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HiCPlotter:Hi-C数据可视化工具
命令行工具
HiCPlotter是一款命令行工具,用来展示Hi-C的交互矩阵。除了基本的用热图展示交互矩阵外,还支持添加基因结构,chip_seq等二维数据的注释信息,网址如下
生信修炼手册
2019-12-20
2.7K
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使用pyGenomeTracks可视化hi-c数据
python
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可视化是数据分析中非常重要的一个环节,对于NGS分析数据的可视化,最常用的就是各种基因组浏览器了,既有UCSC, GBrowse等基于web的基因组浏览器,也有igvtools等本地化的图形界面软件。对于Hi-C数据,在前面的文章中也介绍过基于web的WashU Epigenome Browser基因组浏览器和本地化的juicebox软件。
生信修炼手册
2019-12-19
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0
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