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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

Dplyr Join two tables join 函数用于根据指定的键将两个数据框连接起来，可以根据共同的变量将数据框进行合并，支持多种连接操作，如内连接、左连接、右连接和外连接等。...Dplyr Select keep or drop columns select 函数用于选择数据框中的特定列，可以保留感兴趣的变量，并且能够根据列名、位置或条件表达式进行灵活的变量选择操作。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片，能够从数据框中提取特定的行，支持根据行数或行号选择需要的行，也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Dplyr Filter keep rows that match a condition filter 函数用于根据条件筛选数据行，能够仅保留满足条件的观测，支持根据指定的条件表达式对数据框进行灵活的行筛选操作...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据，能够根据用户指定的列将数据框中的多个列整理成一对 “名-值” 对，便于进一步的分析和处理

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数据处理第3部分：选择行的基本和高级的方法

Basic row filters 在许多情况下，您不希望在分析中包括所有行，而只包括选择的行。 仅使用特定行的函数在dplyr中称为“filter（）”。...以下代码将仅选择具有属于Didelphimorphia和Diprotodontia顺序的动物的行。...以上示例基于单个条件返回行，但filter选项还允许AND和OR样式过滤器： *filter（condition1，condition2）将返回满足两个条件的行。...condition2）将返回条件1为真但条件2不为的所有行。 *filter（condition1 | condition2）将返回满足条件1和/或条件2的行。...*filter（xor（condition1，condition2）将返回只满足其中一个条件的所有行，而不是满足两个条件时。 可以组合多个AND，OR和NOT条件。

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    R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

    /tidyr 数据管理 2.1 filter 使用逻辑条件对行筛选。...，后续的参数是条件，这些条件是需要同时满足的，另外，条件中取 缺失值的观测自动放弃，这一点与直接在数据框的行下标中用逻辑下标有所不同，逻辑下标中有缺失值会在结果中 产生缺失值。...dplyr 包的 distinct() 函数可以对数据框指定若干变 量，然后筛选出所有不同值，每组不同值仅保留一行。...R 数据整理（六：根据分类新增列的种种方法 1.0） 其他函数 slice dplyr 包的函数 slice(.data, ...) 可以用来选择指定序号的行子集，正的序号表示保留，负的序号表示排除。...使用统计相关参数计算列表内相关内容。如sum, mean, median, min, max。

    12.1K30

    使用R或者Python编程语言完成Excel的基础操作

    职场白领和学生通常都会对Excel有一定的熟悉度，原因如下： 教育背景：在许多教育课程中，特别是与商业、经济、工程、生物统计、社会科学等相关的领域，Excel作为数据处理和分析的基本工具被广泛教授。...条件格式：学习如何使用条件格式来突出显示满足特定条件的单元格。 图表：学习如何根据数据创建图表，如柱状图、折线图、饼图等。 数据排序和筛选：掌握如何对数据进行排序和筛选，以查找和组织信息。...使用查找和替换：按Ctrl+F或Ctrl+H，进行查找和替换操作。 4. 查询数据 使用公式：在单元格中输入公式进行计算。 查找特定数据：按Ctrl+F打开查找窗口，输入要查找的内容。 5....模板 使用模板：快速创建具有预定义格式和功能的表格。 高级筛选 自定义筛选条件：设置复杂的筛选条件，如“大于”、“小于”、“包含”等。 错误检查 追踪错误：找出公式中的错误来源。...通过dplyr和tidyr包，我们可以轻松地对数据进行复杂的操作。 在R语言中，即使不使用dplyr和tidyr这样的现代包，也可以使用基础包中的函数来完成数据操作。

    3.4K10

    数据处理|R-dplyr

    1）安装、加载dplyr包、准备数据 install.packages("dplyr") #加载dplyr包 使用dplyr包处理数据前，建议先将数据集转换为tbl对象。...data(iris) #本文使用iris示例数据集。 2）数据记录筛选（行筛选） filter函数:按指定条件筛选符合条件中逻辑判断要求的数据记录。...sample_n(mtcars, 50, replace = TRUE) #随机有重复的取50行数 10）数据联结 dplyr包也提供了数据集的连接操作，如左连接、右连接、内连接等： inner_join...(x,y,by = NULL) #内连接，合并数据仅保留匹配的记录 by设置两个数据集用于匹配的字段名，默认使用全部同名字段进行匹配，如果两个数据集需要匹配的字段名不同，可以直接用等号指定匹配的字段名...11）数据合并 dplyr包中也添加了类似cbind()函数和rbind()函数功能的函数，它们是bind_cols()函数和bind_rows()函数。

