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(数据科学学习手札03)Python与R随机数生成异同

随机数使用是很多算法关键步骤,例如蒙特卡洛法、遗传算法中轮盘赌法过程,因此对于任意一种语言,掌握其各类型随机数生成方法至关重要,Python与R随机数底层生成都依靠梅森旋转(twister...)来生成高质量随机数,但在语法存在着很多异同点。...random中内置各种随机数生成方法,下面针对其中一些常见举例说明: 1.random.random_sample()与random.random() 生成[0,1]之间服从均匀分布浮点随机数...random.randint(1,10,5) Out[29]: array([2, 9, 8, 8, 9]) R 作为专为统计而生一种语言,R随机数生成上自然是异常丰富,这里仅举常用一些随机数生成函数...3.1511841 0.3385417 3.sample() 以不放回方式生成指定范围内随机整数序列 > sample(1:10,5,replace=T)#有放回 [1] 4 9 3 4 4 >

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R语言ggplot2画热图时候色块添加文本

今天推文没有详细介绍代码,代码介绍会以视频形式放到B站,欢迎大家关注我B站 小明数据分析笔记本 https://space.bilibili.com/355787260 image.png 首先是示例数据格式...画热图数据 image.png 用来添加文本数据 image.png 如果还有其他文本需要添加,可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到R包 library(ggplot2...) library(tidyverse) #install.packages("see") library(see) ggplot2 是用来作图 tidyverse 是用来做数据整理 see 这个包里有很多配色函数...小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记...今天推文示例数据和代码可以在后台留言20211007获取

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(数据科学学习手札02)Python与R循环语句与条件语句异同

循环是任何一种编程语言基本设置,是进行批量操作基础,而条件语句是进行分支运算基础,Python与R有着各自不同循环语句与条件语句语法,也存在着一些相同地方。...循环对集合进行遍历''' set1 = set([i for i in range(10)]) for i in set1: print(i) 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 '''for循环列表解析中应用...())) now = random.randint(1,10,1) if now >= 5: print('big') else: print('small') big 4.列表解析中if...语句 '''利用条件列表解析生成指定范围内所有偶数 list = [i for i in range(10) if i%2 == 0] print(list) [0, 2, 4, 6, 8] 5.条件表达式...list[i]%2 == 0,print('偶数'),print('奇数')) 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 偶数 奇数 R

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ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

R具有强大统计计算功能和便捷数据可视化系统。目前R主要支持四套图形系统:基础图形(base)、网格图形(grid)、lattice图形和ggplot2。...其中ggplot2凭借强大语法特性和优雅图形外观,逐渐成为R中数据可视化主流选择。...书中绝大多数绘图案例都是以强大、灵活制图而著称Rggplot2实现,充分展现了ggplot2生动、翔实一面。...本文根据《R数据可视化手册》整理ggplot2图形参数(图形外观、注解、图例、坐标轴、分面、配色)。...scale_x_log10() # x轴为对数轴 scale_y_log10() # y轴为对数轴 4.8.2 对数坐标轴刻度标签 scale_x_log10(breaks=10^(-1:5)) # 值域过大会自动输出为科学记数法

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(数据科学学习手札55)利用ggthemr来美化ggplot2图像

一、简介   Rggplot2是一个非常强大灵活数据可视化包,熟悉其绘图规则后便可以自由地生成各种可视化图像,但其默认色彩和样式很多时候难免有些过于朴素,本文将要介绍ggthemr包专门针对原生...二、基础内容 2.1 安装   不同于常规R包,ggthemr并没有CRAN发布,因此我们需要使用devtools中install_github()直接从github安装它,参照github...这个语句,便可傻瓜式地载入各种精美的自适应绘图主题,ggthemr中也有类似的功能,我们利用ggplot2创建图像语句之前,加上ggthemr('主题名称'),便可简单套用多种内建主题,下面是几个简单例子...而官方文档中提到可以ggthemr_reset()来恢复ggplot2默认风格,但笔者经过实践发现这个函数并不能彻底抹除之前施加主题模式,因此这里不细说,读者们可以自行尝试; 三、自定义主题   尽管...因为我们demo主题中还设置了色彩梯度,下面我们绘制密度图(此例来自我(数据科学学习手札38)ggplot2基本图形简述): data <- data.frame(matrix(rnorm(200

