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大家好,我是邓飞,今天给大家介绍一下一年多点的随机区组试验如何进行方差分析和多重比较,因为国家区试试验都是使用的一年多点随机区组的试验,这里介绍一下分析方法,并...
大家好,我是邓飞,今天发生了一个不可思议的事情,我就想了一下,然后试试,就搞定了。
做科研、写论文的宝子们谁懂啊!找文献、查引用量简直是家常便饭,但翻遍全网找方法,要么步骤繁琐,要么数据不准,纯纯浪费时间!今天直接给大家整理了3个超实用的文献引...
辛辛苦苦跑完一个混合模型,结果出来一堆显著,一顿汇报,领导一问: "这个品种的产量负值是怎么回事?"
看着那几百行"结构一塌糊涂"的脚本——复制粘贴一大坨、参数手工改、没有循环没有函数、四处都是硬编码——我眉头一皱, 知道自己水平差,没想到这么差。
openclaw之前安装了一下,前一段时间windows安装的是Oneclaw,这是一个openclaw打包版,安装很方便(我用"小龙虾"打开了电脑,还写了一篇...
大家好,我是邓飞,人类中多基因得分(PGS)这个方法,相当于动植物中的分子标记辅助(MAS)或者是基因组选择(GS)。虽然概念有所区分,但是理论都是相通的。下面...
孟德尔抽样误差(Mendelian sampling error)是指个体育种值与父母平均育种值的离差,用数学表达为:
大家好,我是邓飞,今天重新发一下之前写的TASSEL做GWAS分析的教程,前几天有幸和TASSEL和GAPIT软件包的作者张志武老师做了一个腾讯会议的视频沟通,...
大家好,我是邓飞,今天介绍一下,知道群体的单倍型数据,知道群体的表型数据,如何计算单倍型和表型数据的显著性分析,以及做一个小提琴图?
围棋作为最后被计算机攻克的棋牌类游戏,它的复杂度相对于其它游戏遥遥领先,之前没有接触过,一直感觉到高深莫测,也没有机会学习,这次入门围棋让我想到了很多,写篇博客...
跑GWAS项目,几百个样本,几万个位点,rMVP、GAPIT都可以用,如果是几千万个位点,几千个样本,GEMMA运算速率更高,占用内存和运行时间都比较理想,下面...
在进行数据分析特别是动物模型计算BLUP值时,会用到系谱数据,原始的系谱数据各种问题,分析起来头大,之前写过一些清洗数据的函数,但是对于很多老师还是门槛太高,今...
同事去大骨头, 吃过之后进行了抽奖, 然后向我炫耀, 看我抽到了一个小猪佩奇. 照片如下:
群体遗传学中常用的三大分析工具:主成分分析(PCA)、Admixture分析和进化树(Phylogenetic Tree),它们在分析基因型数据时各有侧重,互为...
大基因组的大样本重测序数据量动辄几十G上百G,本地电脑CPU、内存和硬盘空间根本吃不消;
https://asreml.cn/population-genetics/phylogenetic
大家好,我是邓飞,这一篇主要是灌水,因为有小伙伴问我Tassel的安装包,因为tassel下载网络不太好:
做GWAS的小伙伴谁没踩过这坑:吭哧吭哧测了样本、跑了模型、画了曼哈顿图,结果要么没检出显著位点,要么检出的位点验证不出来——大概率是功效(Power) 没算对...
修仙之路,法器为先。R语言与plink宝刃,皆是咱们数据修仙界的常用本命法器——R仙府擅长推演可视化,plink宝刃专精基因型数据淬炼,二者相辅相成,缺一不可。