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R语言实现双聚类
express
编程算法
node.js
聚类大家应该都听说过,但是双聚类想必大家接触的比较少,今天我们就给大家介绍下双聚类,首先看下基础的定义:针对二维数据进行处理的算法。假设给定矩阵M,寻找到矩阵M的多个子矩阵A,对于每一个A满足其指定条件进行聚类,最后得到需要的子矩阵B。目前广泛的模型有四种:矩阵等值模型、矩阵加法模型、矩阵乘法模型和信息共演变模型。接下来在R语言中的实现需要用到包biclust。其安装如下:
一粒沙
2020-05-28
1.6K
0
R语言实现GO分析
go
node.js
我们上一期介绍了如何实现GO分析的可视化,运行了GOplot包自带的数据并且很畅通。然而我们如何才能获取那些可以直接输入的数据表格或者说前期的工作是怎么实现的。今天就跟大家介绍下如何利用R语言实现GO的流程化分析。
一粒沙
2019-07-31
1.5K
0
R语言实现KEGG通路富集可视化
node.js
用过KEGG的朋友应该都很熟悉里面的通路地图。你是否想过如果自己可以控制通路图将自己的基因绘制在一个通路图中,那么今天给大家介绍一个新推出的Bioconductor软件包pathview。这个包可以进行KEGG富集分析。
一粒沙
2019-07-31
9K
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