p=6400 众所周知，调整一个或多个基线协变量可以增加随机对照试验中的统计功效。...调整分析未被更广泛使用的一个原因可能是因为研究人员可能担心如果基线协变量的影响在结果的回归模型中没有正确建模，结果可能会有偏差。 建立 我们假设我们有关于受试者的双臂试验的数据。...在一些情况下，基线协变量可以是在随访时测量的相同变量（例如血压）的测量值。 错误指定的可靠性 我们现在提出这样一个问题：普通最小二乘估计是否是无偏的，即使假设的线性回归模型未必正确指定？
pwd=y4eh 那在我们的scRNA_scripts文件夹中有个qc.R的质控脚本文件，就是对读取进来的数据进行质控的。...我们还是先重点看看nFeature_RNA和nCount_RNA #qc.R脚本中nFeature_RNA和nCount_RNA部分内容 feats <- c("nFeature_RNA", "nCount_RNA...5和min.features = 300进行过滤，所以在qc脚本中是不进行这一步的过滤操作的。...细胞降维聚类分群中应用 在选择对应的阈值进行可视化的时候，我们会用到check-all-markers.R脚本，基于常见Marker基因进行一下可视化，以及绘制umap图 在check-all-markers.R...线粒体比例 在官网以及我们的标准质控流程中，都会计算线粒体比例 我们的qc.R脚本中还对核糖体以及血红细胞的比例进行了计算和可视化，那下期一起来了解一下这些内容吧！
跨境独立站，面向的是全球国家，每个国家都有自己的语言，譬如：英语，德语，法语，俄语，西班牙语，葡萄牙语，韩语，日语，阿拉伯语，越南语，缅甸语，等等。每个国家通常使用自己的语言搜索和浏览网站。...符合目标用户的搜索习惯提升SEO排名母语搜索更精准更有亲和力，吸引本土采购商彰显公司实力避开英语网站竞争跨境电商独立站实现多语言的难点1.需要系统功能支持目前的saas系统大多数不支持多语言，因为他们的核心是卖店铺...模板装修用户自定义文字翻译，首页meta信息翻译，菜单翻译等等3.语言文字内容翻译对于跨境独立站的内容，譬如产品数据，如果我们只有英文，人工翻译成13种其他的语言，这势必需要非常大的开销，如果手动复制粘贴到google翻译中手动翻译...api，自动将商品的默认语言，翻译成15种其他的语言，你可以提交批量自动翻译任务，将您的所有的商品，分类，菜单，等业务数据翻译成相应的语言您只需要将翻译引擎api配置好即可提交批量翻译任务批量翻译数据任务脚本跑完后...四：同一个页面的多个不同语言，在seo方面的优化
作者在文章中比较好的就是把分析的整体思路进行了流程图的绘制，可以在自己用哪个部分的时候去找相关的代码进行改写。...图片代码解析scRNA-seq processing workflow在处理完每个患者肿瘤样本后，我们运行以下脚本，将患者 1-5 的 Seurat 对象组合成一个代表患者 1-5 的 EEC 队列的多样本...此脚本的起始输入是单个患者 Seurat 对象。输出是一个完全处理的多样本（EEC 群组）Seurat 对象。.../rowr.R")source("....这个在分析中也经常会碰到，先做一个整体的分析，然后将自己需要的那一个类群分出来，然后在对这一类的群体进行细分。
今天的主要内容是绘图，包含ggplot2、ggpurb和patchwork开头一个小tips：在运行R project时，界面上最好每次只有一个脚本，否则不同脚本之间流程、变量容易混乱1.强悍的ggplot2library...，重复叠加在一起，不能看清实际的样本数两种操作方法：在geom_xxx()中增加position = "jitter"的参数，或者选用geom_jitter()代替geom_point()函数ggplot...保存（当然也包括ggpurb）已经在右下角画板里展示的的，就ggsave('文件名')，注意要写上文件名后缀，如jpeg、png等右下角画板没有的，可以ggsave(p,filename = "iris_box_ggpubr.png...'test.jpeg')，注意文件的后缀名和函数必须一致2.写作图代码，注意基础包画图，不同的函数连接不需要加“+”3.dev.off()方法3：eoffice包可以导出为ppt格式，打开相应的ppt时可右键取消组合...R package分享1.好看的配色R包：RcolorBrewer以及paletter2.方便的拼图R包：patchwork最后一个无聊的分享library(ggplot2)ggplot(data =
