使用函数“group_by”的for不起作用(R)_在R中使用group_by的acf函数_如何在R中的函数中使用group_by - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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【R语言】rep函数的使用

我们在做数据分析的时候，经常需要产生一些重复序列。例如，做差异表达分析时需要用到的分组变量，绘制ceRNA网络的节点文件中的RNA type列等等。...今天小编就来给大家介绍一下R中生成重复序列的函数rep。你可以把它看作时repeat这个英文单词的缩写，就很容记住了。...函数形式：rep(x, time = , length = , each = ,) 参数说明： x：代表的是你要进行复制的对象，可以是一个数字，一个字符，或者是一个向量。...times：代表的是复制的次数，只能为正数。负数以及NA值都会为错误值。复制是指的是对整个向量进行复制。 each：代表的是对向量中的每个元素进行复制的次数。...rep(1:4, times=c(2,1,2,1)) [1] 1 1 2 3 3 4 我们还可以each和times两个参数同时使用 rep(1:4, each = 2, times = 3) [

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R」R 的函数

这有点类似于shell中通过$引用相应的参数。看来很多的编程语言都存有相同的参数传递机制。函数的属性 R中包含了一系列的函数用于提取函数类型对象的信息。...NULL 如果我们想要在R代码中对函数的参数列表进行操作，formals函数是一个很好的工具，它会返回一个配对列表对象（对应参数名和设定的默认参数值）。...注意，formals函数仅能运行在R写的函数上（类型为closure的对象），而不能在内嵌函数（bulti-in function）上运行。...改变其他环境这里介绍<<-操作符的使用：比如var <<- value，它会使解释器首先在当前环境中检索寻找符号var。如果解释器无法在当前环境中找到符号var，那么接下来会在父环境中继续寻找。...加入解释器在到达全局环境时依然没有找到var，那么R会在全局环境中指定var的值为value。

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「R」使用modules包来组织R的函数集合

安装和使用直接从CRAN下载即可： 1install.packages("modules") 使用了解2个函数的使用就可以了。一是import()，用于替换library()加载包。...., environment = parent.frame()) 10NULL 这样我们可以直接使用这个函数，也可以通过gp这个对象去访问可用的函数。...接下来介绍第二个函数。 use()将代码文件加载为模块最近使用GitHub page的时候发现它的访问速度相当可观，哪怕GitHub主站点本身网络我们国内访问时好时坏。...代码核心其实就是各种情况的检查，优先使用适合的包和函数进行下载、安装。它的存在就是方便国内使用者，特别是初学者简便地下载、安装包。...package keeps a record of temporary installation path 45* DONE (ggplot2) 考虑到该函数的常用性，如果你觉得这个函数好用，可以使用下面的命令将其保存到本地并进行配置

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使用R中merge()函数合并数据

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。使用R中merge()函数合并数据在R中可以使用merge()函数去合并数据框，其强大之处在于在两个不同的数据框中标识共同的列或行。...如何使用merge()获取数据集中交叉部分 merge()最简单的形式为获取两个不同数据框中交叉部分。举例，获取cold.states和large.states完全匹配的数据。...确实如此，merge()函数的不同参数可以实现内join，left join,right join以及完整join。 merge()函数有很多参数，看起来非常吓人。...，所以R基于两者state的name进行匹配。...总结本文详细介绍R中merge()函数参数及合并数据类型。利用sql的表连接概念进行类比，简单易懂。

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R中的sweep函数

函数的用途 base包中的sweep函数是处理统计量的工具，一般可以结合apply()函数来使用。...函数的参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理的原数据集 MARGIN：对行或列，或者数列的其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体的例子来看 #创建一个4行3列的矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行的均值 #方法一，通过rowMeans函数来计算每一行的均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二，通过apply函数来计算每一行的均值，MARGIN=1，对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列的均值...#方法一，通过colMeans函数来计算每一列的均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二，通过apply函数来计算每一列的均值，MARGIN=2，对列做操作 sweep(M,2,

