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PyTorch 自定义数据读取方法

显然我们在学习深度学习时,不能只局限于通过使用官方提供MNSIT、CIFAR-10、CIFAR-100这样数据,很多时候我们还是需要根据自己遇到实际问题自己去搜集数据,然后制作数据(收集数据方法有很多...这里只介绍数据读取。 1....自定义数据方法: 首先创建一个Dataset类 [在这里插入图片描述] 代码: def init() 一些初始化过程写在这个函数下 def...len() 返回所有数据数量,比如我们这里将数据划分好之后,这里仅仅返回是被处理后关系 def getitem() 回数据和标签补充代码 上述已经将框架打出来了,接下来就是将框架填充完整就行了...mode=='train': self.images=self.images[:int(0.6*len(self.images))] # 将数据60%设置为训练数据集合

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spotBinning 空间数据应用

我们知道,空间分析中常见是解析每个spot细胞数,这是往细了做。而临近细胞放到一个bin获得概览,不仅是可视化方面,在数据大了之后,这种分箱操作可以减少维度。...今天我们就来看看spotBinning 空间数据应用,主角是:同属于Seurat生态schex ,起初,schex 拟解决单细胞转录组图谱(tsne/umap)细胞重叠问题。...Spatial_snn_res.0.8", type="counts", feature="Cck", action="mean")+theme_bw() 本文提出问题其实是空间数据如何重采样...单细胞转录组重采样的话,随机抽取就可以了,但是空间中如果随机抽取的话,势必把好不容易得到空间信息采稀烂。...,不信请看: Binning 空间数据应用: ---- References [1] High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue

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spotBinning 空间数据应用

我们知道,空间分析中常见是解析每个spot细胞数,这是往细了做。而临近细胞放到一个bin获得概览,不仅是可视化方面,在数据大了之后,这种分箱操作可以减少维度。...今天我们就来看看spotBinning 空间数据应用,主角是:同属于Seurat生态schex ,起初,schex 拟解决单细胞转录组图谱(tsne/umap)细胞重叠问题。...可以看到schexpca空间中将细胞点划分为不同区域,并计算了该区域细胞数。当然,如果我们把pca空间换成空间位置信息,自然也是可以做类似的操作。...本文提出问题其实是空间数据如何重采样? 单细胞转录组重采样的话,随机抽取就可以了,但是空间中如果随机抽取的话,势必把好不容易得到空间信息采稀烂。...其实空间数据获得本身就是空间位置分箱采样过程,不信请看: ? Binning 空间数据应用: ?

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Python按路径读取数据文件几种方式

img 其中test_1是一个包,util.py里面想导入同一个包里面的read.pyread函数,那么代码可以写为: from .read import read def util():...img pkgutil是Python自带用于包管理相关操作库,pkgutil能根据包名找到包里面的数据文件,然后读取为bytes型数据。...如果数据文件内容是字符串,那么直接decode()以后就是正文内容了。 为什么pkgutil读取数据文件是bytes型内容而不直接是字符串类型?...此时如果要在teat_1包read.py读取data2.txt内容,那么只需要修改pkgutil.get_data第一个参数为test_2和数据文件名字即可,运行效果如下图所示: ?...所以使用pkgutil可以大大简化读取包里面的数据文件代码。

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PyTorch构建高效自定义数据

我特别喜欢功能是能够轻松地创建一个自定义Dataset对象,然后可以与内置DataLoader一起训练模型时提供数据。...列表,然后遍历每个种族(race)文件夹和性别文件并读取每个文件名称来填充该列表。...为了抛出DataLoader曲线球,我们还希望返回数字本身,而不是张量类型,是作为Python字符串返回。__getitem__函数将在一个元组返回三个异构数据。...数据将具有文件名列表和图像目录路径,从而让__getitem__函数仅读取图像文件并将它们及时转换为张量来进行训练。...您可以GitHub上找到TES数据代码,该代码,我创建了与数据同步PyTorchLSTM名称预测变量(https://github.com/syaffers/tes-names-rnn

