

核心问题:人类基底神经节由功能多样的核团组成,但其细胞类型组成和空间组织尚未被全面解析。
核心资源:整合MERFISH+和Stereo-seq的多尺度、亚细胞分辨率空间转录组图谱,覆盖4名神经典型供体,约790万个细胞,解析60种转录 distinct 细胞类型。
图形摘要分为三部分:
本研究结合MERFISH+和Stereo-seq生成人类基底神经节的多尺度空间转录组图谱。它揭示了细胞群落组织、纹状体-基质结构的保守和物种特化特征,以及从亚细胞RNA定位推断的投射相关分子特征。
人类基底神经节由功能多样的核团组成,但其细胞类型组成和空间组织尚未被全面解析。
样本收集:
数据规模:
平台比较:

60种细胞类型:
SPN亚型:
混合身份SPN群体:
苍白球神经元群体:
非神经元群体:
星形胶质细胞异质性:
免疫相关胶质群体:


亚细胞转录分类:
体细胞大小估计:
免疫荧光验证:
投射推断:
正交验证:
总结:亚细胞转录定位不仅捕获分子身份和空间组织,还捕获神经元形态和投射相关分子特征,为连接人类基底神经节基因表达、细胞结构和推断环路组织提供框架。

细胞群落分析:
模块特征:
NAc区室组织:
跨物种比较:
纹状体-基质微域结构:
跨物种区室富集:
边界相关胶质群体:
星形胶质细胞梯度:


全转录组空间模块:
区域富集基因:
背外侧-腹内侧(DL-VM)轴梯度:
细胞贡献者:

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