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R语言作图——Line plot with error

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一只羊
发布2020-09-02 10:33:16
4320
发布2020-09-02 10:33:16
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文章被收录于专栏:生信了生信了

原创:黄小仙

为了画今天的这个图,小仙决定凭空想象一台可以实时监控基因表达水平的设备,成功得到了这么一组数据。

想要画的图是这样子滴。

Step1. 绘图数据的准备

首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式。

Step2. 绘图数据的读取

代码语言:javascript
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data<-read.csv(“your file path”, header = T)
#注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用header=F

Step3. 绘图所需package的安装、调用

代码语言:javascript
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library(ggplot2)                
# 注释:package使用之前需要调用

Step4. 绘图

代码语言:javascript
复制
ggplot(data,aes(x=Time, y=Expression,linetype=type)) +
  geom_line() +
  geom_ribbon(aes(ymin= Expression.min,ymax=Expression.max,fill=type),alpha=0.5)+
  xlab("Time") +
  ylab("Expression") +
  ylim(0.8,1.1)

简单画出曲线直接用

代码语言:javascript
复制
ggplot(data,aes(x=Time, y=Expression,linetype=type)) +
  geom_line()

今天画的图也比较简单,小仙就多啰嗦几句。有段时间小仙觉得R语言作图这个系列差不多要结束了,因为常见的图表都快画了一遍了,有点江郎才尽的感觉,不知道接下来还能画什么。好在经过一段时间的学习之后,又有了新的感悟,突然又觉得图是画不完的,即使是line plot也有好多花样。目前基本的图形小仙都能画出来,但距离随心所欲画出想要的效果,还是差十万八千里呐。学无止境,大家都加油呀!

(公众号:生信了)

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原始发表:2020-08-31,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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