标记差异基因 不想安装额外的包,可以用 ifelse,要稍微复杂一点。...res_output$level ifelse(res_output$padj<=padj_thresh, ifelse(res_output$log2FoldChange...log2FoldChange<=(-1)*(log2FC), paste(groupB,"UP"), "NoDiff")) , "NoDiff") 或...dplyr::if_else速度最快!...;如果是单个条件,用dplyr::if_else;如果多个条件,用dplyr::case_when (更可读)
大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 在ireport中实现分组,求和。效果如下 name total A 2 A 3 subtotal ...
对同一表中多个字段的查询,在thinkPHP中使用数组条件进行查询,有三个好处,第一可以批量设置多个查询字段,第二可以设置多个查询条件,第三结构化你的代码,让代码更具可读性。...数组条件查询有简单数组查询、数组表达式查询,一般使用$map保存数组条件。...代入where条件。...(0)的数据的数据 $map['username'] = ['like','%xifengli%']; $map['status'] = ['',0]; 上面两种属于基础类型,描述的是多个字段的并列条件...现在的问题是同一字段的并列条件和或者条件如何处理,也就是本文标题中的同一字段多个条件。 同一字段多条件表达式查询 例如现在需要查询用户表中状态为不在黑名单并且状态不为临时(2)的用户。
MySQL GROUP BY 语句 GROUP BY 语句根据一个或多个列对结果集进行分组。 在分组的列上我们可以使用 COUNT, SUM, AVG,等函数。...,使用前我们可以先将以下数据导入数据库中。...GROUP BY 语句 将数据表按名字进行分组,并统计每个人有多少条记录: mysql> SELECT name, COUNT(*) FROM employee_tbl GROUP BY name...WITH ROLLUP WITH ROLLUP 可以实现在分组统计数据基础上再进行相同的统计(SUM,AVG,COUNT…)。...例如我们将以上的数据表按名字进行分组,再统计每个人登录的次数: mysql> SELECT name, SUM(singin) as singin_count FROM employee_tbl GROUP
我们需要先将要进行均匀布局的视图放到一个数组中,然后通过Masonry为NSArray添加的一个分类:NSArray+MASAdditions.h调用数组的一个方法。 核心代码: ?
图片本流程的使用需要使用202010.03或更新版本的Sentieon软件和可从Sentieon®获取的相关脚本。本流程需要Python版本>2.7或>3.3,bcftools版本为1.10及以上。...该设置为minimap2针对HiFi数据的推荐设置。参考基因组DNAscope将根据高质量参考基因组对样本进行变异检测。除了参考基因组外,由samtools生成的基因组索引文件(.fai)也是必须的。...具体步骤如下:本流程在第⼀轮调用中会检测样本中的变异位点;利⽤第⼀轮检出的SNV和长读长信息进行定相;第⼆轮调用:在定相区,从每个单倍型中分别进行变异调用;在非定相区,使用更准确的⼆倍体模型进行变异调用...;将第⼀轮和第⼆轮的变异位点合并生成最终结果;通过提供的MHC bed⽂件,对MHC区域进行特殊处理,进⼀步提高变异检测准确性;本流程所需的DNAscope机器学习模型可从https://github.com...运行流程通过⼀个包含多个单⼀Sentieon命令的脚本即可运行HiFi数据DNAscope流程。⼀行命令即可完成变异检测并运用机器学习模型。
注:ASP.NET Core 默认使用的是 Kestrel ,使其实现跨平台,需要反向代理才能在外网进行访问。...配置文本: server { listen 端口; #多个域名使用英文逗号分隔 80,81 server_name ip或域名; #多个域名使用英文逗号分隔开 location / { proxy_pass...每个配置,使用一个 server server { } 注意: 如果你想配置多端口多域名访问,则需要多个的 server{} 。 Nginx 中,同一个 server{} 配置,里面的端口是共用的。...(下图有演示) 假设 server { listen 80,81,82,83; #多个域名使用英文逗号分隔 80,81 server_name a.com,b.com,c.com,d.com;...#多个域名使用英文逗号分隔开 ... ... } 那么,实际访问,公有 4*4 种情况。
