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没有OrgDb包的非模式物种如何做功能富集?

最近,我们的生信入门《转录组测序分析专题》课程进行了全面更新,里面就更新了 ,尤其是关于非模式物种的分析部分。...然而,随着科学技术的发展,一些非模式生物的研究也在逐渐增加,它们的基因组信息和研究工具也在不断完善。人参作为一种重要的药用植物,其研究在中医药领域和植物学领域具有重要意义。...Bioconductor项目的一部分 它提供了一种方便的方式来存储和检索特定物种的注释信息。...经济作物:需要自行在Bioconductor的OrgDb包列表中查找特定作物的OrgDb包。...如果你需要为特定的非模式生物寻找或构建OrgDb包,可以使用AnnotationHub来搜索现有的包,或者使用AnnotationForge来构建新的OrgDb包。

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使用WiX制作具有时间限制的安装包

WiX是Windows Installer XML的简称,它是用于制作Windows安装包的工具集。它支持命令行环境,开发者可以及将它集成到他们的编译过程中创建MSI和MSM安装包。...更多信息可以参考:http://wix.sourceforge.net/ 最近研究了一下如何使用WiX制作具有时间限制的安装包,下图是demo的效果图。 ?...选择合适的脚本语言(VBScript or JScript)实现定制操作。 2. 选择合适的实际执行上面的脚本。 下面分享我的实现过程: 1....选择合适的时机执行上述脚本,越早越好。     在本文的demo中,我在PrepareDlg之前执行脚本,对于大多数情况而言,这已经是最早的时机了。...添加Condition用于检查第三步添加的属性是否存在,并在需要的时候弹出错误信息。

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    Netty解决TCP粘包拆包的问题

    什么是TCP粘包/拆包   首先要明确, 粘包问题中的 “包”, 是指应用层的数据包.在TCP的协议头中, 没有如同UDP一样的 “报文长度” 字段,但是有一个序号字段.   ...站在应用层的角度, 看到的只是一串连续的字节数据.那么应用程序看到了这一连串的字节数据, 就不知道从哪个部分开始到哪个部分是一个完整的应用层数据包.此时数据之间就没有了边界, 就产生了粘包问题,那么如何避免粘包问题呢...,现在我们通过Netty案例来实现下不考虑TCP粘包和拆包问题而造成的影响。...而客户端设计应该受到100条响应,实际服务器发送了两次响应,客户端只受到了一条响应,说明服务器返回给客户端的应答信息也发生了粘包问题。...组合就是按行切换的文本解码器,它被设计用来支持TCP的粘包和拆包问题。

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    TCP的粘包拆包问题+解决方案

    为什么TCP有而UDP没有粘包❓ 1️⃣因为udp的数据包有保护边界。 2️⃣tcp是以字节流的形式,也就是没有边界,所以应用层的数据在传输层的时候就可能会出现粘包和拆包问题。...出现这种问题的原因图解 1️⃣字节流可以理解为一个双向的通道里流淌的数据,这个数据其实就是我们常说的二进制数据,简单来说就是一大堆 01 串。这些 01 串之间没有任何边界。...2️⃣应用层传到 TCP 协议的数据,不是以消息报为单位向目的主机发送,而是以字节流的方式发送到下游,这些数据可能被切割和组装成各种数据包,接收端收到这些数据包后没有正确还原原来的消息,因此出现粘包现象...粘包情况 ​​​​​​​要发送的数据小于TCP发送缓冲区的大小,TCP将多次写入缓冲区的数据一次发送出去,将会发生粘包; 拆包情况 要发送的数据大于TCP发送缓冲区剩余空间大小,将会发生拆包; 拆包...&粘包 解决方案 应用层措施 1️⃣封装固定包的大小。

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    具有可证明性能保证的协同循环闭包检测的资源感知方法

    在现实世界的场景中,这个过程是资源密集型的,因为它涉及交换许多观察并几何验证大量潜在的匹配。这对具有各种操作和资源限制的小尺寸和低成本机器人提出了严峻挑战,这限制了例如能量消耗,通信带宽和计算能力。...本文提出了一个框架,其中机器人首先交换紧凑查询以识别一组潜在的循环闭包。...然后,我们寻求选择用于几何验证的潜在机器人间闭环的子集,其最大化单调子模块性能度量,而不超过计算预算(几何验证的数量)和通信(用于几何验证的交换数据的量)。...我们证明了这个问题通常是NP难的,并且提出了具有可证明的性能保证的有效近似算法。所提出的框架在实际和合成数据集上进行了广泛的评估。...还提出了一种自然凸松弛方案,以证明所提出的框架在实践中的近乎最佳性能。

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    是否,是否,总是富肥穷瘦?