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【数据科学】50+数据科学与机器学习速查表

在数据科学界,有着成千上万软件包和成百上千函数!一个激情澎拜数据爱好者没有必要掌握所有的。这里会包含大多数重要软件包和函数,能够让你在紧凑几页中集思广益并吸收知识。...精通数据科学需要掌握统计学、数学、编程知识,特别是R语言、Python语言以及SQL,然后有效组合使用这些知识,利用商业理解能力和人类本能(做出决策能力)去领悟。...ggplot2来做数据可视化似乎是最受欢迎,因为它可以帮助你将你实验结果绘制成结果图。...对于特定应用,如迭代式机器学习,Spark可以速度上比Hadoop(使用MapRedue)高出100倍。...Django是Python语言编写一个免费开源web应用框架。

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pandas数据读取问题记录

'20181016\t14830680298903273\n' with open('test.txt','r') as f: line = f.readline() print(line...) 我平时一直在用pandas去读数据,所以我很熟练写下来如下代码: pd.read_table('test.txt',header=None) 然后发现,第一列变成了科学记数法方式进行存储了...很明显,科学记数法是可以转换: def as_number(value): try: return '{:.0f}'.format(value) except:...,理论讲14830680298903273没有小数部分不存在四舍五入原因,网上搜了也没有很明确解释,初步讨论后猜测应该是pandas在用float64去存这种长度过长数字时候有精度丢失问题。...要解决也是很简单open形式打开,切割逐步去list进行append,合并 read_table函数时候,默认是float64去存在,改成object去存(dtype=object

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【学习】50+数据科学与机器学习速查表

在数据科学界,有着成千上万软件包和成百上千函数!一个激情澎拜数据爱好者没有必要掌握所有的。这里会包含大多数重要软件包和函数,能够让你在紧凑几页中集思广益并吸收知识。...精通数据科学需要掌握统计学、数学、编程知识,特别是R语言、Python语言以及SQL,然后有效组合使用这些知识,利用商业理解能力和人类本能(做出决策能力)去领悟。...ggplot2来做数据可视化似乎是最受欢迎,因为它可以帮助你将你实验结果绘制成结果图。...对于特定应用,如迭代式机器学习,Spark可以速度上比Hadoop(使用MapRedue)高出100倍。...Django是Python语言编写一个免费开源web应用框架。

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Python学习总结3--Python基础

十六进制表示:0X和 1-9,a-f表示    3. 浮点数    即小数,科学记数法表示。...浮点数可以数学方式表示,如1.3、-1.2.但是对于过大或过小小数,必须用科学记数法e代替10,1.2e-5    4. 字符串    字符串”或”“包起来字符。...如果字符串里面有很多字符都需要转义,就需要加很多\,为了简化,Python还允许r”表示”内部字符串默认不转义,可以自己试试: >>> print('\\\t\\') \ \ >>> print...(r'\\\t\\') \\\t\\ 如果字符串内部有很多换行,\n写在一行里不好阅读,为了简化,Python允许”’…”’格式表示多行内容,可以自己试试: >>> print('''line1...变量 变量概念基本和初中代数方程变量是一致,只是计算机程序中,变量不仅可以是数字,还可以是任意数据类型。

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机器学习研究和开发所需组件列表

线性代数: 机器学习开发人员需要数据结构,如向量,矩阵和张量,它们具有紧凑语法和硬件加速操作。其他语言例子:NumPy,MATLAB和R标准库,Torch。...概率论: 各种随机数据生成:随机数和它们集合; 概率分布; 排列; 收集,加权抽样等等。示例:NumPy和R标准库。...数据输入输出: 机器学习中,我们通常最感兴趣是以下列格式解析和保存数据:纯文本,CSV等表格文件,SQL等数据库,Internet格式JSON,XML,HTML和Web抓取。...还有很多特定于域格式。 数据争: 类似表数据结构,数据工程工具:数据集清理,查询,拆分,合并,改组等。Pandas,dplyr。 数据分析/统计: 描述性统计,假设检验和各种统计资料。...可视化: 统计数据可视化(非饼图):图形可视化,直方图,马赛克图,热图,树状图,3D表面,空间和多维数据可视化,交互式可视化,Matplotlib,Seaborn,Bokeh,ggplot2,ggmap

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做数据分析,Python和R究竟哪个更强?