    2.4K10

    生信星球——生信入门DAY6:学习R包

    ="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 先安装，再装载install.packages("dplyr")library(dplyr)（library() : library...如没有参数package即library()，则列出lib.loc指定的库中的所有可用包。library(help=package)将返回package的基本信息。...从该文件读取和分析输入，直到到达文件的结尾，然后在选定的环境中按顺序解析表达式。简单来讲，library更像装载，require不会报错，source装载的方式则不太一样。...，第二行代码即是先将数据按species分组，再计算均值和标准差同时，对于这样一组简单的数据，用管道操作也可以达成相同的目的，但是更有趣test %>% group_by(Species) %>%...#全连（行➕列，不算重复）semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x') #半连接，与y表匹配的x表所有记录（即以y为条件的x）anti_join(x = test2

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    R语言之 dplyr 包

    该数据集来自一项关于新生儿低体重危险因素的病例对照研究。首先加载该数据集并查看其相关信息。 library(dplyr) data(birthwt, package = "MASS") # ??...1.使用 filter( ) 和 slice( ) 筛选行 函数 filter() 可以基于观测值筛选数据框的一个子集。第一个参数是数据框名，第二个参数以及随后的参数是用来筛选数据框的表达式。...head(filter(birthwt, age > 35, bwt 4000),10) 函数 slice( ) 可以按照行号选择指定的行。...select(birthwt, bwt, age, race, smoke) 请注意，MASS 包里有一个同名函数 select( )，如果同时加载了 dplyr 包和 MASS 包，R 会默认使用较后加载的包里的函数...相对于传统的数据框，tibble 在很多方面具有优势，感兴趣的读者可以参阅函数 tibble( ) 的帮助文档。

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    R for data science （第一章）①Chapter1 使用ggplot2进行数据可视化

    ::filter() masks stats::filter() x dplyr::lag() masks stats::lag() 这一行代码加载核心整数。...这是积极的吗？ 负？线性？非线性？ mpg数据框 您可以使用ggplot2（又名ggplot2 :: mpg）中的mpg数据框测试您的答案。 数据框是变量（列）和观察（行）的矩形集合。...该图显示了发动机尺寸（displ）和燃料效率（hwy）之间的负相关关系。换句话说，大型发动机的汽车使用更多的燃料。这是否证实或驳斥了您关于燃油效率和发动机尺寸的假设？...mapping参数始终与aes（）配对，aes（）的x和y参数指定要映射到x和y轴的变量。 ggplot2在data参数中查找映射变量，在本例中为mpg。...ggplot2一次只能使用六个形状。默认情况下，使用形状美学时，其他组将进行非开槽。 对于每种美学，您使用aes（）将aesthetic名称与要显示的变量相关联。

    3.3K20

    生信学习-Day6-学习R包

    在 iris 数据集中，Petal.Length 和 Petal.Width 分别代表花瓣的长度和宽度。 因此，当你使用 vars 变量时，你实际上是在引用那些具有这些名称的列。...在dplyr包的filter()函数中使用时，它可以用于筛选数据框中匹配给定集合中任一值的行。这行代码的作用如下： filter(test, ...): 在test数据框中筛选行。...这意味着函数将查找 test1 和 test2 中列名为 "x" 的列，并基于这两列中的匹配值来合并行。只有当两个数据框中都存在列 "x" 且某些行在这一列的值相等时，这些行才会出现在最终的结果中。...y = test2：表示要与test2数据框进行semi-join操作，即保留test1中与test2匹配的行。 by = 'x'：指定要根据哪个列进行匹配。在这里，使用列x来进行匹配。...y = test1：表示要与test1数据框进行anti-join操作，即从test2中删除与test1匹配的行。 by = 'x'：指定要根据哪个列进行匹配。在这里，使用列x来进行匹配。

    83510

    生信代码：数据处理（ tidyverse包）

    dplyr包下主要是以下几个操作: select()——选择列 filter/slice()——筛选行 arrange()——对行进行排序 mutate()——修改列/创建列 summarize(...mydata %>% mutate(sumx=x1+x2, meanx=sumx/4)##dplyr允许使用管道%>%操作，且meanx可以引用sumx 2...>% select(1,2) ##选取1，2列 df %>% select(name,score) df %>% select(-3) ##同样也可以用start_with 或 end_with筛选出具有前缀或者后缀的列...df %>% select(start_with("n")) 3 filter() filter()是对数据行方向的选择和筛选，选出符合我们条件的某些行： df %>% filter( type==...包中涉及到排序的包括 sort()，rank()，order()，而在dplyr包中与排序相关的是arrange()包，默认是从高到低进行排序，如果变换排序顺序则可以使用-(变量)或者desc(变量)。

