学习
实践
活动
工具
TVP
写文章

生信交流平台

LV1
举报
发表了文章

如何从TCGA数据库下载DNA甲基化数据

前面给大家介绍了新版的TCGA数据库,通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据,miRNAseq数据以及体细胞突变数据

生信交流平台
数据库SQLTypeScript
发表了文章

R官方整理的学习小抄—R cheatsheets

不知道,大家读书的时候有没有做过小抄(cheatsheets)。小编在读书的时候是做过的,当然不是为了带进考场作弊,而是为了整理考点,方便记忆。今天小编...

生信交流平台
R 语言机器学习神经网络深度学习AI 人工智能
发表了文章

RStudio 改名 Posit,为了体现对 Python 和 VS code 社区的支持

7月27日,RStudio宣布将RStudio更名为Posit,同时还表示,他们并没有放弃R,而是寻求扩展他们的开源模型。

生信交流平台
Python开源
发表了文章

maftools包分析突变数据,绘制瀑布图

今天我们来讲讲,怎么用R的maftools包来分析MAF格式的突变数据,并用瀑布图来展示结果。maftools这个包的主要分为两部分功能,分析和可视化。下图列出...

生信交流平台
数据库SQL腾讯云开发者社区
发表了文章

MAF格式(mutation annotation format)

Mutation Annotation Format, 简称MAF, 是由TCGA制定的一种文件格式,用来存储突变注释信息。

生信交流平台
发表了文章

如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somatic mutation)

前面给大家介绍了新版的TCGA数据库,通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据和miRNAseq数据

生信交流平台
TypeScript数据库SQL
发表了文章

基因突变类型

突变是指发生在遗传物质上的变异。广义上突变可以分为两类:染色体变异(chromosome aberration),即染色体数目和结构的改变;基因突变(genem...

生信交流平台
数据分析
发表了文章

科研新热点——血管生成相关基因

前面小编给大家分享了几个科研中经常用到的基因集,以及如何使用这些基因集进行相关分析。

生信交流平台
腾讯云开发者社区
发表了文章

血管生成的机制

营养物质、氧气、代谢物、化学介质和代谢废物可以通过细胞之间的血管运输,以维持免疫系统、体温和PH值的动态平衡。血管在胚胎发育、身体生长和伤口愈合中起着重...

生信交流平台
发表了文章

聊个天就把生信分析做了!!!

2020年9月24日看到美国MD安德森癌症研究中心梁晗老师实验室发表在Cencer Cell的Next-generation Analytics for Omi...

生信交流平台
httpsHTTPPython网络安全自然语言
发表了文章

6分+单基因结合免疫发文思路,你值得拥有!

大家好!今天给大家介绍一篇2022年2月发表在Cancer Science(IF:6.518)上的一篇文章。作者对GEO和TCGA数据集进行分析鉴定到CENPF...

生信交流平台
发表了文章

Rstudio关联本地不同版本的R

前面提到过Rstudio是一个很好的R集成开发环境,但实际上Rstudio本身是没有太多功能的,它只提供一个可视化的环境,实际上背后还是要调用你本地装的...

生信交流平台
发表了文章

细胞焦亡结合免疫发7分+2区SCI

今天给大家介绍一篇2022年4月发表在frontiers in Immunology(7.561)上的一篇文章。作者基于TCGA数据集构建细胞焦亡相关的预后模型...

生信交流平台
数据分析
发表了文章

铁死亡相关基因集

铁死亡(Ferroptosis)最早由哥伦比亚大学Dr. Brent R.Stockwell在2012年提出,是一种铁依赖性的,区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自...

生信交流平台
数据库SQL腾讯云开发者社区
发表了文章

利用转录组数据构建预后模型的8分+发文技巧

大家好!今天给大家介绍一篇2022年4月发表在eBioMedicine(IF:8.143)上的一篇文章。作者基于LGG患者的转录组数据构建可以准确预测患者预后的...

生信交流平台
JavaScript
发表了文章

KEGG富集分析一直报错,粉丝拯救了我!

最近小编在用R的clusterProfiler这个包进行KEGG富集分析的时候,遇到了下面这个错误

生信交流平台
GoR 语言
发表了文章

刷屏的铜死亡Science文章,还真的“图片重复”了

当时,处于好奇,我用免费的Figcheck图片查重平台查了下,竟然发现Fig.4c中的两图高度相似。

生信交流平台
发表了文章

【R】蜜蜂图beeswarm-颜色

今天我们来看看beeswarm的具体细节,以及怎么设置颜色。我们用beeswarm自带的乳腺癌数据为例。数据的具体格式如下

生信交流平台
发表了文章

癌症体细胞突变AI注释平台—CancerVar

美国费城儿童医院王凯团队、周筠筠团队及合作者联合在Science Advances发表了题为“CancerVar: An artificial intellig...

生信交流平台
深度学习
发表了文章

【R】蜜蜂图beeswarm

蜜蜂图或蜂群图(beeswarm)这个名字,大家可能比较陌生,但是大家肯定都见过他的尊容。下面这张图就是一个典型的蜜蜂图。因为看上去像一群飞舞的蜜蜂而得名。

生信交流平台

个人简介

个人成就

扫码关注腾讯云开发者

领取腾讯云代金券