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「R」tidyverse 中的公式函数

本文的写作由来是知识星球一个朋友对如何在 tidyverse 系列包中使用公式函数（单侧公式）不太熟悉，所以通过本文分享一下我的心得。...img 公式保存了创建它的环境使用到 R 的朋友几乎都用过公式，它在统计建模方面给了我们极大的方便。不过，公式相比于数值、逻辑值这些数据类型，有什么特点吗？...")= 从属性部分我们可以看到公式保存了创建它的环境。...公式函数用法核心是什么公式函数的优点在于提供了一种构造匿名函数的简洁方式。而核心在于在同一行代码表示如何使用输入构造出输出。...这里值得注意的是，当匿名函数只有一个参数时，我们用 .x 表示函数的输入参数。如果进行拓展，2 个参数时使用 .x 与 .y，3 个参数时使用 ..1, ..2, ..3 等。

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讨论学习R的grepl函数

废话不多说，我们来聊聊今天的正题。昨天有位群友在群里提出了这样一个问题具体的字符串向量是这样的，需要达到的目的就是，看字符串向量里面的每一个元素是否包含"LIPE2"这个基因。...这里的字符串向量有四个元素。实现的手段就是通过R的grepl函数这个函数里的pattern是匹配的模式，也就是我们经常听到的正则表达式。...这个问题引起了群里关于正则表达式激烈的讨论，其实，在这个群友提出这个问题之前，我还不太确定，pattern里面可以使用或（|），通过讨论大家都有所收获，至少群里的其他小伙伴知道了正则表达式这个概念...今天我又仔细的研究了一下，给出了三种实现的方法，供大家交流学习。我又加入了一个干扰项，让这个正则表达式更全面。...#例如，“er\b”可以匹配“never”中的“er”，但不能匹配“verb”中的“er”。

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R中的替换函数gsub

R中gsub替换函数的参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下： > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他的一些例子来灵活使用这个函数，结合正则表达式。...，我们知道组织病理分期分成stage I，stage II，stage III和stage IV四个分期接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组，并转换成因子我们使用gsub函数...，并转换成因子我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A，B或者C等字母，例如Stage IIIA，Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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R语言的常用函数速查

：计算各数据子集的概括统计量tapply：对“不规则”数组应用函数二、数学 1....：行名或列名 %*%：矩阵乘法crossprod：矩阵交叉乘积（内积） outer：数组外积kronecker：数组的Kronecker积 apply：对数组的某些维应用函数tapply：对“不规则”数组应用函数...函数 function：函数定义 source：调用文件 call：函数调用.C，.Fortran：调用C或者Fortran子程序的动态链接库。...统计分布每一种分布有四个函数：d――density（密度函数），p――分布函数，q――分位数函数，r――随机数函数。比如，正态分布的这四个函数为dnorm，pnorm，qnorm，rnorm。...下面我们列出各分布后缀，前面加前缀d、p、q或r就构成函数名： norm：正态，t：t分布，f：F分布，chisq：卡方（包括非中心）unif：均匀，exp：指数，weibull：威布尔，gamma

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如何在 pyqt 中解决国际化 tr() 函数不起作用的问题

前言有些时候我们在父类中使用了 self.tr('XXX')，使用 Qt Linguist 完成翻译并导出 qm 文件后，发现子类中仍然是英文原文。.../Add.png", self.coverPath, self.tr('Add to') ) 父类 AlbumCardBase 中有两处使用了...tr 函数，分别翻译为播放和添加到，但是在子类中这些文本仍然会显示为 Play 和 Add to，下面来看看如何解决这个问题。...解决过程生成的 ts 文件中，有这样一段代码：复制 AlbumCardBase 标签中的类名即可，比如 AlbumCard 为子类，那么只需添加下述代码：复制 AlbumCard</name

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「R」获取R包中的函数和对象列表

方案在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...#> [19] "package:datasets" "package:methods" #> [21] "Autoloads" "package:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...移除包含箭头 <- 的东西 idx <- grep("<-", funlist) if (length(idx) !...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version

