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🤩 autoReg | 自带统计值的table1(一)

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生信漫卷
发布2022-10-31 17:11:51
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发布2022-10-31 17:11:51
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文章被收录于专栏:R语言及实用科研软件

1写在前面

之前介绍的table1包输出的表格十分精美,但美中不足的是没有统计值,我们还需要自己编写函数,进行统计值的计算。

本期介绍一个git上的神包,autoReg完美完成你的table1

应用场景:年龄、性别、体重、身高、危险因素、预后因素等连续变量分类变量的描述统计。

2用到的包

代码语言:javascript
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rm(list = ls())
#devtools::install_github("cardiomoon/autoReg")
library(autoReg)
library(tidyverse)

3示例数据

本期使用示例数据为moonBook包中的acs数据。

代码语言:javascript
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library(moonBook) 
dat <- acs

4基线描述

这里使用gaze函数就可以完成啦。🥰

当然你也可以用之前我们介绍的table1包进行基线描述,具体大家公众号内点击往期精彩吧。 输出结果至wordppt的话,这里我们使用rrtable包吧。

4.1 查看变量类型

我们先看一下变量的类型吧,字符型变量和数字型变量。

代码语言:javascript
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str(dat)

4.2 简单分组

这里我们按sex的不同进行分组。

Note! 大家如果要设置变量出现的先后顺序,建议大家一开始就转换为factor,并设置levels

代码语言:javascript
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baseline <- gaze(sex~.,data=dat) %>% 
  myft()

baseline

library(rrtable)
table2docx(baseline)

4.3 复杂分组

我们再加一个分组变量Dx,看一下结果吧。

代码语言:javascript
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gaze(sex+Dx~.,data=dat) %>% 
myft()

4.4 变换分组变量顺序

Note! 这里再提醒大家一下,分组变量的先后顺序是有意义的,我们调换一下Dxsex的顺序吧。

代码语言:javascript
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gaze(Dx+sex~.,data=dat) %>% 
  myft()

最后祝大家早日不卷!~


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原始发表:2022-09-12,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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  • 1写在前面
  • 2用到的包
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  • 4基线描述
    • 4.1 查看变量类型
      • 4.2 简单分组
        • 4.3 复杂分组
          • 4.4 变换分组变量顺序
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