加载R包org.Hs.eg.db出错，避坑指南！
加载R包org.Hs.eg.db出错，避坑指南！
生信交流平台
发布于 2022-09-21 16:49:03
发布于 2022-09-21 16:49:03
前面我们讲到的GO和KEGG富集分析都会用到org.Hs.eg.db这个包
org.Hs.eg.db这个包还可以用来做基因ID转换
但是今天加载这个包的时候莫名奇妙的报错了，小编很方
library(org.Hs.eg.db)
Error: package or namespace load failed for ‘org.Hs.eg.db’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'org.Hs.eg.db', details:
call: l$contains
error: $ operator is invalid for atomic vectors网上查找了一下，发现居然有很多人都遇到过同样的问题。今天小编就把网上找到的解决方法共享给大家，希望大家以后能少踩点坑。
第一种方法
#手动设置环境变量
options(connectionObserver = NULL)
但是这种方法，每次都要运行这一行
第二种方法，彻底解决这个问题
#安装旧版本RSQLite
install.packages("remotes")
remotes::install_version("RSQLite", "2.2.5")装好之后，就再也不用运行options(connectionObserver = NULL)，跟以前一样的顺滑。
本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划，分享自微信公众号。
原始发表：2021-06-27，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
评论
登录后参与评论
推荐阅读