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使用GNU并行的qsub作业未运行

是指在使用GNU并行工具的qsub命令提交作业后,作业没有被执行。

GNU并行是一个用于并行计算的工具,它可以将任务分发到多个计算节点上并行执行。qsub是GNU并行工具中的一个命令,用于提交作业到计算节点。

当使用qsub命令提交作业后,如果作业没有被执行,可能是由于以下原因:

  1. 作业排队等待:作业可能被提交到了计算节点的作业队列中,但由于计算节点上的其他作业正在执行,导致作业排队等待。这种情况下,需要等待其他作业执行完毕后,作业才会被执行。
  2. 作业资源不足:作业可能需要的资源(如CPU、内存等)超过了计算节点的可用资源。这种情况下,作业会被保持在队列中,直到有足够的资源可用时才会被执行。可以通过调整作业的资源需求或增加计算节点的资源来解决这个问题。
  3. 作业配置错误:作业的配置可能存在错误,导致作业无法被执行。例如,作业的执行路径、输入文件、输出文件等配置错误。需要检查作业的配置是否正确,并进行修正。
  4. 作业依赖未满足:作业可能依赖其他作业的输出结果,但这些依赖的作业尚未完成。这种情况下,需要等待依赖的作业完成后,才能执行当前作业。

针对以上可能的原因,可以采取以下措施:

  1. 检查作业队列状态:使用GNU并行工具提供的命令(如qstat)可以查看作业队列的状态,了解作业的排队情况和资源使用情况。
  2. 检查作业配置:仔细检查作业的配置文件,确保作业的执行路径、输入输出文件等配置正确无误。
  3. 调整作业资源需求:根据作业的实际需求,调整作业的资源需求,确保作业所需资源不超过计算节点的可用资源。
  4. 检查作业依赖关系:如果作业依赖其他作业的输出结果,需要确保这些依赖的作业已经完成。

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