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R语言使用merge函数匹配数据（vlookup，join）

参考文章 http://www.afenxi.com/post/41432 R中的merge函数类似于Excel中的Vlookup，可以实现对两个数据表进行匹配和拼接的功能。...与Excel不同之处在于merge函数有4种匹配拼接模式，分别为inner，left，right和outer模式。其中inner为默认的匹配模式，可与sql语言中的join语句用法。...FALSE, all.x = all, all.y = all, sort = TRUE, suffixes = c(".x",".y"), incomparables = NULL, ...) merge函数参数的说明...by = ‘公共列名’ ，前提是两个数据集中都有该列名，并且大小写完全一致，R语言区分大小写 by.x，by.y：指定依据哪些行合并数据框，默认值为相同列名的列 all，all.x，all.y：指定x...匹配模式 merge(w ,q ,all.x=TRUE,sort=TRUE) # 建议使用指定了连接列的情况 # 多个公共列，未指定连接列 # 左连接，设置 all.x = TRUE，结果只显示数据

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R tips：手动获取函数的源码

R中的函数分为普通函数、S3方法和S4方法。普通函数的源码获取细节普通函数的源码手动获取比较简单，只需要在console中输入函数名，打印一下即可。...导出函数可以理解为这个包开放给用户使用的函数，而非导出函数则主要是供这个包内部使用的函数，一般情况下它不需要暴露给用户。...，base包的::、[ 等操作符，colnames%、%$%等操作符都是函数，由于他们不是合法的R变量名称（只包含数字、英文字母...* 获取S4方法源码不同于S3方法，S4方法源码无法通过构造函数名称来获取，但是methods包（R的官方S4类包，默认自动导入）中提供了getMethod方法来获取源码。...类似，S4方法可以使用callNextMethod函数将方法转发给下一个类名。

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R语言中的批处理函数

在R语言中，apply系列函数作为批量处理函数，可以循环遍历某个集合内的所有或部分元素，以简化操作。这些函数底层是通过C来实现的，所以效率也比手工遍历来的高效。...apply族函数分别有apply函数，tapply函数，lapply函数，mapply函数。每一个函数都有自己的特点，在处理不同类型的数据可以选用相对应的函数。...1.apply函数 apply函数只能用于处理矩阵类型的数据，也就是说所有的数据必须是同一类型。因此要使用apply函数的话，需要将数据类型转换成矩阵类型。...也就是说tapply函数就是把数据按照一定方式分成不同的组，再在每一组数据内进行某种运算。 ? 4.mapply函数 mapply函数主要是对多个列表或者向量参数使用函数. ?...总结以上函数应用可以减少在R语言中的For循环，从而提升R语言效率。欢迎各位学习交流

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R tips：使用!!来增加dplyr的可操作性

一个代码在R console中是直接运行到结束的，如果想要获得其中间态：语句，可以使用expr函数来捕获它。...这些函数在rlang包中有更加系统的相同角色的存在：parse的对应函数是parse_expr（语句还重新变为字符串，使用expr_text）。...下面完成的上述操作的所需的函数都是rlang包中相应函数。如何使用!!...辅助dplyr完成编程工作上面的例子中，之所以group_var不起作用，是因为dplyr直接将group_var当做变量名，然后去mtcars中寻找名字叫做group_var的列，这肯定是会报错的。...会告诉group_by函数，先对group_var进行求值，获得其值为gear，然后在进行后续操作。为什么group_var需要先使用sym函数包裹？

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R语言使用 LOWESS技术图分析逻辑回归中的函数形式

p=6322 当我们在回归模型中包含连续变量作为协变量时，重要的是我们使用正确的（或近似正确的）函数形式。...例如，对于连续结果Y和连续协变量X，可能是Y的期望值是X和X ^ 2的线性函数，而不是X的线性函数。一种简单但通常有效的方法是简单地查看Y对X的散点图，以直观地评估。...对于我们通常使用逻辑回归建模的二元结果，事情并不那么容易（至少在尝试使用图形方法时）。首先，Y对X的散点图现在完全没有关于Y和X之间关联的形状的信息，因此在逻辑回归模型中应该如何包含X....为了说明，使用R let模拟一些（X，Y）数据，其中Y遵循逻辑回归，其中X在模型中线性进入： set.seed（1234） n < - 1000 x < - rnorm（n） xb < - -2...在R中我们可以写一个简短的函数来做同样的事情： logitloess < - function（x，y，s）{ logit < - function（pr）{ } if（missing（s））

