Conda管理多个版本的R, python
Conda管理多个版本的R, python
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Conda是一个非常好用的工具，既可以管理packages，也可以管理和下载软件，还可以建立多个虚拟环境来独立运行多个版本的软件。conda分为anaconda和miniconda。anaconda是包含一些常用包,miniconda是精简版。做生信常常用的一些包只支持老版本的R，一些新开发的包又只支持最新的R，这里我们用conda建立多个版本的R环境。 conda的安装： 下载地址：https://www.anaconda.com/distribution/ https://docs.anaconda.com/anaconda/install/
查看是否安装conda，从终端输入
conda --version
#或者
which conda如果安装了的话，会显示现在所用的版本等信息，没有的话，可以下载安装，安装好了别忘记配置环境变量。
# 以anaconda3为例：
echo 'export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc环境创建：conda create -n new_env(环境名） 环境的查看：
conda env list如需要安装特定版本的软件:
conda install 软件名=版本号最新Python的安装：
conda create -n py37 python=3.7
#或者
conda create --name python37 python=3.7进入python 3.7 环境：
conda activate py37
#或者
source activate py37退出环境：
conda deactivate
#或者
source deactivate py37创建不同版本R环境：
conda create -n r36 r=3.6安装特定版本R
conda install -c r r=3.6
#或
conda install r=3.6conda来安装R的packages https://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/
conda install -c r r-dplyr查看已创建的环境：
conda info --envs
#或者
conda env list最后不需要的环境需要移除的话：
conda remove -n py27 --all复制一个环境：
conda create -n newenv --clone py27查看conda安装的包：
conda list删除已安装的软件或者包：
conda remove -n 环境名 软件名
#卸载指定软件:
conda remove 软件名更新某个软件:
conda update 软件名参考： https://www.jianshu.com/p/edaa744ea47d https://www.jianshu.com/p/2f3be7781451 https://www.jianshu.com/p/17288627b994 https://zhuanlan.zhihu.com/p/46902996 https://blog.csdn.net/ITLearnHall/article/details/81708148
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