这是一篇广告,有干货的广告。
针对生信领域的零基础爱好者及生信分析中遇到的种种问题,生信领域知名公众号“生信宝典”团队组织了中科院系统项目经验丰富的一线科研人员开展系列培训活动。本期零基础Python编程班,应用Python处理生物信息数据和作图,三天高强度学习你也可以入门编程。
在之前的文章—小学生都学Python了,你还不知道怎么开始,一文中介绍了Python的应用广泛,功能强大,提供了Python的在线学习视频和资料等 (收集资料是我们的最爱,近期有待更新)。
学习程序语言不是一件难事,也不是一件简单事。为什么编程这么难一文中翻译了一篇编程学习的心路历程。
图源:codeboom.wordpress.com/2016/02/22/how-do-you-actually-teach-programming/
“编程信心与能力”:纵轴为信心值,横轴为能力水平。
四个点从左至右依次分割出四个时期:学习语法的初级法师时期、开始用一堆模块堆“乐高”时期、麻木于调试程序的打字猴时期、足以承担任务并灵活善变的kitten猫时期。
在我看来,学习编程是学以致用,学习方式是硬着头皮去写。
读文档的你是初级法师,读读就过去,谁都会,信心倍涨。
写程序是堆“乐高”,知道是这么回事,就是对着自己的数据写不出来,要不停摸索,能力有涨但是信心开始下降;
调程序的你是麻木的打字猴,不停地调试参数,删选阈值。怎么看自己写的都对,就是编译器不开眼;
程序正确了就是成长为kitten猫,真正能用自己的代码完成任务,并开始灵活地运用所学,开启成为大魔导的新征程。
这些过程没有捷径,但可以加速,就是我们的零基础Python编程班,应用Python处理生物信息数据和作图。
课程简介
一、准备工作1. 为什么是Python?2. 为什么不是Python?3. Python 2还是Python 3?4. 安装Anaconda5. 用什么编辑器编写Python程序6. 安装Jupyter Notebook7. Jupyter Notebook的使用
二、Python语言基础1. Python的基本元素:数字、字符串和变量2. Python容器:列表、元组、字典与集合3. Python的控制结构4. Python的模块、包和程序5. Python中的类和对象
三、Python基础实战1. 十五道精选练习题,在线答疑辅导。
四、Python科学计算和机器学习1. Python与科学计算:NumPy、SciPy、pandas、statsmodels2. Python与机器学习:scikit-learn、TensorFlow和Keras
五、Python绘图1. Python绘图:matplotlib、seaborn和Altair
六、 专属定制更多内容还有待解锁,可以留言想学的Python应用和作图。说不定下次课程介绍中就会出现您的专属定制。
主讲老师包括中科院微生物所、遗传发育所、基因组、生物物理所等多名本领域一线技术专家。
陈同,博士,2015毕业于中科院遗传与发育生物学研究所,生物信息专业,在Cell Stem Cell,NAR等高水平杂志以第一作者或主要作者发表文章,运营有数万关注度的《生信宝典》微信公众号。
Chen Tong*, Hao Ya-Juan*, Zhang Ying*, Li Miao-Miao*, Wang Meng, Han Weifang, Wu Yongsheng, Lv Ying, Hao Jie, Wang Libin, Li Ang, Yang Ying, Jin Kang-Xuan, Zhao Xu, Li Yuhuan, Ping Xiao-Li, Lai Wei-Yi, Wu Li-Gang, Jiang Guibin, Wang Hai-Lin, Sang Lisi, Wang Xiu-Jie, Yang Yun-Gui, and Zhou Qi. (2015) m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell 16, 289–301 (cover story)
Cui Yi*, Xiao Zhifeng*, Chen Tong*, Wei Jianshu, Chen Lei, Liu Lijun, Chen Bing, Wang Xiujie, Li Xiaoran, and Dai Jianwu. (2014) The miR-7 identified from collagen biomaterial based 3-D cultured cells regulates neural stem cell differentiation. Stem Cells and Development 23, 4: 393-405. (*co-first author)
Wu Hua-Jun*, Ma Ying-Ke*, Chen Tong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox. Nucleic Acids Research 40:W22-W28.
本课程以讲解流程和实际操作为主,采用独创四段式教学,封装好的代码全部分享,随处可用:
2020-02-21 到 2020-02-23 (线下讲解实战) 每天早9点到晚6点,半封闭式教学 (最后1小时为集中讨论时间,最后一天会稍微提前一些,多留出时间讨论,也方便老师乘车返回) 报到时间:开课当天
北京市西城区鼓楼附近(鼓楼地铁站周边1公里)。
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