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Istio 实现 Redis 集群数据分片、读写分离和流量镜像

利用 Istio 和 Envoy ,我们可以不修改客户端代码前提下实现客户端无感知 Redis Cluster 数据分片,并提供读写分离、流量镜像等高级流量管理功能。...通过应用服务器和数据库服务器之间加入一个 Redis 缓存层,可以减少应用服务器对数据大量读操作,避免数据库服务器大压力下响应缓慢甚至宕机风险,显著加强整个系统健壮性。...Redis 作为数据缓存原理如图所示: 一个小规模系统,上图所示单个 Redis 就可以很好地实现缓存层功能。...REPLICA: 只从 Replica 节点读取数据,由于 Master 到 Replica 数据复制过程是异步执行,采用该方式有可能读取到过期数据,因此适用于客户端对数据一致性要求不高场景...PREFER_REPLICA: 优先从 Replica 节点读取数据,当 Replica 节点不可用时,从 Master 节点读取。 ANY: 从任意节点读取数据

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自己数据上训练TensorFlow更快R-CNN对象检测模型

本示例,将逐步使用TensorFlow对象检测API训练对象检测模型。尽管本教程介绍了如何在医学影像数据上训练模型,但只需进行很少调整即可轻松将其适应于任何数据。...Roboflow对于小型数据是免费,因此在此示例,已经准备就绪!...鉴于此检测RBC和血小板时,可能不希望裁剪图像边缘,但是如果仅检测白细胞,则边缘显得不太重要。还想检查训练数据是否代表样本外图像。例如,能否期望白细胞通常集中新收集数据?...稍后对此进行更多说明),这意味着需要为TensorFlow生成TFRecords才能读取我们图像及其标签。...在这个例子,应该考虑收集或生成更多训练数据,并利用更多数据扩充。 对于自定义数据,只要将Roboflow导出链接更新为特定于数据,这些步骤将基本相同。

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Istio 实现 Redis 集群数据分片、读写分离和流量镜像

利用 Istio 和 Envoy ,我们可以不修改客户端代码前提下实现客户端无感知 Redis Cluster 数据分片,并提供读写分离、流量镜像等高级流量管理功能。...通过应用服务器和数据库服务器之间加入一个 Redis 缓存层,可以减少应用服务器对数据大量读操作,避免数据库服务器大压力下响应缓慢甚至宕机风险,显著加强整个系统健壮性。...Redis 作为数据缓存原理如图所示: ? 一个小规模系统,上图所示单个 Redis 就可以很好地实现缓存层功能。...本文后续部分,我们将介绍如何通过 Istio 和 Envoy 来管理 Redis Cluster,实现客户端无感知数据分区,以及读写分离、流量镜像等高级路由策略。...REPLICA: 只从 Replica 节点读取数据,由于 Master 到 Replica 数据复制过程是异步执行,采用该方式有可能读取到过期数据,因此适用于客户端对数据一致性要求不高场景。

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优化 SwiftUI List 显示大数据响应效率

创建数据 通过 List 展示数据 用 ScrollViewReader 对 List 进行包裹 给 List item 添加 id 标识,用于定位 通过 scrollTo 滚动到指定位置...使用了 id 修饰符相当于将这些视图从 ForEach 拆分出来,因此丧失了优化条件。 总之,当前在数据量较大情况下,应避免 List 对 ForEach 子视图使用 id 修饰符。...由于 id 修饰符并非惰性修饰符( Inert modifier ),因此我们无法 ForEach 仅为列表头尾数据使用 id 修饰符。...如果在正式开发面对需要在 List 中使用大量数据情况,我们或许可以考虑下述几种解决思路( 以数据采用 Core Data 存储为例 ): 数据分页 将数据分割成若干页面是处理大数据常用方法,...获取若干最新数据,将数据逆向添加入数组 列表显示后率先移动到最底端(取消动画) 通过 refreshable 调用下一批数据,并继续逆向添加入数组 用类似的思路,还可以实现向下增量读取或者两端增量读取

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Oracle,如何正确删除表空间数据文件?