---- 具体安装和配置流程如下（机器翻译）： Anbox或Box中的Android是一个免费的开源工具，允许在Linux上运行Android应用程序。...为了更容易在Anbox上安装Google Play商店和Google Play服务，并让它支持ARM应用程序和游戏（使用libhoudini），geeks-r-us.de（链接文章是德语）的人创建了一个自动执行这些任务的脚本...在使用它之前，我想明确指出，即使在集成libhoudini用于ARM支持之后，并非所有Android应用程序和游戏都能在Anbox中运行。...此外，请确保anbox.appmgr在安装Anbox之后和使用此脚本之前至少运行一次，以避免遇到问题。另外，确保在执行下面的脚本时Anbox没有运行（我怀疑这是导致评论中提到的这个问题的原因）。...在Debian，Ubuntu或Linux Mint中，使用此命令安装所需的依赖项： sudo apt install wget lzip unzip squashfs-tools 2.下载并运行脚本，在
例程，即Fomula，是使用在销售、采购、发票、交货等单据中定价过程的一小段程序。...我们可以在例程中编写代码片段，修改运行环境中的数据。具体的每种例程都有不同的环境变量和接口数据。 这里我们以mm物料模块的采购订单的 增强 为例。...表示这段代码不起作用 SY-SUBRC = 0.表示这段代码起作用 FORM KOBED_XXX 检查Item信息 FORM KOBEV_XXX 检查Header信息 2、选中新建记录的活动的那个单选框...，再点菜单：编辑->激活例程 激活例程时，RV61A701被INCLUDE 在RV61ANNN，即在RV61ANNN中添加一行：INCLUDE RV61A701 3、spro进入后台 选中'过程...'双击 将刚才新建的701例程配置到物料模块采购的计算方案中，保存 4、在开发机测试 me21n创建ZB等类型的采购订单时，ZRA4条件类型不起作用 5、例程传输到生产机时，发现订单无法调用计算方案进行正确计算商品价格
SAP MM 采购申请中的物料组字段改成Optional？ 众所周知，标准SAP系统里，ME51N创建采购申请界面里，物料组字段是必输字段。...于是第一时间想到去修改采购申请单据的屏幕格式，却发现，标准SAP系统设置里，无论是NBB字段选择组还是ME51N字段选择组，物料组字段已经是Optional的！ 在字段选择组NBB里， ?...在字段选择组ME51N里， ? 可是在ME51N创建非物料号的采购申请的界面里，material group确是一个必输字段， ? 由此可见，屏幕格式里的物料组字段的设置，并不起作用。...采购申请屏幕格式里物料组字段的配置，真的不起作用？笔者很好奇，试着将相关字段选择组里material group字段弄成Display的，看看效果如何。...所以，采购申请屏幕格式中的物料组字段的配置，还是起作用的。只不过是不能实现该字段既可以修改，又同时不是必输字段的双重目标。 2018-05-17 晚写于上海市
[111-R可视化35-结合grid与ggplot输出]] 与[[116-R可视化36-把你长长的坐标轴弄短]] 中，我们提过：通过pushViewport控制画布位置的方法，我们可以画出： 但美中不足的一点是...，因为其并非是在一个ggplot 图层上操作，就没有办法使用ggsave 的方法了。...虽然在draw_plot 方法中写道： ★Places a plot somewhere onto the drawing canvas....[108-R可视化32-通过seurat包中的LabelClusters学习ggplot之一]] 我就探索过cowplot 与patchwork 拼图后的对象。...能用ggsave 了 因为是ggplot 对象，就可以用ggsave了： > class(pp_patch) [1] "patchwork" "inset_patch" "gg"
消息设计 消息设计定义了特定消息类型（如发票或采购订单）的结构，以及使用了规定语法中的哪些规则子集。 识别值 识别EDI文件中的值的方式，例如通过其在文件中的位置或分隔符。这些变化因标准而异。...TRADACOMS主要是为英国国内贸易设计的（尤其是在零售业中很受欢迎），由26个消息组成的层次结构。与EDIFACT一样，每个消息代码也是6个字母。 TRADACOMS不使用单一的消息格式。...例如，一个采购订单通常包含一个订单头部（ORDHDR）、几个订单（ORDERS）和一个订单尾部（ORDTLR）。多个单独的订单消息可以在ORDHDR和ORDTLR之间重复。...由于在制定标准时并没有期望会在全球范围内使用，因此VDA标准都是以德语发布的，一直持续到今天。这可能会使解释变得困难，特别是涉及到德国的商业术语。...这些类别包括标前采购、标后采购、采购和运输。同时，UBL消息本身包括验证器、生成器、解析器和编写软件。 如何与交易伙伴交换不同的EDI文件格式？
