R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子
之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现，下面的B图是折线图加柱形图，相对比较容易实现，上面的A图稍微有点复杂，我想到的办法是拼图，图A可以看成三个热图，然后加一个堆积柱形图，最后将四个图组合到一起。那就按照这个思路试一下看能不能实现。
首先画热图
这个热图和常规的还稍微有点不太一样，可以简单的理解为带有缺失值的热图，缺失值是空白格，其他值分别填充颜色。
那我们就按照这个思路来构造数据
将数据集按照以上格式整理好，存储在csv文件中。
首先是读入数据
df<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap.csv",header=T)以上数据是宽格式，借助reshape2这个包中的melt函数将宽格式转变为长格式
df1<-reshape2::melt(df)ggplot2画热图
library(ggplot2)
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value),color="black")+
theme(panel.background = element_blank())
这个地方遇到一个问题是缺失值如何给他填充为白色，我想到的办法是给缺失值赋值为0，然后将0,1,2,3离散化处理，然后分别分配颜色
df1$value1<-ifelse(is.na(df1$value),0,df1$value)
df1$value1<-as.factor(df1$value1)
summary(df1)
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","red","red2","red4"))+
theme(panel.background = element_blank())
这样是不是和文章开头提到的图有点像了。
接下来是美化
调整一下y轴的的顺序
df1$A<-factor(df1$A,levels = rev(df$A))
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","red","red2","red4"))+
theme(panel.background = element_blank())
将X轴放到顶部
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","orangered","red2","red4"))+
scale_x_discrete(position = "top")+
theme(panel.background = element_blank(),
axis.title = element_blank(),
axis.ticks = element_blank(),
axis.text.x.top = element_text(angle = 90,
hjust = 0,
vjust= 0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5),
legend.position = "none")+
labs(title = "Plant growth and development")
标题的下滑线如何用代码添加我暂时还不知道，直接出图后手动编辑吧。上面的图还忘记添加文字标签了，下面补上
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","orangered","red2","red4"))+
scale_x_discrete(position = "top")+
theme(panel.background = element_blank(),
axis.title = element_blank(),
axis.ticks = element_blank(),
axis.text.x.top = element_text(angle = 90,
hjust = 0,
vjust= 0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5),
legend.position = "none")+
labs(title = "Plant growth and development")+
geom_text(aes(label=value1,color=value1))+
scale_color_manual(values = c("white","black","black","black"))
好了，今天的内容就介绍到这里了，下一期推文介绍利用堆积柱形图给热图添加分组信息。如果需要本文的示例数据，直接在文末留言就好了
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原始发表：2020-12-29，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
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