    其公式定义如下: 计算的Cohen’s d的绝对值是0.163,0.163代表两类人群的BMI值有差异,经过几番层层的验证,我们可以初步的一个结论:富人较普通人偏瘦。 是否,是否,总是富肥穷瘦?...用假设检验的方法来,再一次验证结论,提高可靠性。 开始假设检验(统计推断的重要方法): (1) 结合问题建立假设; 问题:富人的BMI平均值是否等于,总体所有人的BMI平均值?...建立假设: 原假设:富人的BMI均值等于总体所有人的BMI均值28.188。 备择假设:富人的BMI均值小于总体所有人的BMI均值28.188.#这是一个单边检验问题。...在经济快速发展的今天,人们物质生活水平不断提高的社会,“富不一定肥,穷不一定瘦”也是社会进步的一种表现。同时心中有一个很大的“问号”,为什么“富缺偏瘦”,富与瘦到底有没有因果关系?谁是因?谁是果呢?...有人认为:“拥有自律的生活,积极的锻炼,对自己身材有掌控力的人,他们更容易获得财富” 是非难断,但是富和瘦是存在相关性的,也许在这个快速发展的社会,可以说胖是对穷的一种潜标签,不管是富憎肥,还是穷憎瘦。

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    APNS开源包的内存泄露问题

    今天要聊的问题集中在第4个环节,我们自己的服务器往苹果的消息中心推送通知。...过程漫长,开始接入的是个人业务,每天的调用量不大,服务器还表现正常; 8月底,BI的推送管理后台开始对接进来并发布上线,由于BI是针对各种营销活动批量推送的,一次任务少则几万,多则上千万, 此时服务器开始暴露一些问题...,整个链路占了heap 50%+ 4) 这个问题比较棘手,因为我们使用的是一个外部开源框架; 只能网上先查查资料,看看有没有其他人遇到过类似问题; 很不幸没有找到现成答案,幸运的是在github上找到了源代码...貌似没有什么明显问题,但是mat的分析结果ThreadGroup里面有大量其它线程,担心会有干扰。决定采用一种更靠谱更安全的方式,通过CountDownLatch来控制。 ? ?...总结: a)线上报警,无论load彪的有多高,又或cpu使用率100%,千万不要慌,先保留一台问题机器,其它的机器全部重启,保证不影响外部使用 b)要从整个链路全面分析问题,多和身边的同事沟通讨论,也许会碰撞出灵感

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    面试最爱问的闭包问题!!!!

    JS中闭包的定义这里先来看一下闭包的定义,分成两个:在计算机科学中和在JavaScript中。...会在捕捉时被确定,这样即使脱离了捕捉时的上下文,它也能照常运行;闭包的概念出现于60年代,最早实现闭包的程序是 Scheme,那么我们就可以理解为什么JavaScript中有闭包: 因为JavaScript...),这样的组合就是闭包(closure); 也就是说,闭包让你可以在一个内层函数中访问到其外层函数的作用域;在 JavaScript 中,每当创建一个函数,闭包就会在函数创建的同时被创建出来; 那么我的理解和总结...bar访问了外层作用域的自由变量name,那么这个函数就是一个闭包; console.log("bar", name) } return bar}var fn = foo()fn()那这里又会有一个问题产生...如果该函数使用的次数很少,不进行销毁的话就会变为闭包产生的内存泄漏。那我们怎么解决闭包导致的内存泄漏问题呢?1、手动释放(需要避免的情况)只需将该函数赋值为null即可。

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    Python的包与模块导入问题

    导入报错 python中导入包与模块时,一般会遇到两个问题: 1、ValueError: attempted relative import beyond top-level package 2、ModuleNotFoundError...: No module named 'testpkg' 一个是不能导入顶层超过顶层层次的包,一个是找不到模块 网上的介绍和测试 1、https://www.cnblogs.com/linkenpark...1、使用相对路径导入导致的顶级层次报错,python中以当前运行的脚本所在目录作为顶层层次,比如运行run.py时,A\B都是顶级层次,不能跨越顶级层次引用包或模块!...如果grok.py中打印__name__,会看到包的路径为A.grok,A便为此时的顶级层次,不能跨顶级层次访问B 2、运行脚本时不能识别到顶级层次外的模块,所以导致报错2 如何注意和规划代码层次 1...3、如果内部模块一定要跨顶级层次导入,则应该使用sys.path.append来将路径添加到python的包查找路径中 4、遇到类似问题,非常轻易的定位,第一步分析当前的顶级层次,是否有跨顶级层次导入,

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    百度富文本编辑器的上传图片的路径问题

    之前在写个人博客网站的时候,用到了百度的富文本编辑器,在往文章内容插入图片的时候,上传一直出错,总结了一下,与大家分享 在使用富文本编辑器的时候上传文件路径不对: 在配置文件config.json中,把...imagePathFormat路径改为相对于服务器根目录的路径,如:/www/my_blog/resources/assets/ueditor/upload_img/{yyyy}{mm}{dd}/{time...}{rand:6} 而不是对于这个项目的目录 进行了如下步骤:(参照网上的方法) 找到了编辑器的上传处理类 Uploader.class.php,大约110行的位置找到了上传失败的提示位置, 将 注释掉...然后使用ueditor上传,错误提示的上传路径是: /usr/local/nginx/html/ueditor/php/upload/image/20150526/ 这样就可以在错误提示的基础上慢慢修正自己的错误路径...如果路径没有问题,但是还是上传不了,,这时可能是因为文件夹没有权限造成的,需要给文件夹755权限。

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    如果35岁时破产,还有多大可能逆袭?

