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我需要为一个名为riquesa1的数据框计算物种丰富度，它由13个变量(物种)和59个观察值(每个物种在总样本中的频率)组成。我通过下面的代码使用富包中的富函数： rich(matrix = riquesa1, verbose = FALSE, nrandom = NULL) 然而，当我运行这个函数时，我得到了这个错误： Errorin if (S[is] == 0) next : missing value where TRUE&#
浏览 9提问于2020-04-02得票数 0
我有一个奇怪的问题，我将几个具有不同物种丰度数据的数据帧组合在一起。我使用rbind.fill()来整理数据帧，但是类似物种的一些列名的拼写略有不同，因此，对于几个物种，我有2-3列。有谁知道可以将这些列中的数据合并在一起的方法吗？简单的例子： Sp.a=c(1,2,3,4,5,NA,NA
浏览 0提问于2013-10-31得票数 0
我有一大块，当我用标准针织品编织到pdd的时候，就像我期望的那样：title: "Test table"date: "February 20FALSE}软件<-结构(X=结构(c(9L，5L，7L，4L，1L，8L，6L，2L )，“建于反应区”、“多物种丰度”、“多物种单季占用”，
“优先区域选择”、“单一<e
浏览 3提问于2017-02-21得票数 1
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这是我第一次使用R，所以如果这个问题措辞不正确，请原谅我。我有一个导入到R中的.csv文件，我试图总结一些数据。如果在给定的年份、研究地点、区域和每一栏中，每一行数据都有现有物种的数量。每个物种有4列，因为有4次调查可以看到该物种。aggr
浏览 2提问于2015-11-13得票数 1
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我正在尝试使用包的spp.est函数，这个包在RStudio中被称为“化石”。我创建了一个名为"akimiskibb“的矩阵，它由丰富的数据组成，以物种为列，站点为行。当我尝试使用函数spp.est时，我输入以下内容：问题的出现是因为我的丰富数据有大量的零
浏览 1提问于2018-10-30得票数 1
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我有一个有两列的df：SurveyID和Species。SurveyID=c(1,1,1,2,2,3,3,3)df=data.frame(cbind(SurveyID,Species))
我想在两种情况下删除重复: 1.使用相同的survey ID和NA Species的所有重复被
浏览 2提问于2019-07-25得票数 1
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R中的积累曲线(非Vegan)
、、、、
我不相信像Vegan这样的软件包会对此有所帮助，因为我不是在寻找物种积累曲线，而是需要根据丰度数据和植物物种的保守系数来计算度量标准(如果我错了，请纠正我！)我的示例数据集是一个矩阵，包含图、植物物种名称、丰度值和c值(保守主义系数)：
对于每个_n_th样本的1000个迭代，我需要构建一个矩阵，它将保存具有物种名称、丰度和c值的1000个迭代结果，然后从该样本中消除任何重复的<
浏览 4提问于2020-02-29得票数 2
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我试图用FD软件包估计功能多样性指数(FDiv、FDis和FEve)。数据集为297种，24个二元性状为矩阵x，物种X 76位点为矩阵。我无法运行dbFD()函数，因为我收到的物种名称在两个数据集中的顺序不同。但是，我检查了好几次。由于这个函数在Windows系统中有一些问题，所以我只是尝试运行另一个函数。我可以使用以下方法计算76个站点的FDis：FDis <- disp$FDis
但以下功能有问
浏览 4提问于2016-08-25得票数 1
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我试图使用植物样方数据的存在/缺失矩阵和同一样方的连续环境数据来进行CCA，使用R中的Vegan包，其中一些样方没有植物物种存在(样方的行充满0's)，但在另一个数据中确实有相应的环境数据。这项研究的背景是，环境数据是土壤中的金属浓度，在没有植物物种的情况下，土壤中的金属浓度通常很高，因此零物种的象限确实对数据有贡献，而不是误
浏览 2提问于2022-03-28得票数 1
如何获取变量Ticker等于"AA“的所有行？数据结构是tibble。我的数据存储在返点数据中，如下所示 Date Ticker CUR CON REBATERATE FEERATE AVAILABLE我想要那排的票。