TS_DD_LHR DROP DATAFILE '/tmp/ts_dd_lhr01.dbf'; 关于该命令需要注意以下几点: ① 该语句会删除磁盘上文件并更新控制文件和数据字典信息,删除之后数据文件序列号可以重用...② 该语句只能是相关数据文件ONLINE时候才可以使用。...PURGE;”或者已经使用了“DROP TABLE XXX;”情况下,再使用“PURGE TABLE "XXX表回收站名称";”来删除回收站该表,否则空间还是不释放,数据文件仍然不能DROP...需要注意是,据官方文档介绍说,处于READ ONLY状态空间数据文件也不能删除,但经过实验证明,其实是可以删除。...OFFLINE FOR DROP命令相当于把一个数据文件置于离线状态,并且需要恢复,并非删除数据文件。数据文件相关信息还会存在数据字典和控制文件

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MNIST数据上使用PytorchAutoencoder进行维度操作

这将有助于更好地理解并帮助将来为任何ML问题建立直觉。 ? 首先构建一个简单自动编码器来压缩MNIST数据。使用自动编码器,通过编码器传递输入数据,该编码器对输入进行压缩表示。...为编码器和解码器构建简单网络架构,以了解自动编码器。 总是首先导入我们库并获取数据。...用于数据加载子进程数 每批加载多少个样品 准备数据加载器,现在如果自己想要尝试自动编码器数据,则需要创建一个特定于此目的数据加载器。...请注意,MNIST数据图像尺寸为28 * 28,因此将通过将这些图像展平为784(即28 * 28 = 784)长度向量来训练自动编码器。...此外,来自此数据图像已经标准化,使得值介于0和1之间。 由于图像在0和1之间归一化,我们需要在输出层上使用sigmoid激活来获得与此输入值范围匹配值。

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轻轻松松R里面拿捏这130万单细胞数据

on-disk storage方法来读取和存储130万单细胞数据,然后Sketching这个方法可以从130万单细胞数据里面抽样但是还保留数据特性。...查看和读取130万单细胞数据(h5文件) 案例130万单细胞数据是10x公司在其官网提供,链接是:https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression...下面是对每个步骤解释: open_matrix_10x_hdf5: 从一个 10x Genomics HDF5 文件读取单细胞转录组数据。这个数据通常包含了单细胞测序原始计数信息。...write_matrix_dir: 将读取单细胞转录组数据写入指定目录。这一步目的可能是将数据存储磁盘上,以便后续分析。 open_matrix_dir: 从指定目录读取单细胞转录组数据。...这个时候还需要借助Sketching这个方法可以从130万单细胞数据里面抽样但是还保留数据特性,首先读取前面保存好R语言里面的rds文件: # Read the Seurat object,

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轻轻松松R里面拿捏这130万单细胞数据

on-disk storage方法来读取和存储130万单细胞数据,然后Sketching这个方法可以从130万单细胞数据里面抽样但是还保留数据特性。...查看和读取130万单细胞数据(h5文件) 案例130万单细胞数据是10x公司在其官网提供,链接是:https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression...下面是对每个步骤解释: open_matrix_10x_hdf5: 从一个 10x Genomics HDF5 文件读取单细胞转录组数据。这个数据通常包含了单细胞测序原始计数信息。...write_matrix_dir: 将读取单细胞转录组数据写入指定目录。这一步目的可能是将数据存储磁盘上,以便后续分析。 open_matrix_dir: 从指定目录读取单细胞转录组数据。...这个时候还需要借助Sketching这个方法可以从130万单细胞数据里面抽样但是还保留数据特性,首先读取前面保存好R语言里面的rds文件: # Read the Seurat object,

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Python 大数据正态分布应用(附源码)

