前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子(factor) 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL(胆管癌)这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...】R中的因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息
数据分组,根据数据分析对象的特征,按照一定的数值指标,把数据分析对象划分为不同的区间部分来研究,以揭示内在的联系和规律性; 在R中,我们常用ifelse函数来进行数据的分组,跟excel中的if函数是同一种用法..." "(20,40]" "(0,20]" "(60,80]" "(80,100]" [15] "(0,20]" > newData <- data.frame(data, level) 数据分组后的结果
比如一张表里有如下时间字段的记录: 2009-01-01 12:00:00 2008-12-23 11:00:11 2009-12-22 11:22:0...
学习Excel技术,关注微信公众号: excelperfect 如下图1所示的工作表,我们想使用数字将数据分成几组,其标准是:第1次出现笔记本且在区域A至第2次出现笔记本且在区域A之间的数据为第1组,标识为...1;第2次出现笔记本且在区域A至第3次出现笔记本且在区域A之间的数据为第2组,标识为2,依此类推。...图1 在单元格E3中输入公式: =SUM(E2,AND(B3:B20=G3,C3:C20=H3)) 向下拉至单元格E20,结果如上图1所示。...在上图1所示的工作表中,单元格E3和E4返回的结果都为0,在单元格E5中,由于满足条件,因此AND函数返回TRUE(1),将其与上方单元格E4中的值相加,得到结果1。...小结:本文所讲述的技巧可用于构造辅助列,从而方便实现重复数据的查找。 欢迎在下面留言,完善本文内容,让更多的人学到更完美的知识。
- 问题 - 将左表整理成右表的样子 其中“其他”列里的个数不确定 - 解法 - 这个问题的解法其实并不复杂,但需要对分组的操作及其原理、基础函数的应用以及透视等内容比较熟悉,具体过程为...: 1、先按“啊”和“哦”列分组 2、修改分组中的公式实现给各组的内容加上索引列(原理可参考文章《用财务实战案例,理解分组依据的核心原理!》)...3、对分组的内容进行展开,然后透视索引内容成列即可。 具体操作过程如下动画所示:
举个例子:对以下数组按 lastName 的值进行分组分类 const listData = [ { firstName: "Rick", lastName: "Sanchez", size: 18...: "Rick", lastName: "Sanchez", size: 18 }, { firstName: "Morty", lastName: "Smith", size: 6 }, ]; 分组前...分组后: ?...}); return sorted; }; // 分组前 console.log(listData); // 分组后 console.log(sortClass(listData)); 二、...console.log(listData); // 分组后 console.log(sortClass(listData));
我相信大家经常会使用Excel对数据进行排序。有时候我们会按照两个条件来对数据排序。假设我们手上有下面这套数据,9个人,第二列(score)为他们的考试成绩,第三列(code)为对应的评级。...在Excel里面其实还是很容已实现的。我们只需要先根据code来进行升序排序,然后次要关键字再根据分数进行降序排序。 我们就会得到如下结果 那么这个过程怎么在R里面实现呢?...主要用的是R中的order这个函数。...#读入文件,data.txt中存放的数据为以上表格中展示的数据 file=read.table(file="data.txt",header=T,sep="\t") #先按照code升序,再按照Score...只需要前面加个负号就可以了 View(file[order(file$Code,-file$Score),]) 下面是按照code升序,然后再按score降序排列的结果,是不是跟Excel处理的结果一样 在R
---- 1.问题引出:默认情况下python交互界面的tab键 在linux下,或在路由器、交换机上,按tab键按得很爽,什么不完整的,tab一下都出来了,无奈,在linux中安装的python...,默认情况是没有tab功能的,也就是在python的交互界面中,tab是没有办法补全的,python的交互界面只是把它当作正常的多个空格补全来处理: xpleaf@py:~/seminar6/day1$...=====>按tab键,想看看sys的子模块,结果就是按出了一大堆空格键 是啊,这也太恶心了!没有tab键,宝宝不开心!...不过当时确实找了好多,都找不到一个在我自己的实验环境中可以使用的,总是提示各种错误!还好,总算让我找到一个可以使用的,下面直接给出tab.py的代码: #!...$ sudo mv tab.py /usr/lib/python2.7/ xpleaf@py:~/seminar6/day1$ ll /usr/lib/python2.7/tab.py -rw-rw-r-
img 其中test_1是一个包,在util.py里面想导入同一个包里面的read.py中的read函数,那么代码可以写为: from .read import read def util():...此时read.py文件中的内容如下: def read(): print('阅读文件') 通过包外面的main.py运行代码,运行效果如下图所示: ?...img 现在,我们增加一个数据文件,data.txt,它的内容如下图所示: ? img 并且想通过read.py去读取这个数据文件并打印出来。...这是因为并不是所有数据文件都是字符串,如果某些数据文件是二进制文件或者图片,那么以字符串方式打开就会导致报错。...此时如果要在teat_1包的read.py中读取data2.txt中的内容,那么只需要修改pkgutil.get_data的第一个参数为test_2和数据文件的名字即可,运行效果如下图所示: ?
