python中的模块与包

在python中，代码有以下两种组织形式

1. module， 模块
2. package，包

与perl语言不同，一个python脚本就是一个模块，而包则是多个模块组成的功能完善的整体。对于一个package而言，其文件结构示意如下

wes/
    __init__.py
    quality_control/
        __init__.py
        fastp.py
        cutadapt.py
    mapping/
        __init__.py
        bwa.py
        bowtie.py
    snp_calling/
        __init__.py
        gatk.py
        samtools.py

最外层是包的名称，内层的文件夹下是不同的子模块，为了区分普通的文件路径和python包，在每一层文件夹下都必须有一个名称为__init__.py文件，该文件用于定义模块初始化的一些属性，如果没有特殊要求，该文件内容为空即可。

模块到包的变化，只需要遵守特定的文件结构即可，而普通的python脚本作为一个模块来使用，则有一些注意事项。

模块从形式上看和普通的python脚本是一样的，也是由常量，函数，类，方法等定义构成，唯一不同的是，其函数执行的代码，需要防止在特定的地方。

模块在第一次导入时，会自动执行主程序中的内容，通常情况下，我们只需要使用模块中定义的方法，而不希望在导入模块时，就去执行其中的代码。通过__name__属性。可以实现模块导入时其主程序中的代码不执行，而单独运行该模块时，又可以执行主程序中的代码。实现的方式如下

if __name__ == '__main__':
    print('模块单独运行')
else:
    print('模块被导入')

当__name属性的值为__main__时，说明该模块作为一个脚本在单独运行，相反的，当值不为__main__时，说明该模块被导入，通过这个if判断，将对应的代码放置在不同的分支中，就可以将两种情况下需要执行的代码区分开，这也是为何python脚本推荐写成上述标准格式的原因。

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