王诗翔呀

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PicGo + Gitee 构建免费云图床

PicGo 下载链接:https://github.com/Molunerfinn/PicGo/releases/

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「Docker」使用 Docker run 覆盖 ENTRYPOINT

原文:https://phoenixnap.com/kb/docker-run-override-entrypoint

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「Workshop」第十一期:降维

前言:主要是从理解降维和用R实现降维这两个层面上来阐述,具体的算法还需要感兴趣的小伙伴另外了解。

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「R」R Docker 教程(续)

前面我们学习了一个可以在 Docker 中运行 RStudio 的基础镜像,学习如何使用 docker commit 修改镜像的内容。这是一个非常棒的技术,它让...

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「Workshop」第十期:聚类

聚类分析的思想:对于有p个变量的数据集来说,每个观测值都是p维空间中的一个点,所以属于同一类的点在空间中的距离应该显著小于属于不同类的点之间的距离

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「R」R Docker 教程

这是专门为具有 R 和 RStudio 知识的朋友设计的 Docker 教程。该介绍旨在帮助需要 Docker 进行项目的人们。我们首先解释 Docker 是什...

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「R」Obtain RNAseq Values for a Specific Gene in Xena Database

写这篇文档的原因是有使用者问我如何获取单个基因的表达值,这个操作我其实在很久之前的生存分析示例文档中介绍过,但用户有所疑惑,说明我写的不清楚或者无法找到,所以针...

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「R」UCSCXenaShiny:基于 R 的 Xena 数据库交互应用

项目地址:https://github.com/openbiox/UCSCXenaShiny[1]

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Nature: 泛癌突变特征,错过了TCGA但别错过它!

大家好,今天跟大家分享的是2020年发表在Nature(IF:43.07)杂志上的一篇文章:The repertoire of mutational signa...

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广义线性模型应用举例之泊松回归及R计算

在前文“广义线性模型”中,提到广义线性模型(GLM)可概括为服务于一组来自指数分布族的响应变量的模型框架,正态分布、指数分布、伽马分布、卡方分布、贝塔分布、伯努...

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使用 GitHub README profile 展示更多信息

近期,GitHub 上线了 GitHub README profile 的功能,于是我的首页多了一些 GitHub 的代码信息。

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自动镜像你的 GitHub 仓库

接下来的内容告诉你如何配置,让 GitHub 的 workflow 帮你定时自动同步代码到 Gitee。

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「Workshop」第七期:Snakemake 介绍

snakemake由不同的rule组成,每一个rule执行一个任务,通过不同的rule串联完成流程,snakemake还支持断点重启。

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数据科学31 |机器学习-模型评价

在二元预测中,通常会估计样本出现其中一种结局(如阳性)的概率,需要找到一个常数,即阈值(threshold)或门槛值(cutoff value),若概率值大于阈...

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「R」Robust Rank Aggregation 算法介绍

那么要怎么根据手上的三组数据来获得一个相对可靠的排名来进一步确定要研究的对象呢?排名整合就可以帮助处理这种问题。

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「R」对象的名字与值——存储机制图解

将c(1, 2, 3)赋值给变量x时,实际上是将数值向量绑定到x上的过程,变量x称为引用。

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「R」对象大小——R存储真的会占很大空间吗?

在上一篇文章中介绍过列表存储的不是实际的值,而是指向值的引用,所以一个列表的大小比我们预期的可能要小的多。

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【流程】使用limma、Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌

简单且高效地分析RNA测序数据的能力是Bioconductor的核心优势。RNA-seq分析通常从基因水平的序列计数开始,涉及到数据预处理,探索性数据分析,差异...

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新版本,ggplot2 v3.3.0 新特性来袭

2. 新的 scale ‘bin',它可以像使用 color, fill 一样使用。这个是全新的,接受起来需要点时间。但它带来了绘图的更多可能。

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ggplot2 案例:使用 ggplot2 绘制绘制一幅气泡地图展示各国疫情状况

新冠肺炎确诊患者们都分布在那里呢?约翰·霍普金斯大学提供了一份数据集,使用这份数据集我们可以绘制一幅气泡地图展示这些确诊患者的分布,代码比较简单:

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