    2.5K10

    R&Python Data Science 系列：数据处理（1）

    这一部分介绍一下R和Python数据处理用到的筛选、衍生以及计算函数。主要介绍如何使用R语言和Python中的两个程序包进行数据处理，R语言中的dplyr和Python中的dfply第三方包。...R语言 library(ggplot2) library(tidyverse) library(tidyr) library(dplyr) ##筛选cut为Ideal记录的前4行 diamonds %...4.3 sample函数 使用参数和关键词进行数据抽样，Python中参数frac按比例抽样，n指定抽样的行数，replace限制是否重复抽样: Python实现 ##抽样diamonds数据...注意：python中按比例抽样和抽样指定的几列，是通过参数限制的；R语言按比例抽样使用sample_frac()函数，抽样几列使用sample_n()函数 4.4 distinct函数 选择唯一值...注意在python和R中distinct()函数有细微的差别。 4.5 filter_by函数 按照某种条件进行筛选，python中也可以使用mask()函数，两者等价。

    1.8K10

    自学攻略 | R语言数据筛选和修改

    本篇推文将详细介绍如何在 R 中对数据进行排序、筛选、替换以及调用特定行和列等核心操作。 准备工作：导入你的数据 在进行任何数据处理之前，我们首先需要将文件中的数据导入到 R 中。...TRUE, row.names = 1, sep = ",") # 查看数据的前几行，确保导入正确 head(data) 导入数据后，你可以使用 dim() 查看数据的维度（行数和列数），str(...dplyr 的核心理念是使用一系列“动词”来描述数据操作，如 filter()（筛选）、select()（选择）、arrange()（排序）、mutate()（新增/修改列）和 summarise()（..., Age, DiseaseStatus) print(selected_columns) 除了直接指定列名，你也可以使用一些辅助函数： startswith("prefix")：选择以特定前缀开头的列...) 小结 本篇教程详细介绍了 R 语言中数据导入以及对数据进行筛选、替换和调用特定行和列等核心操作。

    31010

    Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

    )以dplyr包为例 官方包的文档dplyr示例数据test 的iris数据第1，2，51，52，101，103行?...(2)按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)iris %>% select(Species, Sepal.Length)3.filter()筛选行/返回具有匹配条件的行可以按照某分类变量的值进行数据筛选...\ 将多个值减少到单个值summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) # 计算Sepal.Length的平均值和标准差summarise(group_by...(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) # 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差dplyr两个实用技能..., test2, by = "x")满足两个条件：有相同变量名，相同变量名的列里有相同元素；2.左连left_join列表书写顺序决定了最终合成列表中列的顺序left_join(test1, test2

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    可以使用通配符的20个Excel工作表函数

    COUNTIF 计算满足一个条件的单元格数。 COUNTIFS 计算满足一组或多组条件的单元格数。 DPRODUCT 将列表或数据库中与指定的条件匹配的记录字段（列）中的值相乘。...DVARP 通过使用列表或数据库中与指定的条件匹配的记录字段（列）中的数字，计算基于整个总体的总体方差。 HLOOKUP 在表或值数组的顶行中搜索值，然后在表或数组中指定的行返回同一列中的值。...当比较值位于数据表顶部行中，并且想要向下查看指定数量的行时，使用HLOOKUP。当比较值位于要查找的数据左侧列中时，使用VLOOKUP。...MAXIFS 返回由一组或多组条件指定的单元格中的最大值。 MINIFS 返回由一组或多组条件指定的单元格中的最小值。 SEARCH 在另一个文本值中查找一个文本值（不区分大小写）。...SUMIF 在由一个条件指定的一个或多个行或列中的单元格之和。 SUMIFS 在由多个条件指定的一个或多个行或列中的单元格之和。

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    R语言第二章数据处理(9)数据合并

    和dplyr包中的join函数进行数据框的合并，它们数据框合并的原理同样是数据框的合并原理是这样的：首先在A数据框某一指定列的每一行内容在B数据框表的指定列进逐行匹配，直到A中所有行匹配完为止。...这里的数据仍使用merge函数中的两个数据(略有修改)：作者信息数据和书籍信息数据。依照下面介绍的合并条件，这两个数据既有相同的内容，又有彼此中不存在的内容。...包的join函数 dplyr包是plyr包的升级，join函数在dplyr包中是个系列函数。...join为系列函数，包括inner_join、left_join、semi_join和anti_join函数 dplyr包的join函数似乎没有plyr包的join函数的match参数，只能进行所谓的...all匹配 inner_join函数 函数结果, 行：显示x中所有能在y中匹配到行; 列：显示x，y中的所有列 library(dplyr) # 单指标匹配 inner_join(data1,data2

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