一、前言 我们在使用IDEA中最常用的就是debug,很多人只是让他停下来看一下,很多高阶的不知道怎么使用,小编也是最近才知道!...所以马上分享给大家,这里主要是对Stream留的debug,也就是lambda表达式进行debug。还有条件断点,符合条件的才会被断点捕捉到。...二、干货一:对lambda表达式进行加断点 public class Debug { public static void main(String[] args) { debugStream....map(x -> x + 100) .forEach(System.out::println); } } 断点展示 三、干货二:打条件断点
在这篇文章中,您将学习如何使用Java对Map进行排序。前几日有位朋友面试遇到了这个问题,看似很简单的问题,但是如果不仔细研究一下也是很容易让人懵圈的面试题。所以我决定写这样一篇文章。...将Map或List等集合类对象转换为Stream对象 2. 使用Streams的sorted()方法对其进行排序 3....最终将其返回为LinkedHashMap(可以保留排序顺序) sorted()方法以aComparator作为参数,从而可以按任何类型的值对Map进行排序。...如果对Comparator不熟悉,可以看本号前几天的文章,有一篇文章专门介绍了使用Comparator对List进行排序。...四、按Map的值排序 当然,您也可以使用Stream API按其值对Map进行排序: Map sortedMap2 = codes.entrySet().stream(
本文使用的工具下载地址为: https://github.com/cnxy/dnSpy/archive/v4.0.0.zip 或 dnSpy官方下载地址: https://github.com/0xd4d...,现在,需要使用dnSpy工具,将内部str的变量改变并在线调试。...三、使用dnSpy工具对程序进行反编译: ①使用dnSpy工具对刚才生成的ChangeString.exe进行反编译,如下图所示: ?...注意: 编译时请注意以下事项,否则将不能进行编译: ①还有其他DLL模块的,必须把它包含进来; ②如有其他反编译后有不能识别的字符,请手工修改OK之后再进行编译。...另外,这个程序不仅对EXE有效,同样对DLL有效,请自行试验,谢谢!
通过将差异分析与pseudobulks结合,我们能够有效地合并单细胞或小样本中的信息,获得更具代表性的群体特征,这对于高变异数据的分析尤其重要。...Pseudobulk分析的步骤:细胞分组:将单细胞数据按照预定义的标准进行分组,如细胞类型、实验条件、样本组等。...表达数据汇总:对于每一组细胞,将同组内所有细胞的基因表达数据加总或平均,形成一个群体层次的表达谱(伪样本)。差异表达分析:对伪样本进行标准的差异表达分析,以识别群体间的基因表达差异。...适用于批量处理分析:在处理不同组或不同条件下的大量样本时,Pseudobulk分析可以减少计算资源的消耗,因为它不需要处理成千上万个单细胞数据,而是基于汇总后的数据进行分析。...3.评分方式不同GSEA:使用排名统计方法。首先对基因进行排序,然后计算基因集在样本中的富集情况。GSEA 主要关注基因集在样本中的分布,尤其是基因表达水平的排序。GSVA:使用加权排名分数。
当今时代,人们对与图像与视频的分辨率要求越来越高,但是一些之前的图片或视频资源的分辨率却是比较堪忧,所以这里我们将会使用腾讯云的GPU服务器来对图像与视频进行超分辨率处理,用于修复一些分辨率较低的图像或视频...当你的服务器或电脑显存不足,软件报显存不足的错误时,请根据你的显存大小选择合适的切割块大小。 超分使用半精度:对于N卡来说,建议开启此选项,可以有效减少显存占用。...我们需要对其进行一下压制,这里我推荐使用ShanaEncoder对视频进行压制,当然你也可以使用ffmpeg等工具进行压制,全凭个人喜好。...总结 使用GPU云服务器对视频进行超分辨率的操作就这些了,对图像进行超分的话就只需要将最初输入的视频改为图片就可以了。...对于大规模的图像以及视频处理来说,自己的电脑性能总归会有些力不从心,这时候,使用GPU服务器就可以更高效得帮我们处理这些。 由于本人学识尚浅,难免会有些疏漏,欢迎各位对我写的内容予以批评指正。
[http://www.cnc6.cn] 本文使用的工具下载地址为: https://github.com/cnxy/dnSpy/archive/v4.0.0.zip 或 dnSpy官方下载地址: https...,现在,需要使用dnSpy工具,将内部str的变量改变并在线调试。...三、使用dnSpy工具对程序进行反编译: ①使用dnSpy工具对刚才生成的ChangeString.exe进行反编译,如下图所示: ②在Main函数内右键点击菜单,在弹出的上下文菜单中选择“编辑方法...注意: 编译时请注意以下事项,否则将不能进行编译: ①还有其他DLL模块的,必须把它包含进来; ②如有其他反编译后有不能识别的字符,请手工修改OK之后再进行编译。...另外,这个程序不仅对EXE有效,同样对DLL有效,请自行试验,谢谢!
