生信马拉松 Day11 Linux纯新入门

今天的内容主要是Linux入门，比R确实复杂枯燥很多╮(╯﹏╰）╭，使用的软件是Terminus，优点是可以同时完成登录服务器和ftp上传

SSH：负责把命令传输到服务器上

SFTP:负责把文件传输到服务器上

通常我们使用服务器是命令行远程访问而不是桌面操作

Linux服务器的有点在于允许多用户同时访问

只要连上服务器，那么下载速度就是服务器自己的下载速度，而无关我和服务器的连接速度

登录服务器的两组方法：

1.命令行法： ssh 用户名@IP地址 [端口号]

每次登录得输入密码（不容易忘记密码）

2.填表法：填写IP地址、用户名和密码

Connection closed by foreign host.可能是瞬时网络异常，重新登录即可

退出登录：exit

Linux中空格是定性不是定量的，打几个没关系

文件管理或路径有关的符号

. 当前目录

.. 上一级目录

~ 家目录：每个用户的家目录都不同

/：只有当/在路径的最前面时才是根目录，其他位置的 / 都是目录层级分隔符，例如命令 cd /home里的/就是指根目录，什么都不写默认是当前目录

命令格式：命令+参数+文件

command [-options [parameter]] [FILE]

[]代表有时候可以省略

-options，有两种格式：-h,--help

参数可以连着写，顺序往往可以互换

10个文件夹命令：pwd（告诉你现在在哪儿，类似getwd()）,ls,cd

mkdir,touch

mv,rm,cp

tar

ln

ls “把文件列出来

-a 列出全部文件，连同隐藏文件 all

-l 列出详细信息 long

-h 将目录容量大小转化为人类易读的模式 human

-S 以文件大小进行排序 Size

-t 按时间排序 time

-r 逆序 reverse

ll -thr

ll是Linux自己的快捷键，相当于ls -la

ls ./*txt

当前目录下txt结尾的文件

*来自正则表达式，代表匹配任意多个字符（可以是0到正无穷个字符）

？匹配任何单个字符

cd：change directory

常见参数：没有

可以用tab键补全，tab键不能补全的可能是不存在

cd - 回到上一次

cd和cd ~都是回到家目录

绝对路径：从根目录开始引起的全路径

相对路径：就是相对于当前工作目录的路径

mkdir:make the directory

常见用法：mkdir [-p] 目录名

-p创建递归目录（凭空创建一级一级的内容）

tree 以树状展示文件结构，需要安装才有的命令，会一层层展开所有内容，按ctrl+C暂停，可能需要一段时间，因为显示有滞后性，可以多按几次

tree -L 参数 限定只看几级，例如 tree -L 2

touch 新建文件用，一般没有参数

例如 touch file1

实战中不太用

mv：move，移动或命名

mv 待移动的文件 移动到哪个目录

mv 待重命名的文件 重命名后的文件名

如果mv file2 file3 而file3这个文件已存在，那么会用file2覆盖file3，找不回来

rm:remove

常见参数-f ：force不显示警告讯息，-i在删除前会先询问用户，-r递归删除（就是删除文件夹，单独的rm只能+文件，删除单独的文件）

删除一定要谨慎，不可撤销，没有回收站撤回

cp：copy and paste

常见参数 -r（文件夹），copy过程中可以手动重命名

1.拷贝谁2.到哪里去

ln：link连接，节省内存，连接到文件，方便操作

软连接更常见，-s

用法 ln -s TARGET DIRECTORY（后一个directory是链接回来的地点，什么都不写默认是当前）

即便链接的是文件夹，删除的时候也不用-r

最好用绝对路径来写，相对路径有的时候会失效

tar压缩或解压

tar -zxvf 待解压的压缩包

f可以单独写在最后，因为f参数后面要跟文件

tar -zcvf 要创建的压缩包 压缩进的文件名

x和c参数代表是压缩还是解压缩

zip和unzip *zip文件

gzip和gunzip *gz文件

bzip2和bunzip2 *bz2文件

tar实际上是打包命令，把一堆文件或目录变成一个总的文件

压缩是把大的文件通过一些压缩算法变成一个小文件（gzip或bzip2或zip）

tar的优势是保留文件的结构

Tab 补齐：1.提高输入效率2.避免输入错误3.无法不全就说明不存在

当只有唯一候选的时候，按一下就能补全，而且还有多补的空格

文件不唯一，按两下会显示可选择的项

命令也可以tab补全

Ctrl+U：剪切光标位置到行首

Ctrl+C：终止任务

Ctrl+L 清屏

Ctrl+A 行首 Ctrl+E 行尾

Ctrl+w 以空格为关键词 一个一个删除

TIPS：

参数不用死记硬背，用多了就记得，记不得就--help或者chatgpt

双击选择一个单次，三击选中一行

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