3-R包

1.R包的安装

>生信技能树

option是设置

>生信技能树

1.R包安装和使用的逻辑：安装包-加载包-使用包里的函数

2.用library()检查是否安装成功——唯一标准

3.已经安装的包用::快速调用里面的函数

4.常见疑问

1）没有error就忽略

2）package not available

包名写错；命令写错；R语言版本和包要求版本不同；包过时被剔除

3）是否更新：建议选n，除非一直报错；不想回答安装命令参数：update=F, ask=F

4）加载A包，报错B包不存在：缺啥补啥；当依赖包的版本不够高，更新包:重新安装或先删除后安装，更新所有包：update.packages()

5）网络问题 connection url 404

6）权限问题：管理员方式重新进入rstudio

7）？？？——中文用户名

5.分情况讨论

require（）返回TRUE（成功加载） 或者 FALSE（不成功加载）

6.R包如何使用-获取帮助

1) 快速查看函数帮助文档

?sd

2)找R包介绍页面

3）browsevignettes('') 在线教程

7.补充

常见的R语言符号

中括号前是数据框或者矩阵

两个中括号前是列表

library括号里的是包

文件名称出现在代码里，必然在实际参数的位置上带引号，且这个函数是能够识别文件的函数