熟悉 R 绘图的朋友肯定知道，在普通绘图中，图片的大小可以直接在 png() 和 pdf() 中指定，而绘图区大小则可以用 par() 中的 mar 或 mai 来指定。...但是在 ggplot2 中，图片大小依然可以在 png 和 pdf 中设定，但是边界大小， par 函数似乎就不奏效了。...至今天探索，才发现原来这个参数隐藏在 theme 中，其名为 plot.margin 。 1....factor(cyl))) + guides(color=F) p <- p + theme_solarized(light=FALSE) + scale_colour_solarized('blue') ggsave...theme_solarized(light=FALSE) + scale_colour_solarized('blue') p <- p + theme(plot.margin=unit(rep(1,4),'cm')) ggsave
本专题将针对10X Genomics单细胞转录组数据演示各种主流分析，包括基于Seurat的基础分析、以及基于clusterProfiler、Monocle、SingleR等R包的延伸分析。...有几个选项可以选择： 稀疏矩阵用negbinomial.size()， FPKM值用tobit()， logFPKM值用gaussianff() mycds是Monocle为我们的数据生成的对象，相当于我们在seurat...拟时相关基因聚类热图 Monocle中differentialGeneTest()函数可以按条件进行差异分析，将相关参数设为fullModelFormulaStr = "~sm.ns(Pseudotime...)"时，可以找到与拟时相关的差异基因。...BEAM分析 单细胞轨迹中通常包括分支，它们的出现是因为细胞的表达模式不同。当细胞做出命运选择时，或者遗传、化学或环境扰动时，就会表现出不同的基因表达模式。
每个工具都有它的优势与不足，在没有权威工具和流程的单细胞生信江湖里，多掌握几种分析方法和工具，探索数据时常常会有意想不到的惊喜。...高深的算法：CellChat在分析过程中使用了多种分析方法，不仅有常见的秩和检验、置换检验、SNN、KNN、UMAP，还有非负矩阵分解、社会网络分析、质量作用定律等不常用的方法。...安装CellChat 安装依赖项 ## R环境安装NMF和ComplexHeatmap包 devtools::install_github("renozao/NMF@devel") devtools::...= 800, height = 600) netAnalysis_contribution(cellchat, signaling = pathways.show) dev.off() # 分析细胞在信号网络中角色...sig_pathway_L-R ? sig_pathway_role ?
消息类型 尽管与EDIFACT相比使用率较低，但TRADACOMS标准中包括26种不同的报文类型。在TRADACOMS标准中，每一种报文类型都有一个由6个字母组成的编号。然而，报文的格式并不统一。...所有VDA标准都是用德语发布的，因为制定时并没有设想过在全球使用这个文件标准。因此，由于VDA没有与元素相关的命名惯例，以及德语中的技术术语不容易解释，因此需要德语知识来识别各个文档元素。...在欧盟内部，UBL被认为是通过电子采购网PEPPOL交换信息的推荐文件标准。欧盟2014/55/EU指令进一步提高了UBL的相关性，因为欧盟公共机构有义务根据上述法规以电子方式交换发票。...到2018年2.2版本发布时，文件格式已经增加到80多种。 消息结构 与X12类似，UBL消息类型也分为较高级别的类别。...这些类别如下： 授予前的采购 授予后的采购 采购和运输 UBL消息本身包括验证器、生成器、解析器（语法分析器）和编写软件。
通过单细胞 RNA 测序技术在基因工程小鼠模型的 PDA 进展的不同阶段对细胞异质性进行分析。...发现**除了具有增加炎症特征的不同巨噬细胞群外，癌细胞的上皮向间充质转变伴随着肿瘤进展；**正常小鼠胰腺中存在三种不同的成纤维细胞分子亚型，最终在晚期 PDA 中产生两种不同的成纤维细胞群；癌细胞和成纤维细胞可能受到表观遗传机制的动态调节...>300 selected_f 0 ) > 3] # 至少在3个细胞中表达...虽然说上面的代码都是复制粘贴即可运行，但是如果要更好地完成上面的图表，通常是需要掌握5个R包，分别是: scater,monocle,Seurat,scran,M3Drop，需要熟练掌握它们的对象，：一些单细胞转录组...R包的对象 而且分析流程也大同小异： step1: 创建对象 step2: 质量控制 step3: 表达量的标准化和归一化 step4: 去除干扰因素(多个样本整合) step5: 判断重要的基因 step6
