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生物信息云

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Linux笔记【003】| Linux系统目录结构与基本命令

linux的文件系统是采用级层式的树状目录结构，在此结构中最上层是根目录“/”，然后在此目录下再创建其它的目录。在linux世界里。一切皆文件。

2020-10-23

1K0

转录组分析 | 使用SAMtools将SAM文件转换为BAM文件、排序、建立索引

http https 网络安全 html 缓存

转录组分析 | 使用trim-galore去除低质量的reads和adaptor

2020-09-23

19.2K0

生信人的R语言视频教程-语法篇-第十一章：R中的网络爬虫

node.js html css xslt & xpath http

用任何语言做爬虫必须要了解的就是网页语法，网页语言无非就是HTML，XML，JSON等，因为正是通过这些我们才能在网页中提取数据，过多的就不再描述，大家可以自行参考大量的资料，大多数语法都是树形结构，所以只要理解了，找到需要数据的位置并不是很难。用R语言制作爬虫无非就是三个主要的包。XML,RCurl,rvest，这三个包都有不同的主要函数，是R语言最牛的网络爬虫包。

2020-06-10

1.5K0

48个实用的生信在线工具强烈推荐，不看是你的损失！

http https 网络安全 html go

在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。

2020-02-25

4.7K0

一篇9分的miRNA文章了解一下！

对象存储 html

大约70%的多囊卵巢综合征 (PCOS) 妇女存在与体质量相关的高于或超过体质量的内在胰岛素抵抗 (IR)，包括脂肪组织 (AT) 的糖代谢功能失调。在AT中，对 IRS/pi3k/AKT 通路信号成分的分析发现，仅 GLUT4 在 PCOS 患者和 IR 对照受试者中的表达显著降低。我们检测了 miRNAs 的作用，特别是在调节 GLUT4（胰岛素敏感葡萄糖转运蛋白）在 PCOS 和匹配对照组的 AT 中的作用。PCOS AT 被确定为有差异表达的 miRNA 谱，包括上调的miR-93、-133 和-223。GLUT4是miR-93的高度预测靶点，而miR-133和miR-223已被证实可调节心肌细胞中GLUT4的表达。miR-93的表达揭示了体内IR稳态模型评估值与人 AT 中 GLUT4和miR-93表达之间的强相关性，而非 miR-133和miR-223表达。过表达miR-93 通过直接靶向GLUT4 39UTR 导致脂肪细胞中GLUT4基因表达下调，同时抑制 miR-93 活性导致GLUT4表达增加。这些结果指出了一种通过miR-93调节胰岛素刺激的葡萄糖摄取的新机制，并证明在所有PCOS和非 PCOS 妇女 IR中miR-93表达上调，可能解释了该综合征的 IR。相反，miR-133 和 miR-223 在 PCOS 的 IR 中可能有不同的作用，尽管尚未明确。

2019-12-13

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PCR中的引物设计

https http 网络安全 html 数据库

Nucleotide数据库的搜索结果还是比较智能的，搜索结果前面推荐的就是我们的要的，我们做基因检测，做的PCR是定量PCR，设计引物是以基因的转录本为模板设计的，所以我们点击RefSeq transcripts。

2019-08-20

2.4K0

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