    来源 / 城市数据团(ID:metrodatateam) 作者 / 团支书 最近在知乎上看到一个很有趣的问题:房间里有 100 个人,每人都有 100 元钱,他们在玩一个游戏。...最后,社会将有很少的富人和很多的穷人: 最富有的人的财富值约为初始财富的 3.5 倍; TOP 10% 的富人掌握着大约 30% 的财富,TOP 20% 的富人掌握着大约 50% 的财富;60% 的人的财富将缩水到...富二代们和普通人生活在两个世界中,偶有交集而已。 没错,普通人要有极好的运气,才能到达与败家富二代相同的高度。 对富人征税会改变财富分布吗?...是的,尽管最成功的玩家不一定是最努力的那个,但是努力的人大都混的还不错。感谢这个残酷世界还给我们留下一条生路。 看到这里,相信各位读者已经对这个问题有了自己的答案: 该如何面对这个残酷的世界?...对本话题感兴趣的读者请在知乎搜索问题“房间内有 100 人,每人有 100 块,每分钟随机给另一个人 1 块,最后这个房间内的财富分布怎样?”查看更多精彩答案。

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    Objective-C中的继承和多态

    子类具有父类的属性和 行为,以及自身的属性和行为,也就是说“父类更一般,子类更具体”。用一个富二代的类来说明一下类的继承。  ...,富二代和富人有许多相似的属性和方法所以富二代继承于富人类,并添加相应的属性和方法,把需要重写的方法进行重写。             ...代码说明:                 1.为富二代类添加新的爱好属性                 2.为富二代添加新的方法 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15...在 OC中动态类型id是实现多态的一种方式,id是一个独特的数据类型,可以转换为任何数据类型,上面的富人和富二代可以这样定义 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 id richer = nil;...  //测试富人类 richer = [Richer richerWithName:@"Bill" AndAge:40 AndGender:@"Man"]; [richer poss];   //测试富二代的类

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    数学建模---包汤圆问题引发的思考

    ,但是我对于这个始终没有一个很清晰的理解,今天是通过这个包汤圆的问题深刻的体会了这个步骤; (3)下面会先总结一下今天的这个数学建模的学习,再和大家简单的聊一聊这个包汤圆的问题; 2.感受 (1)我是今天上午学习这个数学建模...,就是有这个一盆馅和一坨面团,这个面团把这个馅全部用完,可以包出来100个汤圆,现在这个面团不变,但是这个馅变多了,这个肯定就需要我们进行这个调整,现在的问题就是是多包几个还是少包几个; (2)这个问题是什么意思了...,就是这个馅变多了,我们原来是包了100个汤圆,我们现在可以包110个,这样就可能会把这个馅使用完,我们也可以包90个,这样每一个汤圆大一些,也可以把这个汤圆用完,现在问题就是多包几个还是少包几个汤圆,...看似这个问题两个方式都可以,但是实际上这个问题的答案就是确定的,答案就是少包几个,为什么会这样呢,我们可以分析一下; (3)按照上面的这个步骤,我们首先就是把这个问题转化为这个数学问题,怎么转化,这个也是数学建模需要的一种能力...,这个商城进行活动,一大瓶药膏和多个小瓶牙膏,我们如何进行选择,这个问题本质上和这个包汤圆的问题是没有本质的区别的,这个就可以把我们建立的模型推广到有关的问题里面去,解决这一类问题,而不是一个问题; (

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    一个客户的丢包问题

    如果上述测试发生丢包现象,则说明故障是由线路供应商提供的线路引起的,需要与线路供应商联系尽快解决问题。    ...由物理线路引起的丢包现象还有很多,如光纤连接问题,跳线没有对准设备接口,双绞线及RJ-45接头有问题等。...我发现一交换机端口的光纤模块故障造成的丢包现象,该交换机在通信一段时间后死机,即不能通信,重启后恢复正常。在经过一段时间观察后发现,某光纤模块存在问题,取一块新的模块替换,一切正常。...应用中遇到的造成网络拥塞的情况还有很多,如大量的UDP流量,可以用解决spoof attack的步骤解决此问题。大量的组播流、广播包穿越路由器,路由器配置了IP NAT并且有很多DNS包穿越路由器等。...但此类丢包属于正常情况下的丢包,是意料之中的,不会对网络造成影响。

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