「R」R 基础语法与获取帮助

本文汇总之前两篇关于 R 基础知识的笔记以及获取 R 帮助文件的记录。

R 基础语法

就像学习一门外语，如果你想要学好，必须掌握语义、语法：单词、连词、句子结构等等。学习一本编程语言也基本一样，我们如果想要高效地编程 R，必然要学好 R 的语言的语义和语法。

阅读下面两篇笔记快速浏览和学习 R 基础知识：

• R 基础 - https://nbviewer.jupyter.org/github/ShixiangWang/masterR/blob/master/archive/R_notebook3.ipynb
• R 语法 - https://nbviewer.jupyter.org/github/ShixiangWang/masterR/blob/master/archive/R_notebook4.ipynb

获取帮助

学习是一个持续的过程，没有谁可以记住所有的包、所有的函数、一个复杂函数所有的参数说明。编程正确的打开方式是在实战中学习，在帮助文档中摸索。

• 如果要获取关于某个函数的帮助信息，例如glm，输入： > help(glm) 或者 > ?glm
• 如果想要搜索关于某个操作符的帮助信息，需要用使用反引号(`)括起来： > ?`+`
• 如果想要尝试帮助文件中的例子，可以使用example函数来自动运行它们。比如使用glm，输入 > example(glm)
• 可以根据某个主题进行搜索，例如"regression"（回归），使用help.search函数： help.search("regression") 如果你不记得函数的名称，这个功能将会非常有用。R会返回所有相关主题的列表。它还有一个快捷方式： > ?? regression
• 有时我们可以用上面的方法获取关于包的帮助文档，其实也可以使用library函数的help选项来获取更完整的信息。比如，如果我们想要得到grDevices包的帮助文档，可以使用： > library(help="grDevices")
• 有些函数（尤其是Bioconductor中的函数）会包含至少一个指南文档（vignette）。这是一种简短的介绍性文档，通常会包含具体的例子。可以使用vignette命令来查看指南文档。比如，查看affy包的指南文档： > vignette("affy") 想要查看已加载的所有包中的指南文档，可以使用下面命令： > vignette(all=FALSE) 想要查看已安装的所有包的指南文档，使用： > vignette(all=TRUE)

最后介绍一下在实战中如何去搜索和学习一个 R 包：

1. 打开浏览器，使用你自己最喜欢的搜索引擎
2. 使用 CRAN 包名（优先）或Bioconductor 包名 的方式搜索一个包，如CRAN UCSCXenaTools，一般会看到类似下图的信息：

1. 维护者一栏有名字和邮箱，有问题尽管发邮件咨询
2. BugReports 有报告 Bug 的地址，有问题就点击
3. URL 指定了包的官方网站，如果想要深入了解一个包，应该深入看看
4. Vignettes 是指南文档，一般是网页或 PDF 文件，如果你想要把一个包应用到自己工作中，这些文档尽量都阅读一下