R中的管道操作符%>%

生信编程日常

发布于 2020-04-01 15:55:14

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发布于 2020-04-01 15:55:14

管道是一种强大的工具，可以清楚地表示由多个操作组成的一个操作序列。管道%>% 来自于magrittr 包。因为tidyverse 中的包会自动加载%>%，所以一般我们不需要自己加载这个包。

library(magrittr)

有时候我们想实现某个功能，但是中间会有好几个步骤，产生不少无关变量。比如R数据科学中举的一个简单易懂的例子：

构建一个小兔子的对象：

foo_foo <- little_bunny()

兔子需要完成三个动作：

foo_foo_1 <- hop(foo_foo, through = forest)
foo_foo_2 <- scoop(foo_foo_1, up = field_mice)
foo_foo_3 <- bop(foo_foo_2, on = head)

在这个例子中，就产生了没有什么实际意义的中间变量，还必须用数字区分。这样很容易让人混淆，产生错误。

如果这样写：

foo_foo <- hop(foo_foo, through = forest)
foo_foo <- scoop(foo_foo, up = field_mice)
foo_foo <- bop(foo_foo, on = head)

每次都会覆盖掉以前的变量，但是这样如果出错，那么就必须重新跑。

有人可能也许会将函数组合起来：

bop(
scoop(
hop(foo_foo, through = forest),
up = field_mice
),
on = head
)

不过这样看起来真的累。

最后使用管道：

foo_foo %>%
hop(through = forest) %>%
scoop(up = field_mouse) %>%
bop(on = head)

管道对于一段比较短的线性操作序列是非常好使的，不过当步骤比较长（比如超过十个），或者有多个输入输出等时候，最好不要用管道。

举个简单小例子：

iris$Petal.Length %>%  `+` (10) %>% plot(col = 'steelblue', pch = 4)

取出来iris的Petal.Length一列，并+10，最后画图点图。

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