首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

Nat. Commun. | devCellPy:对复杂的多层单细胞转录组数据进行自动注释的机器学习管道

本文介绍由美国斯坦福大学医学院干细胞生物学与再生医学研究所的Sean M. Wu通讯发表在 Nature Communications 的研究成果:在单细胞RNA测序分析中,由于细胞表现出复杂的多层身份或过渡状态,导致对数据集的精确注释成为主要挑战。因此,作者提出了一个高度精确的机器学习工具devCellPy,它能自动预测跨复杂注释层次结构的细胞类型。为了证明devCellPy的强大功能,作者从已发布细胞的数据集中构建了小鼠心脏发育图谱,并训练devCellPy生成心脏预测算法。该算法可以在多层注释和小鼠发育数据中达到高预测精度。最终研究表明,devCellPy是一个可跨复杂细胞层次结构、物种和实验系统进行自动细胞预测的工具。

02
领券