前言 阅读今天分享内容之前,我们先来简单了解下关于数学部分统计学及概率知识。...通过下图所示,可初步了解下正态分布图分布状况。 图中所示百分比即数据落入该区间内概率大小,由图可见,正负一倍sigmam 内,该区间概率是最大。...、all_data_list:数据列表,相当于Pythonlist (4)、singal_data:all_data_list单个元素 下图为 excel 大量数据: 重点代码行解读 Line3...-6:读取 excel 表每列数据并转成 list 集合 Line7:删除 excel 每列最后一行值 Line9-10:判断如果某列值完全一样,则赋值一个固定字符串,供调用方判断时使用 Line12...:对 list 所有数据进行反转,且由小到大排序 Line13-17:目的是将 list 除了为“nan”数据全部放置于另一个list Line20-24:利用numpy函数求出箱型图中四分之一和四分之三分位

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数据科学学习手札58)R处理有缺失值数据高级方法

一、简介   实际工作,遇到数据带有缺失值是非常常见现象,简单粗暴做法如直接删除包含缺失值记录、删除缺失值比例过大变量、用0填充缺失值等,但这些做法会很大程度上影响原始数据分布或者浪费来之不易数据信息...,因此怎样妥当地处理缺失值是一个持续活跃领域,贡献出众多巧妙方法,不浪费信息和不破坏原始数据分布上试图寻得一个平衡点,R中用于处理缺失值包有很多,本文将对最为广泛被使用mice和VIM包中常用功能进行介绍...matshow,VIM包matrixplot将数据框或矩阵数据缺失及数值分布以色彩形式展现出来,下面是利用matrixplot对R自带airquality数据进行可视化效果: rm...如上图所示,通过marginplot传入二维数据框,这里选择airquality包含缺失值前两列变量,其中左侧对应变量Solar.R红色箱线图代表与Ozone缺失值对应Solar.R未缺失数据分布情况...logistic, glmer 2lonly.mean numeric Level-2 class mean 2lonly.norm numeric Level-2 class normal   面对数据具体情况时

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神经反馈任务同时进行EEG-fMRI,多模态数据集成大脑成像数据

第一种方法,从一种方法中提取信息被集成或驱动第二种方法分析,而在对称方法(数据融合),使用联合生成模型。这些方法探索很少,神经血管耦合复杂性是他们主要局限性。 ?...XP2进行NF训练期间平均EEG ERD时频图(N = 18个受试者) 据研究人员表示,神经网络循环中同时进行脑电图-功能磁共振成像只有另一个研究小组,用于训练情绪自我调节:因此,我们在这里分享和描述数据...它由64通道脑电图(扩展10-20系统)和功能性核磁共振数据同时获得一个运动图像NF任务,辅以结构核磁共振扫描。研究中进行了录音。...据研究人员表示,NF循环中同时进行EEG-fMRI训练以训练情绪自我调节研究团队较少,只有另一个研究小组,而他们共享和描述数据对应于双峰NF首次实现运动想象任务。...它由在运动想象NF任务期间同时获取64通道EEG(扩展10–20系统)和fMRI数据组成,并辅以结构MRI扫描。研究中进行了记录。

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使用ScottPlot库.NET WinForms快速实现大型数据交互式显示

前言 .NET应用开发数据交互式显示是一个非常常见功能,如需要创建折线图、柱状图、饼图、散点图等不同类型图表将数据呈现出来,帮助人们更好地理解数据、发现规律,并支持决策和沟通。...本文我们将一起来学习一下如何使用ScottPlot库.NET WinForms快速实现大型数据交互式显示。...ScottPlot类库介绍 ScottPlot是一个免费、开源(采用MIT许可证)强大.NET交互式绘图库,能够轻松地实现大型数据交互式显示。...将FormsPlot (ScottPlot.WinForms)从工具箱拖到窗体: 输入以下代码: public partial class LineChart : Form {...double[] logYs = ys.Select(Math.Log10).ToArray(); //将对数缩放数据添加到绘图中 var sp =

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