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如何使用R的sweep函数对表达矩阵进行标准化

如下图所示除了中位数标准化之外，我们还可以使用z-score的方法来对表达谱数据进行标准化： z-score=(表达量-均值)/标准差那么下面小编就给大家演示一下如何使用前面讲到的☞R中的sweep...函数，使用z-score的方法来对表达谱矩阵进行标准化 #为了保证随机数保持一致，这里设置一下种子序列 set.seed(123) #随机生成100个数，构造一个10X10的矩阵 data=matrix...) #每一行基因表达值除以这一行的标准差 data2=sweep(data1,1,rowsd,'/') data2 得到的结果如下如果对R里面scale这个函数比较熟悉的小伙伴，可能已经发现了，scale...这个函数就能完成z-score的计算，我们来看看这个函数的说明我们来看看scale这个函数的效果 #因为scale默认对列做操作，所以这里先用t对表达矩阵做一个转置 #计算完再用t转置回来 data3...=t(scale(t(data))) data3 得到的结果如下，有兴趣的小伙伴可以去对比一下跟使用sweep函数得到的结果。

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R语言中的apply函数族

前言 apply函数族是R语言中数据处理的一组核心函数，通过使用apply函数，我们可以实现对数据的循环、分组、过滤、类型控制等操作。...但是，由于在R语言中apply函数与其他语言循环体的处理思路是完全不一样的，所以apply函数族一直是初学者玩不转的一类核心函数。...很多R语言新手，写了很多的for循环代码，也不愿意多花点时间把apply函数的使用方法了解清楚，最后把R代码写的跟C似得。...简介由于R语言的apply家族函数是用C写的，所以使用apply进行遍历的执行效率远远高于自己编写的循环语句。...eapply函数平时很难被用到，但对于R包开发来说，环境空间的使用是必须要掌握的。特别是当R要做为工业化的工具时，对变量的精确控制和管理是非常必要的。

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R中的stack和unstack函数

我们用R做数据处理的时候，经常要对数据的格式进行变换。例如将数据框（dataframe）转换成列表（list），或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样的功能。这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠，就像下面这张图展示的这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样的功能呢？下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框的第二列的分组信息，将第一列的数据划分到各个组，是一个去堆叠的过程。...stack函数的时候，也可以对组进行操作，比如筛选和过滤 stacked_df1 = stack(unstacked_df, select = -ctrl) stacked_df1 这段代码就在stack...，后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实的应用案例，敬请期待。

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学习R语言里的排序函数

学习R语言里的排序函数 (生信技能树学员徐谦) 正在上5月生信入门课程的小伙伴们应该初步掌握了一些R语言的基本函数，其中有一类函数可以称为排序函数，例如周二细讲的sort，order函数，以及不常使用的...rank函数，这里说的只是R基础包中的排序函数，另外还有其他包中的一些更方便的函数，例如dplyr包中的arrange，这些后续我们再共同学习。...先总结一下这几个函数的使用： 1.sort、order、rank 都是接受一个对象，通常为向量，运行之后根据这个向量中的元素位置，返回不同的值：例如我们将x赋值如下，分别运行三个函数： > x <-...但是后来一想不太对，R语言中几乎所有的函数都是有严格的对象和参数要求的，如果给了它函数里没写的东西，那大部分时候就会报错，如果没报错，那就是函数接受了，当然也有其他特殊例外的情况。...以上是R语言中基础函数中几个排序函数的用法，那排序到底有什么用呢？实际上在R语言中我个人觉得order比sort用的多，原因就是他会返回坑的位置。

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