R Studio等流行开源集成开发环境(IDE)都可以用来运行R语言。 作为统计学专业的人,我承认Stack OverflowR语言有非常强大用户群体。...科学习期间,我遇到许多R相关问题都可以Stack OverflowR语言标签找到答案。如果你刚开始学习R语言,Coursera等在线课程都有提供R以及Python初级课程。...可视化 Python和R都具有出色可视化库。由R Studio首席科学家Hadley Wickham创建ggplot2 如今是R历史上最受欢迎数据可视化软件包之一。...我非常喜欢ggplot2各种功能和自定义。与基础R图形相比,ggplot2允许用户更高抽象级别自定义绘图组件。...ggplot2日历热图(左上)、集群图(左下)和层次树图(右下) Python也有出色数据可视化库。Matplotlib及其seaborn扩展对可视化和生成统计图很有帮助。

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多种方法火山图上标记感兴趣基因(差异基因,或者通路)

要玩图,离不开哈德雷大神ggplot2,《R数据科学》第1章和21章是专门讲图,我写过对应笔记: R数据科学--详解ggplot2 R数据科学--第21章 图形化沟通 完整R数据科学笔记目录(点击这里...方法二:看R数据科学 代码来源 以下代码出自R数据科学笔记第21章,原书第312页: best_in_class % group_by(class) %>% filter(row_number...这个方法适用于较大数据。 端详代码找思路 1.从原来数据中挑选了一部分,生成新数据 2.新数据作图,向原数据做点图上叠加两个图层,一个空心点图,一个geom_label_repel。...加号连接两句代码就实现了图层叠加,如果对ggplot2不了解,请看R数据科学第1章和第21章。但21章是整本书错误重灾区,请看我笔记有改正后代码。...方法三:ggpubr函数有现成参数 这个函数叫ggscatter,还是刚才test数据来做。 代码来源 当然是群主GitHub800MGEO数据挖掘代码啦,还有配套视频: ?

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R for data science (第一章)①Chapter1 使用ggplot2进行数据可视化

- John Tukey 本章将教您如何使用ggplot2可视化您数据。 R有几个用于制作图形系统,但ggplot2是最优雅和最通用系统之一。...它还告诉您tidyverse中哪些函数与基本R(或您可能已加载其他包)中函数冲突。...mapping参数始终与aes()配对,aes()x和y参数指定要映射到x和y轴变量。 ggplot2data参数中查找映射变量,本例中为mpg。...如果外围点是混合动力车,它们应该归类为紧凑型轿车,或者可能是微型汽车(请记住,这些数据是在混合动力卡车和SUV变得流行之前收集)。...ggplot2还将添加一个图例,说明哪些级别对应于哪些值。 颜色显示许多不寻常点是双座汽车。这些车似乎不像混合动力车,实际是跑车!

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关于 IEEE 754 浮点数一些设计细节疑问解释

计算机系统课程讲到 IEEE 754 32位浮点数一些规则细节个人理解与解释。 老师课上已经把各个细节都大致讲过了,这篇文章是给课后对这些细节还感兴趣同学,做补充解释和扩展。...,二进制表示就是 -110.101,那么使用浮点数表示 6.625 的话,内存中实际存储比特位是这个样子: 其实可以观察到,浮点数存储,本质就是二进制科学记数法:由一个有效数字(绿色部分),...其实 0 也是可以,但是这样其实就浪费了一个位精度了。 我们知道浮点数在内存中表示,其实就是二进制科学记数法。...0.365 * 10^5 => 3.65 * 10^4 二进制科学记数法也是一样,我们为了高效简介表达,也像十进制科学记数法一样,规定有效数字整数部分不能是 0(因为前导 0 是无效数字...也就是说,例如 111010 它二进制科学记数法是 1.11010 * 2^5 而不是 0.111010 * 2^6,因为这种表示不是最高效简介表示方法 但是专家们很快发现:既然都规定了科学记数法有效数字整数部分不能是

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107-R可视化31-利用ggplot延迟映射作图

参考: 第 31 章 ggplot2之延迟映射 | 数据科学 R 语言 (bookdown.org)[1] A ggplot2 Tutorial for Beautiful Plotting in...因此你可以凭借你心情,通过geom 或stat 创建你图形对象。 通常来说,数据框变量直接映射到图形元素,然后生成图片。...延迟映射三阶段 直接参考第 31 章 ggplot2之延迟映射 | 数据科学 R 语言 (bookdown.org) 中记录内容: 第一个阶段,拿到数据之后。...如果不考虑延迟计算的话,其实对于count 数值这种简单统计,[[65-R茶话会14-柱状图col还是bar,你可以省一点空间]] 我们就已经说过了。相当于绕过了stat 计算。...之延迟映射 | 数据科学 R 语言 (bookdown.org): https://bookdown.org/wangminjie/R4DS/tidyverse-ggplot2-aes-eval.html

