『热门研究与论文发表系列研讨会』<第六期>回顾：Genome Biology + 微生物组学研究

2022『热门研究与论文发表系列研讨会』开讲啦!

6月1日 <第6讲>上线

Genome Biology

主题

Genome Biology 助您传播科研硕果

嘉宾

佘文静 ，Genome Biology 编辑。

现场Q&A

Q：已撰写完成一篇论文，在挑选期刊时有什么注意项和技巧？

A：首先需要评估一下研究的新颖性，对于创新性较高的研究建议选择领域内顶尖期刊；另外也建议大家了解研究领域内大家较为关注的期刊及其读者群，相比影响因子选择与研究内容匹配的期刊更为重要。此外，投稿开放获取还是传统订阅的期刊也是值得考虑的点。

Q：OA和非OA的具体区别有哪些？投稿前可以在哪里看到是否为OA期刊？

A：期刊官网都会明确标识是否为OA。OA和非OA的明显区别在于：所有读者都可以免费获取OA期刊的内容而不需要付订阅费，OA期刊的读者群要远大于非OA期刊。

Q：GB的稿件格式是不是比较自由？有什么特别要注意的地方？

A：我们接受的稿件格式在投稿以及审稿过程中相对来很灵活，甚至可以从biorxiv上直接转到genome biology, 而不需要重新上传文件。需要注意的是要保证图片分辨率，测序的数据审稿人能够看到。但是在发表时，我们对格式是有要求的，相关的格式在网站主页的submission guidelines里面对于所有文章类型的格式都介绍得非常清楚。其中很重要的是，对于文章中的scripts, code, 以及测序产生的数据要储存在推荐的数据库，查阅这些数据的相关信息需要在Availability of data and materials部分写明，并能让大家在accept的时候可以查阅到。还有一点就是图片除了要清晰外，红绿部分要能保证所有人都能分辨，没有困扰。

微生物组研究

主题

微生物组数据分析方法与期刊发展概述

嘉宾

刘永鑫，中科院遗传发育所高级工程师。

现场Q&A

Q：宏基因组研究的主要手段有哪些？有好用的数据库推荐？

A：扩增子是宏基因组研究最为广泛的手段，其主要研究物种多样性，一般用于小项目或大项目的前期初筛；目前最为主流的还是宏基因组测序即Shotgun metagenomics，其获取的全基因组碎片既可以分析物种信息也可以分析基因功能信息。

宏基因组的数据库目前还处于百废待兴的阶段，目前只有典型的微生物组模式物种有相关的基因组级别的参考数据，绝大多数的研究对象是没有数据信息的，由于微生物组具有可变性，随着样本数量及地区分布都会不同，对于微生物组的探索永无止境，随着技术和样本数量的增加，相关数据库也将不断增长。

Q：iMeta杂志的投稿有什么要求吗？iMeta的影响因子大概啥时候可以出来呢？

A：iMeta收稿的类型较多，目前主要考虑研究的影响力。关于研究类的文章我们期望其在未来1年里有6次的引用量；综述一般以约稿为主，要求10~15分的水平；软件、方法、数据库期望15~30分的水平。iMeta的影响因子预估的年底就会有，正式的要2年，24年才能公布。

Q：宏基因测序得到的相对丰度怎么转化为绝对丰度呢？

A：这个测序手段无法获得，目前我们组学研究得到的数据都是相对丰度，没有绝对丰度。