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育种数据分析之放飞自我
生物统计, 数量遗传学, GWAS, GS
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如何安装GWAS软件包：GAPIT
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现在R语言的版本是R4.2.1，这里介绍一下安装最新版的GAPIT如何安装，以及如何运行示例数据，运行处结果。安装前建议，第一电脑用户名需要是英文的，如果是中文的建议新建一个英文的用户名再安装，第二安装最新版的R4.2.1以及Rtoools软件（这个软件单独安装不是R包）。后面我列举了常见的安装错误以及解决方案。
邓飞
2022-12-13
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育种数据分析中的遗传相关及其显著性的计算
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html
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3. 软件实现遗传相关计算 3.1 数据格式 前三列是系谱，有3个性状： y1, y2, y3 , 想要计算y1和y3的遗传相关，并用LRT检验显著性
邓飞
2021-03-30
2.3K
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线性混合模型系列五：REML实战
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网站
宁超在他的公众号“Pythn与数量遗传学”的“方差组分估计之约束最大似然”文章中，给出了下面两种计算公式，公式一是直接似然函数（direct REML），公式二是间接的似然函数（MME based REML）。
邓飞
2019-12-05
2K
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如何检测遗传相关的显著性：LRT检验操作方法
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html
3. 软件实现遗传相关计算 3.1 数据格式 前三列是系谱，有3个性状： y1, y2, y3 , 想要计算y1和y3的遗传相关，并用LRT检验显著性
邓飞
2019-09-17
1.4K
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基因组选择分析软件调研
https
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网络安全
github
r 语言
目前, 基因组选择进入了一个高速发展的阶段, 各种新的算法和模型被提出。为了解相关软件应用的整体情况，也为选择合适的软件进行全基因组选择分析提供决策，这里对基因组选择的软件进行一个汇总。
邓飞
2019-06-13
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