这些问题都是在平日的工作中有很高可能性出现并且看似容易实则让人抓狂的问题,在Stackoverflow上他们有着很高的人气。事实上,这些问题也就是你在“看懂一本R的教材”和“成为R大神”之间的距离。...如果要自己寻找Stackoverflow上与R或是data.table相关的问题,可以在搜索栏输入[R] [data.table] Your question。 提 出问题 好啦,开始上课!...解 题思路 在解决本问题的过程中我们需要用到data.table包!...我们只要把数据按照fund_name分组,然后对每组求scale的均值。唯一需要注意的有两点。首先,别忘了mean中的na.rm = T参数,它能够让函数忽略缺失值。...本 期总结 本期大猫带领大家学习了如何在R中按照行进行处理。R的数据处理哲学是向量,是列,但这并不妨碍我们按照行进行处理,其中的关键,就在于运用 c() 函数把不同的向量拼接成一个向量。
所以在画图的时候,也需要区分这三类。下面这张表就是GO富集分析得到的结果,我们可以根据ONTOLOGY这一列来分组,就可以得到BP,CC和MF三个组。...那么问题来了,如何分组取前几行。今天小编就跟大家分享一个专业处理数据框的函数dplyr。然后基于这个R包,我们用6种不同的方法来实现。...,但是head并没有应用到三个分组上面,而是直接应用到了整个数据框上,事与愿违。...top_n这个函数来输出每个组的前五行,wt是排序的依据,根据校正之后的p值来排序,n=-5是按从小到大排序。...如果n=5,是按从大到小排序。
Finally I found out how to do this, I will explain it here for others facing sam...
一、前言 前几天在Python最强王者交流群【哎呦喂 是豆子~】问了一个pandas数据提取的问题,一起来看看吧。 大佬们请问下这个数据向上填充的时候 有没有办法按设置不在这个分组就不按填充?...她还提供了自己的原始数据。...这篇文章主要盘点了一个Pandas数据处理的问题,文中针对该问题,给出了具体的解析和代码实现,帮助粉丝顺利解决了问题。
<script language="JavaScript"> function KeyDown(){ if(!(event.shif...
参考链接: Python程序按字母顺序对单词进行排序 我想在文件内部按字母顺序排序。我当前执行此操作的代码不起作用,文件保持不变。这个程序本身就是一个基本的调查问卷,用来实验读写文件。...在import time import sys name = input("What is your first name?")....在
数据分组 根据数据分析对象的特征,按照一定的数值指标,把数据分析对象划分为不同的区间进行研究,以揭示其内在联系和规律性。...cut 函数: cut(series,bins,right=True,labels=NULL) ① series 需要分组的数据 ② bins 分组的划分数组 ③ right 分组的时候,右边是否闭合...,默认为闭合True ④ labels 分组的自定义标签,可以不自定义 import pandas data = pandas.read_csv( 'D:\\PDA\\4.15\\data.csv
同一组数据分组 需求:一个 list 里可能会有出现一个用户多条数据的情况。要把多条用户数据合并成一条。 思路:将相同的数据中可以进行确认是相同的数据,拿来做分组的 key,这样保证不会重。...实际中使用,以用户数据为例,可能用户名和身份证号是不会变的,用这两个条件拼接起来。
笔者寄语:apply族功能强大,实用,可以代替很多循环语句,R语言中不要轻易使用循环语句。...函数名 功能 特点 apply 按行、列运算均值、求和、众数等 简单运算 tapply=table apply 在apply之上加入table功能,可以分组汇总 table结合,可以分组汇总 lapply...tapply(1:4, fac, sum) 1 2 3 4 5 5 2 3 NA NA #当index不是因子时,可以用as.factor()把参数强制转换成因子 额外案例,实现excel中数据透视表的功能...在vapply函数中总是会进行简化,vapply会检测FUN的所有值是否与FUN.VALUE兼容, 以使他们具有相同的长度和类型。...输入应该单列,或者List格式的,整个多字节的数据框是不对的; 输出也只能是某一种形式,可以保存到list中的,比如此时的字符形式。 ———————————————————————————
要想在jupyter notebook中运行R语言其实非常简单,按顺序安装下面扩展包即可: install.package('repr','IRdisplay','evaluate','crayon',...devtools','uuid','digest') library(devtools) install_github("IRkernel/IRkernel") IRkernel::installspec() 在R...中执行上述四行代码,重新打开你的jupyternotebook即可看到对于R的支持标志: ?
char=`get_char` fi } 然后在需要暂停的地方,调用pause函数,参数是提示信息 比如 xxx pause "xxx ok" yyy pause "yyy ok" zzz 为了方便调试
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