离线环境下使用Conda安装软件

之前，小编教过大家使用Conda轻松安装生信工具，但有时候公共服务器由于安全原因是不能连接外网的，无法使用Conda在线安装软件，今天小编就教大家在离线环境下使用Conda安装软件。

由于服务器是公共的，所以我们在安装Conda时要注意不要将Conda添加至环境变量，以免引起服务器中某些工具无法使用。

## 安装Conda
sh Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

根据指示按回车键和输入"yes"。

出现上面界面时，可以自定义Conda的安装路径，如不输入则默认安装在home目录下。

出现上面界面时，输入"no"，完成安装。

进入Conda安装目录，激活Conda环境。

## 进入Conda安装目录
cd ./miniconda2/bin
## 激活Conda环境
source ./activate

之后我们可以在bioconda上搜索我们想安装的软件，如"rmats"。

选择需要的版本下载。

下载好后将文件传至服务器，输入下面的命令离线安装。

## 离线环境安装软件
conda install --offline -f rmats-4.0.2-py27hd8e4039_4.tar.bz2

执行完后软件就安装好啦！

## 查看安装好的软件
cd ./miniconda2/pkgs/rmats-4.0.2-py27hd8e4039_4/bin

参考资料：

https://www.zhihu.com/question/45987778