Dezember unterbrochene Sitzungsperiode des Europäischen Parlaments für wiederaufgenommen, wünsche Ihnen...像英语和德语，单词之间有空格分隔，Tokenizer只需要将空格、标点符号等提取出来，就可以获得句子中的Token。...由于模型输出的是单词的概率分布，因此词表中单词数量很大情况下，模型会变得非常慢。如果单词表中包括拼写错误和各类派生单词，则词表的大小实际上是无限的。...这使模型在各类新词上有泛化能力，同时还可以减少词表大小。有许多生成Subword的技术，例如Byte Pair Encoding（BPE）。...这个脚本该脚本先下载数据，再使用Moses Tokenizer(https://github.com/moses-smt/mosesdecoder/blob/master/scripts/tokenizer
每个工具都有它的优势与不足，在没有权威工具和流程的单细胞生信江湖里，多掌握几种分析方法和工具，探索数据时常常会有意想不到的惊喜。...（如10%以上的细胞表达），且可以结合受体细胞中的受体（通过先验数据判断）； 执行NicheNet配体活性分析，其活性主要通过配体与受体细胞中的差异基因集的相关性进行判断； 推测高活性配体调控的靶基因，...安装NicheNet NicheNet依赖的R包比较多，安装过程可能较长，但是我的安装过程比较顺利，中间没有任何报错。...我们将使用Medaglia等人的小鼠NICHE-seq数据，探索淋巴细胞性脉络膜脑膜炎病毒（LCMV）感染之前和之后72小时的腹股沟淋巴结T细胞区域的细胞间通讯。...在该数据集中，观察到稳态下的CD8 T细胞与LCMV感染后的CD8 T细胞之间存在差异表达。
这些方法的共同特点是，即使初始矩阵 V 元素是非负的，分解出来的因子 W 和 H 中的元素往往含有负值元素。...从计算科学的角度来看，分解出来的因子 W 和 H 中的元素含有负值元素并没有问题， 但负值元素通常是无法解释的。...NMF在单细胞研究中的优势 单细胞研究避免不了要回答两个问题：组织中有哪些细胞类型，每个细胞类型又有哪些表达模式？NMF解决这类问题具有天然的优势，因为它分解的因子很容易与细胞类型或表达模式对应起来。...替代办法是使用经验或先验知识指定，可以尝试略多于细胞类型或细胞状态（细胞亚群再聚类时）的一个数值，例如我在本帖的PBMC数据分解中就指定为rank=10。...细胞在因子上的值 ? 细胞在PC轴上的值 ? 对比上下两张图，很容易发现NMF的因子比PCA的PC轴解释性更强。
前言 今天在利用jenkins将项目部署到远程服务器，里面有个步骤涉及到切换目录，执行部署脚本的命令，原本思路是利用xargs和cd配合进行目录切换，执行的shell命令如下 ls -a | sort...-r | head -n 1 | xargs -I {} basename {} .zip | xargs cd 可惜理想很美好，现实很骨感。...为啥cd命令在管道符中不起作用 百度来的答案是xargs牵涉写管道，而cd是内部命令，所以不起作用。...因此cd在xargs中不起作用，这不是很正常吗 如何使cd能够切换到我们想要的目录？...: cd: ls -a | sort -r | head -n 1 | xargs -I {} basename {} .zip: 没有那个文件或目录 额，貌似没啥用 2、cd $(命令) [root@
如果是在输出导向的snakemake 中，则需要先确定输出文件。...命令中的cp 命令， 在snakemake中，写成一个rule change_suffix，rule中的input, output，则由wildcards "sample"表示组成的字符表达式。...对应上面的小例子中，在rule change_suffix 找到了对应匹配 的output。.../scripts/peak_annotate.R" 是用来进行注释的R脚本, 里面采用ChIPseeker进行peak注释，clusterProfiler进行邻近基因GO注释 在snakemake rule...中除了利用 shell 运行shell命令外，还可以通过script来直接调用脚本， 当前支持Python, R, R Markdown, Julia 和Rust。
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