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生信工具 | 化合物靶点预测工具(1)——SwissTargetPrediction

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DoubleHelix
发布2021-07-19 10:31:28
发布2021-07-19 10:31:28
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文章被收录于专栏:生物信息云生物信息云

今天给大家介绍一个用于预测化合物靶点的工具SwissTargetPrediction

这个网站允许你估计一个小分子最可能的大分子目标。该预测是建立在结合二维和三维相似性的基础上的。

地址:http://swisstargetprediction.ch/

该工具只需要提供分子的SMILES点提交就可以啦,当然,或在右侧窗口中自己画出化合物的结构,很简单,有3个物种可供选择。

提交后需要等待2分钟,结果页面首页是对预测靶点分类的扇形图。

下面就是靶点的详细列表。可以通过show来选择每页展示的个数。


参考文献:

【1】SwissTargetPrediction: updated data and new features for efficient prediction of protein targets of small molecules, Nucl. Acids Res. (2019).

【2】For technical information about the prediction algorithm, you can refer to: Shaping the interaction landscape of bioactive molecules, Bioinformatics (2013) 29:3073-3079.

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2021-07-07,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
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