翻译:BioIT 爱好者(部分内容有调整) 原文:The top 10 R errors, the 7th one will surprise you
就像你学习走路时遇到了一些问题,你在学习 R 的过程中可能也会遇到一些错误。本文章的目标是对学习 R 时最常见的一些错误进行整理,并一一的去解释它们,以便您了解如何解决这些问题。
面对问题,最重要的建议是:“阅读错误信息”。有些错误信息通常不是很清楚,R 并不是真的很擅长表达它们,但是答案通常就在您的面前。一旦您敢于阅读错误信息,我们将帮助您阅读这些错误信息!
这是一个经典错误,可能发生在%>%
或任何其他函数中。
有两种情况会导致出现这样的错误:
CASE 1 : 您拼写错了该函数的名称:
> rnom(1) # instead rnorm(1)
Error: could not find function "rnom"
Correction : 该如何解决?通过纠正拼写错误。
> rnorm(1)
[1] -0.7503872
CASE 2 : 或者(在大多数情况下)您忘记了加载包含该函数的软件包。
> iris %>% select(Species)
Error in iris %>% select(Species) : could not find function "%>%"
Correction :
不要忘记在你的脚本和 Rmd 开头安装并启动library(tidyverse)
和其他的library(whatever)
。
library(dplyr)
iris %>% select(Species)
错误代码:
library(dplyr)
iris
%>% select(Species)
## Error: unexpected SPECIAL in %>%
## 2: iris
## 3: %>%
## ^
您将换行符放错了位置。
Correction :
%>%
绝对不能在代码行的开头,您需要在%>%
之后而不是之前进行换行。
library(dplyr)
iris %>%
select(Species)
错误代码:
if ( 1 != 1 ) {print("youpi")}
else { print("coucou")}
## Error: unexpected 'else' in "else"
## 1: if ( 1 != 1 ) {print("youpi")}
## 2: else
## ^
这与第二个错误的问题是一样的。您将换行符放错了位置。
Correction :
你需要检查else
是否与前一行正确关联。
R 一次解释一行代码,所以当if
没有关联的else
代码时,要让你的代码起作用,请确保 R 知道您的指令已完成。
if ( 1 != 1 ) {print("youpi")
} else { print("coucou")}
错误代码:
library(dplyr)
dataset %>% select(Species)
## Error in eval(lhs, parent, parent) : object 'dataset' not found
您正在处理的对象不存在。
Correction :
拼写错误?或你需要确保你在这之前已经启动并分配了该对象。
错误代码:
> library(diplyr)
Error in library(diplyr) : there is no package called ‘diplyr’
出现这样的错误有两种可能:
CASE 1 : 您拼错了库的名字。
Correction :
library(dplyr)
CASE 2 : 该软件包尚未安装。
Correction :
在终端中启动install.packages("dplyr")
将解决此问题。
错误代码:
> df + 1
## Error in df + 1 : non-numeric argument to binary operato
这样的报错可能会让人很困惑。
Correction : 确保您的算术运算有意义,并且应用在了正确的对象上。确保该对象包含您期望包含的对象。
在上面的示例中,df
是一个函数,而不是数字,从而导致错误。
错误代码:
library(dplyr)
iris %>% filter(Species = "setosa")
## Error: Problem with `filter()` input `..1`.
## x Input `..1` is named.
## i This usually means that you've used `=` instead of `==`.
## i Did you mean `Species == "setosa"`?
在错误消息中包含解决方案。
Correction :
在错误消息中已经给出了如何校正的方法。您只输入了一个=
,但条件必须用==
编写。
library(dplyr)
iris %>% filter(Species == "setosa")
错误代码:
library(dplyr)
iris %>% filter(Species == "setosa"
iris %>% filter(Species == "setosa")
## Error: <text>:3:1: unexpected symbol
## 2: iris %>% filter(Species == "setosa"
## 3: iris
## ^
当您发送未完成的行,而您忘记了右括号,大括号或引号时,通常会出现此错误消息。在这种情况下,R 一直等到您的指令结束。但是,您不仅要发送丢失的括号(或括号/引号),而且要再次发送整个指令。Rmd 更加棘手,因为您没办法通过查看终端来检查确实已经发送给 R 的内容。
Correction : 已经修复了!现在,您已收到 R 发送的一条错误消息,重新启动您的指令,即可成功执行。
见下文。
错误代码:
library(shiny)
ui <- fluidPage(
actionButton("go","go")
)
server <- function(input, output, session) {
res <- input$go
}
shinyApp(ui, server)
您使用 Shiny 并尝试在observe()
,observEvent()
,reactive()
,render()
之外使用input$
。只是这有点不可能。别担心,在您犯错之前,确实也已经有人遇到过同类的错误!
Correction :
您可以在代码周围放置一个observe()
。
但是,求求您!不应在您的 shiny 应用程序中同时使用observe()
和reactive()
(有时间的话我们将讨论这个问题..),因此,请尝试寻找更好的解决方案……:)
library(shiny)
ui <- fluidPage(
actionButton("go","go")
)
server <- function(input, output, session) {
r <- reactiveValues(x=NULL)
observeEvent( TRUE ,once = TRUE, {
r$x <- input$go
})
}
shinyApp(ui, server)
如果你还有其他烦人的经常性错误要分享,请在评论中写下它,一起分享交流!