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社区首页 >专栏 >通常自己的目标基因要在公共数据库看是否影响生存

通常自己的目标基因要在公共数据库看是否影响生存

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生信技能树
发布于 2018-12-18 06:50:24
发布于 2018-12-18 06:50:24
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文章被收录于专栏:生信技能树生信技能树

看到一篇文章提到了这个分析,其实这样的分析已经常规化了。 文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-018-04987-y

重点是作者对自己的生物学领域背景知识的把控能力,比如首先应该是知道哪些数据集是可以拿来使用的。

作者使用的是Tothill的2008文章的数据集,发现自己感兴趣的基因的两个探针都显著性的影响生存,文章是:Tothill, R. W. et al. Novel molecular subtypes of serous and endometrioid ovarian cancer linked to clinical outcome. Clin. Cancer Res. 14, 5198–5208 (2008).

常规化流程,不会代码的可以利用网页工具,会代码的当然是在R里面探索各式各样的数据集咯 。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2018-11-22,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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