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(数据科学学习手札57)ggplotly()美化ggplot2图像

一、简介   经常利用Python进行数据可视化朋友一定用过或听说过plotly这样神器,我(数据科学学习手札43)Plotly基础内容介绍中也曾做过非常详细介绍,其渲染出图像以浏览器为载体,...非常精美,且绘制图像自由程度堪比ggplot2,其为R也提供了接口,plotly包中,但对于已经习惯用ggplot2进行可视化朋友而言,自然是不太乐意转向plotly学习,有趣是plotly...R包中有着函数ggplotly(),可以将ggplot2生成图像转换为交互式plotly图像,且还可以添加上ggplot2原生图像中无法实现交互标签,最重要是其使用方法非常傻瓜式,本文就将结合几个小例子来介绍...可以观察到,经过ggplotly()处理后ggplot2图像通过R-studio中viewer窗口打开,即当前图像是网页文件,而随着我们鼠标的放置,可以保留原有ggplot2外观情况下,进行plotly...,接着利用plotly_build()函数(换成ggplotly()效果相同)来将原生ggplot2图像转化为交互图像,再利用style()来调整交互图像悬浮标签信息,效果如下图所示: ?

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字符串排序----高位优先字符串排序

一篇:低位优先字符串排序 高位优先字符串排序是一种递归算法,它从左到右遍历字符串字符进行排序。...本算法也是基于键索引记数法来实现。该算法核心思想是先使用键索引记数法根据首字符划分成不同子数组,然后递归地处理子数组,下一个字符作为键索引记数法键处理子数组。...这种转换意味着字符串中每个字符都有可能产生R+1个不同值:0表示字符串末尾,1表示字符串第一个字符,2表示字符串第二个字符......由于键索引记数法本来就需要一个额外位置,所以count[]数组应该定义为...//键索引记数法第二步 for(int r=0;r<R+1;r++) count[r+1]+=count[r]; //键索引记数法第三步...aux[]大小为N可以sort()方法外创建,如果牺牲稳定性,则可以去掉aux[]数组。但count[]所需要空间才是最需要关注(因为它无法sort()外创建)。

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那些不为人知优秀python可视化库

Echarts 生成图可视化效果非常好,pyecharts 是为了与 Python 进行对接,方便在 Python 中直接使用数据生成图。...ggplot和plotnine 对于R迁移过来的人来说,ggplot和plotnine简直是福音,基本克隆了ggplot2所有语法。 ggplot是基于Rggplot2和Python绘图系统。...R语言中ggplot2绘图包(geom_polygon)。...唯一不足是它是一个底层构建工具,所有的多边形映射都需要手动构造循环(目前还没有发现比较好用基于basemap扩展工具),作图效率与速度上自然无法媲美R语言ggplot2(缺少一套健全顶层语法支撑...使用pyqtgraph库绘制图形编程方法,前面一篇文章已经给了一个最简单例子以及一个连续刷新波形图例子,下面再给一个逐点刷新波形图例子。

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工具 | 如何在Python中调用R语言包?

首先需要安装Python科学计算环境Anaconda和R软件(最好再安装个Rstudio,好用到爆R软件IDE,安装和管理R包太方便了),安装好Anaconda和R软件后,系统命令提示符里输入:...这里是Anacondaconda install方法安装Python包,可不要小看了这个安装方法,如果pip install rpy2、easy install rpy2或者把rpy2包下载到本地使用...有人好受......conda install这个方法作者找了很久,至少百度介绍所有安装rpy2方法基本都会或多或少地报错。...如何使用ry2 (1)Python中加载R软件包 需要用到robjects中packages里面的importr函数,我们以Rstats包和ggplot2包为例,ggplot2R中超级强大绘图包...总结 本文主要介绍了利用rpy2包Python中访问R语言包和函数,其中最重要子包是robjects,可以生成R数据结构;最重要实例是rojects.r(' '),可以通过三种方式访问R数据和函数

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