom_segment(),他们的主要参数类似,需要在aes()中定义起点坐标x、y,以及终点坐标xend、yend,如需要线段或曲线上带有小箭头,则额外定义参数arrow即可,箭头方向由之前的起点终点决定:
data <- data.frame(x=c(1,2,3,4),y=c(1,2,3,4))
p <- ggplot(data,aes(x,y))+
geom_point()
p
p + geom_curve(data=data,aes(x=x[1],y=y[1],xend=x[4],yend=y[4],colour='曲线'))
在原有图形基础上添加线段并带上小箭头:
p + geom_curve(data=data,aes(x=x[1],y=y[1],xend=x[4],yend=y[4],colour='曲线'))+
geom_segment(data=data,aes(x=x[2],y=y[2],xend=x[3],yend=y[3],colour='直线'),
arrow = arrow(length = unit(0.02, 'npc')))
2.9 text()与label()
有些时候我们需要在已绘制的图形上添加文本类标签,这种时候就需要用到text()和label()了,下面以不同的示例来说明其常见用法:
用对应每一个样本的文本标签代替散点:
p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg, label = rownames(mtcars)))
p + geom_text()
对出现标签遮挡的情况进行抹除(不建议使用):
p + geom_text(check_overlap = TRUE)
使用别致的标签:
p + geom_label()
改变文本标签的大小:
p + geom_text(size = 10)
调整文字标签位置:
p + geom_point() + geom_text(hjust = 0, nudge_x = 0.05)
调整文字标签位置:
p + geom_point() + geom_text(vjust = 0, nudge_y = 0.5)
调整文本标签位置:
p + geom_point() + geom_text(angle = 45)
更精致的标签类型:
p + geom_label(aes(fill = factor(cyl)), colour = "white", fontface = "bold")
在图床指定位置添加文本标签:
df <- data.frame(
x = c(1, 1, 2, 2, 1.5),
y = c(1, 2, 1, 2, 1.5),
text = c("bottom-left", "bottom-right", "top-left", "top-right", "center")
)
ggplot(df, aes(x, y)) +
geom_text(aes(label = text))
可以看出,落入四角的标签因为其中心对应坐标点,导致部分内容伸出边界,这里我们令vjust = "inward", hjust = "inward"使得它自适应的调整位置以显示全部信息:
ggplot(df, aes(x, y)) +
geom_text(aes(label = text), vjust = "inward", hjust = "inward")
2.10 violin()
小提琴图是一种功能和箱线图类似,但增加了核密度估计功能的图形,且更为美观,ggplot2可以绘制出与seaborn中的小提琴图同样优美的图形,因为涉及的内容比较复杂,我准备在之后单独开一篇来介绍,下面仅展示一张简单的小提琴图:
library(ggplot2)
data <- mtcars
p <- ggplot(data, aes(factor(cyl), mpg))+
geom_violin(aes(fill = cyl,colour=cyl))
p
以上就是ggplot2中常规图形的简单介绍,其中比较重要且比较复杂的几种将会在之后单独开文章详细介绍,如有笔误,望指出。
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