我是imageJ新手,我正在尝试分析几个图像:我有一个代码,可以分析目录中一组图像的颜色阈值,并分别存储它们:
input = "/m_3/ImageJ/test_folder/";
output = "/m_3/ImageJ/finished2/";
function action(input, output, filename) {
open(input + filename);
run("Set Scale...", "distance=872 known=9 pixel=1 unit=cm");
run("Color Threshold...");
// Color Thresholder 1.48v
// Autogenerated macro, single images only!
.
.
.
// Colour Thresholding-------------
saveAs("Jpeg", output + filename);
close();
}
setBatchMode(true);
list = getFileList(input);
for (i = 0; i < list.length; i++)
action(input, output, list[i]);
setBatchMode(false);
现在我要计算新保存的图像的面积,这应该与函数度量一起工作。
run("Measure");
如何将计算存储在.xls或.csv -files中?是否也可以计算一个目录中所有文件的面积,并将结果存储在一个.xls或.csv -file中?
发布于 2015-05-15 11:48:27
请看斐济wiki上的解释如何将通用操作应用于完整目录。您可以按以下方式打开每个新保存的图像、设置阈值、度量和关闭每个图像:
open("/path/to/your/image.jpg");
setAutoThreshold("Default");
run("Measure");
close();
并将该代码粘贴到脚本编辑器的过程文件夹模板( IJ1 >IJ1宏> Process文件夹)中。
结果表之后可以通过file > Save保存为.xls文件。或者:
saveAs("Results", "/path/to/your/file.xls");
https://stackoverflow.com/questions/30259194
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