浏览 1提问于2019-07-06得票数 0
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如何根据列的组合选择行
、、、
我有以下数据框：1, 1, 1), Cu = c(NA, NA, 1, NA)), .Names = c("Species", "Ni", 我想得到一个包含Ni=
浏览 1提问于2012-11-05得票数 0
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我正在尝试使用R包"ENMTools“和函数"enmtools.ecospat.id”比较几个物种。是要比较的物种，环境点是代表其环境的两个变量。species.from.file“的工作原理是，它不是为每个物种创建一个对象，而是接受一个包含许多物种的.csv文件，因此没有必要单独加载每个物种。(x) enmtools.ecospat.id(x, x, env[[c("pc1"
浏览 3提问于2021-07-14得票数 0
第一列是每个标本所属的物种的名称(在整个数据帧中有许多属于同一物种的标本)，第二列BIN是每个物种的一种ID号，然后我有每个标本的收集者的名称，它是从哪个国家收集的，还有一个我想要填充的空列等级。，基本上一个物种只能有一个或多个BIN，并且相同的BIN偶尔可以分配给不同的物种。因此，我尝试做的是填充该列，为分配
浏览 14提问于2019-06-06得票数 0
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我有一个数据帧，其中有几列具有相似的信息，我想将它们折叠到更少的列中。这看起来与pivot_long或gather的正常使用有点不同，我被卡住了。我的第一个想法是创建3个独立的集合和行绑定..但我认为这里有人会有一个更优雅的解决方案！, NA, NA,NA, NA, NA, NA, "bird"))Pic
浏览 5提问于2020-05-30得票数 1
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，问题是建议将等级分配给该物种的每个样本。我遇到的问题是，属于同一物种的一些行具有不同的等级，特别是在等级"C“和"E”的情况下。因为如果一个物种具有"E“级，则具有该物种名称的其他行也应该具有"E”级。))) ))))
assign('fish19
浏览 15提问于2019-06-20得票数 0
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我已经在R上加载了labdsv包，并且正在尝试运行indval以下代码：
我已经检查过几次，没有任何数据的物种(即全部0)在我的表中被删除了)。
浏览 2提问于2016-07-28得票数 0
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你好，亲爱的堆栈溢出社区， 这是我的问题的背景:我有一个数据帧，每列对应一个蝙蝠物种，每行对应一个晚上测量的声音活动(对于记录的每个晚上，并不是所有的物种都被采样)。为了研究发声活动，我正在检查每种蝙蝠发声活动的分位数 apply(Dataset[,9:15],2,quantile, na.rm=TRUE, type=7, c(0.02,0.25,0.5,0.75,0.98更具体地说，如果我使用1000个随机样本进行
浏览 18提问于2021-10-19得票数 0
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综上所述，我的数据如下所示：Parrot Parrot 3 NA NA Duck 69 16
我在这里试图做的是折叠或合并在物种列上有重复的行，同时保留那些具有NA的
浏览 2提问于2021-07-03得票数 1
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我有一个包含多个物种的536个DNA序列的FASTA文件，但它不一定是按照物种名称排列的。我的头和序列看起来像AATC
>INRMA1514-14|NA|Agabus|thomsoni我需要所有的物种名称一起出现在我的FASTA文件中，以及我的数据集中的所有其他物种</e
浏览 0提问于2023-01-24得票数 1
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我最初的问题可以在这里(Automating a ggplot for each level in a group)看到，但我想我会问不同的问题，让它有很多不同的方式来回答这个问题，而不是一个“如何”的问题来解决我糟糕的尝试。我想让创建像下面这样的时间序列图的过程更快/自动(即，不需要用户一次输入一个物种名称)。也许可以使用"if“循环。它告诉R循环遍历数据中所
浏览 11提问于2021-09-07得票数 0
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