R语言实现评估随机森林模型以及重要预测变量的显著性

说到随机森林（random forest，RF），想必很多同学都不陌生了，毕竟这些机器学习方法目前非常流（fàn）行（làn）……白鱼同学也曾分别分享过“随机森...

R语言randomForest包的随机森林分类模型以及对重要变量的选择

随机森林（random forest）是一种组成式的有监督学习方法，可视为决策树的扩展。

R语言ggplot2画一幅漂亮的哑铃图

https://ikashnitsky.github.io/2019/dotplot/

R语言ggplot2堆积柱形图添加误差线的简单小例子

R语言单、双因素方差分析及结果可视化的简单小例子

这里用到的是R语言的内置数据集sample_n_by()函数很有用，能够分组随机抽样%>% 是管道符 是将前面的结果传输给后面的函数

R语言ggplot2绘图时如何在图形中使用数学表达式作为标注文本

符号类表达式需要额外使用symbols()函数进行转换，如expression(symbol("\042"))。

R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

如果是要更改x轴左右的间距把scale_y_discrete()换成scale_x_discrete()就可以了

跟着Gut学画图：R语言ggtree包画弦图的简单小例子

今天的推文内容是模仿论文 Aberrant gut microbiota alters host metabolome and impacts renal fa...

bioconvert计算测序覆盖度并使用R语言ggplot2画折线图进行可视化展示

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/FN433596

踩坑日志 | kingfisher 公共测序数据 SRA/Fastq 下载神器！

前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher，一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具。我非常感兴趣，但也确实没时间折腾，于是继续丢给师弟去看...

bioconvert：各种各样的生物信息数据格式转换工具

内容主要来自 https://bioconvert.readthedocs.io/en/master/tutorial.html

R语言ggtree画聚类树图的时候的报错和解决办法

之前录制了一起视频介绍了使用R语言的ggtree包可视化展示层次聚类分析结果的视频

文献分享|代谢组学分析揭示了新冠肺炎的阶段性特征

代谢组学是直接研究生物体受基因和蛋白调控的所有代谢物的变化规律和功能的科学，是探究生物现象结果的科学，代谢组学 研究一方面可以发掘一些新的分子标志物，另一方面通...

R语言ggplot2气泡图叠加图片的简单小例子

之前有人在公众号留言问这幅图的实现办法，这个是气泡图，用ggplot2很方便能够实现，但是这个图比较特殊的是横坐标还有对应的图片，当然出图以后用其他软件来编辑是...

R语言ggplot2作图的时候给坐标轴添加文本π

今天用ggplot2作图y轴的标题想实现上图红框里的形式，查了一下如何实现 记录一下代码

R语言计算两组数据变量之间的相关系数和P值的简单小例子~应用于lncRNA的trans-act

比如 Horticulture Research 中的论文 Comparative analysis of long noncoding RNAs in ang...

R语言ggplot2绘制平滑曲线的折线图简单小例子

帮助文档 https://github.com/davidsjoberg/ggbump

R语言ggplot2绘制带有底纹的柱形图~patternplot扩展包

第一次使用这个包需要安装，直接运行install.packages("patternplot")命令进行安装

使用R语言的export包的时候遇到的报错和解决办法

我想把ggplot2做的图片直接保存成ppt，想到了之前的推文 《我不会用illustrator，只会用ppt！》 这里用到的是 export 包

R语言ggtree画圆形树的时候增加中心的空白区域

https://stackoverflow.com/questions/36000716/ggtree-change-radius-scale！