下面是Excel的比较运算符: = 等于 不等于 > 大于 >= 大于等于 < 小于 <= 小于等于 在诸如基于条件查找最小值或最大值、计算标准偏差等情形时,Excel没有提供相应的内置函数,必须编写数组公式...图1 使用数组公式 Excel中没有一个MINIF函数来根据条件求相应的最小值,可以使用MIN/IF函数组合来实现。...如下图3所示,显然,对于多个值不能像以前那样简单地下拉公式,这是其不利之处。 ?...可以看出,数据透视表对于带有一个或多个判断条件的聚合计算非常方便,但是与公式相比,当源数据变化时,它不能立即更新,需要刷新才能更新其内容。...此示例也可以使用上文介绍的DMAX函数或数据透视表来实现,有兴趣的朋友可以试试。 再看一个示例。
一、本软件是使用VS2019开发(也可以使用VS2015/VS2017打开,但有些特性可能不支持),基于DotnetFrameWork4.0,如需运行该软件,从以下网站下载: 软件下载地址:点击此处下载...)对仪器或下位机等进行通信,如下图: ?...如不懂SCPI指令,请自己进行百度。...四、软件源代码: https://github.com/cnxy/VISAInstrument 请自行克隆C#源代码 或 从 https://github.com/cnxy/VISAInstrument...NI-GPIB卡(需要驱动程序,驱动程序可以从NI官方网站下载) LAN:支持常见的LAN接口编程,一般地址类似为“TCPIP0::34465A-01899::inst0::INSTR”或“TCPIP0
https://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w
genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1909-7 软件对应的github主页 https://github.com/Illumina/paragraph 软件可以直接使用...conda进行安装 参考基因组、变异vcf文件、二代测序数据 下载自链接 https://s3-us-west-2.amazonaws.com/human-pangenomics/index.html?.../github.com/vgteam/sv-genotyping-paper/blob/master/simulation/genotype-other-methods.sh 有了参考基因组、已知结构变异的...vcf文件、和一些样本的二代测序数据,对已知的结构变异进行基因型分型 第一步是二代测序数据与参考基因组进行比对 bwa index ref.fa bwa mem ref.fa s2.fastq.gz -
5.4 缺失值 处理异常值有2种方法: 1.将带有可疑值的行全部丢弃 diamonds2 % filter(between(y, 3, 20)) 我们不建议使用这种方式...此外,如果数据质量不高,若对每个变量都采取这种做法,那么你最后可能会发现数据已经所剩无几! 2. 缺失值代替 最简单的做法就是使用mutate()函数创建一个新变量来代替原来的变量。...你可以使用ifelse()函数将异常值替换为 NA: diamonds2 % mutate(y = ifelse(y 20, NA, y))...上面ifelse()函数含义为:如果y小于3或y大于20,则y=NA,反之,y还是为原来值。...diamonds %>% mutate(cut = if_else(runif(n()) % ggplot
第四部分:使用层次结构图、圆图或和弦图可视比较细胞-细胞通信 第五部分:比较不同数据集之间的信号基因表达分布 保存合并的CellChat对象 CellChat 采用自上而下的方法,即从大局出发,然后对信号机制进行更详细的改进...如果有更多的数据集进行比较,我们可以直接显示每个数据集中任意两个细胞群之间的交互次数或交互强度。...根据信号/结构的相似性识别差异较大(或更少)的信号网络以及信号组 CellChat 根据推断的通信网络的功能和拓扑相似性,对其进行联合多重学习和分类。NB:此类分析适用于两个以上的数据集。...功能相似性:功能相似度高表示主要发射器和接收器相似,可解释为两个信号通路或两个配体受体对具有相似的作用。NB: 功能相似性分析不适用于具有不同细胞类型成分的多个数据集。...extractGeneSubsetFromPair(net.up, cellchat) gene.down <- extractGeneSubsetFromPair(net.down, cellchat) 然后,我们使用气泡图或和弦图可视化上调和向下调的信号配体对
Rdata可以保存多个变量,下次使用只需要一次load可以的到多个数据。-Rdata不仅可以保存数据框,也可以保存其他任何数据结构,包括复杂的对象!...2.3 if条件语句控制代码运行elseif(F){}啥都不敢if(F){}elese{}#运行else后的{}中的代码2.4 ifelse函数只有3个参数ifelse(x,yes,no)x:逻辑或逻辑值向量...('-')}#多个条件#代码2ifelse(i>0,"+",ifelse(i多个条件的两句代码比较看哈!!...table(x)2.7 for循环对x里的每个元素进行同一操作for(i in x){CODE}#x是向量;i是代称,i自动等于某个循环里的x元素for( i in 1:4){ print(i)}#for
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