距离上一篇 pandas 系列教程:数据分析利器 pandas 系列教程(四):对比 sql 学 pandas 发布已经过去大半年,近来才记起以前开了这样一个坑,本篇是本系列 pandas 实战 tricks 的首篇,不求大而全,力争小而精。
在单细胞的商业化测序平台中,来自10X genomics的测序数据占据了很大的份额。相信大家在平时的科研工作中对10X数据并不陌生, 而Cell Ranger软件作为由10X官方开发的配套分析软件,颇受欢迎。今天我们就给大家介绍一下这款软件主要分析流程和使用。
做这次考核作业用了4.5天时间,2天半的时间都在反复处理特征工程当中,1天半用来对比训练模型和做最后预测要提交的数据。
上一年由于备战考研,最近论文答辩结束,计划重启公众号。本篇文章主要是记录总结毕业论文中使用Pandas模块的常用操作,感兴趣的可以作为参考。
过完基础知识以后就是实战 tricks 的集锦,这些都是笔者在实际工作中用到的解决方案,求小而精,抛砖引玉。
本文介绍基于Python语言,针对一个文件夹下大量的Excel表格文件,基于其中每一个文件,首先依据某一列数据的特征截取我们需要的数据,随后对截取出来的数据逐行求差,并基于其他多个文件夹中同样大量的Excel表格文件,进行数据跨文件合并的具体方法。
最近有小伙伴后台给我留言,说自己用 Django 写了一个大文件上传的 Api 接口,现在想本地检验一下接口并发的稳定性,问我有没有好的方案
StreamSaver.js 可用于实现在Web浏览器中直接将大文件流式传输到用户设备的功能。
(1)在分析过程中,难免会产生很多中间变量,它们会占用大量内存。书中提到通常会将所有的临时中间变量命名为temp,只需要保证下一个temp出现之前,临时变量不会再延用就可以了。
1、数据集简介 MovieLens数据集包含多个用户对多部电影的评级数据,也包括电影元数据信息和用户属性信息。 这个数据集经常用来做推荐系统,机器学习算法的测试数据集。尤其在推荐系统领域,很多著名论文都是基于这个数据集的。(PS: 它是某次具有历史意义的推荐系统竞赛所用的数据集)。 下载地址为:http://files.grouplens.org/datasets/movielens/,有好几种版本,对应不同数据量,本文所用的数据为1M的数据。 2、数据介绍 1m的数据解压后,可以看到四个主要的csv文件,
重塑 DataFrame 是数据科学中一项重要且必不可少的技能。在本文中,我们将探讨 Pandas Melt() 以及如何使用它进行数据处理。
这次的作业主要是以对一个非常简单的数据分析问题进行实践的形式呈现出来,对于《R语言实战》第一二章的内容已经体现在了对问题的解析的过程中,所以就不再将学习的过程贴出来了。
将两个结构相同的数据框合并成一个数据框。 函数concat([dataFrame1, dataFrame2, ...])
csvtk是 seqkit 与 taxonkit 作者开发的另外一款工具,专门用来处理表格数据,虽然名字称为 csvkit,但也可以处理 tsv 格式。可以对表格文件进行多种处理,包括统计,转换,集合,编辑,排序,绘图等操作。相比于 R 与 python 这些功能强大的软件,csvtk 是一个多功能的工具箱,是表格处理的“瑞士军刀”,特别适合处理一些简单的操作。与 csvtk 类似还有一个csvkit。
github地址: 在公众号 datadw 里 回复 京东 即可获取。 这是一位热心的参赛者提供的一份入门程序,涵盖了数据清洗、数据(统计)分析、特征抽取、搭建模型、模型评估,这些机器学习通用的完整流程,对于初学者来说可以作为参考。 上面的连接中有相关的说明,如: data_cleaning.ipynb 数据清洗 data_analysis.ipynb 数据分析 exlpore_potential_user.ipynb 探索高潜用户行为 其他都是.py的python
词典型情感分析大致有以下几个步骤: 训练数据集、neg/pos情感词典、分词+数据清洗清洗(一、二、三级清洗步骤)、计算情感得分、模型评价 (1)在分析过程中,难免会产生很多中间变量,它们会占用大量内存。书中提到通常会将所有的临时中间变量命名为temp,只需要保证下一个temp出现之前,临时变量不会再延用就可以了。 (2)毫无疑问,如果不追求高大上的算法的话,词典法不失为一种好方法,其实有时候我们使用了很多方法,结果发现并没有什么质变,也浪费了大量时间; 比如在优化词典的时候,我希望使用高大上的算法解决
公众号原文首发:https://mp.weixin.qq.com/s/4RYfYc8_2vNxvq_B1bZrUA
对于上一节的爬虫,只是做了个简单的数据爬取及存储,但是当遇见不同的个人主页时,代码就会报错,数据就会错落,为了更好的解决这个问题,本节即对上节代码进行优化及异常处理。
先把pandas的官网给出来,有找不到的问题,直接官网查找:https://pandas.pydata.org/
首先给出一个示例数据,是一些用户的账号信息,基于这些数据,这里给出最常用,最重要的50个案例。
system:假设你是一个经验非常丰富的数据分析师的助理,正在帮助他撰写一些自媒体平台的文章
两章前,在 OSEMN 数据科学模型的第一步,我们看到了从各种来源获取数据。这一章讲的都是第二步:清理数据。你看,你很少能立即继续探索甚至建模数据。您的数据首先需要清理或清理的原因有很多。
今天跟大家分享的是数据地图系列的第七篇——使用R语言制作热力数据地图! 也许很多小伙伴儿对于R语言还很陌生,感觉很神秘。 确实,R语言的数据地图需要使用很长的代码来写。但是就像我们学习高数和微积分一样,再复杂再庞大的公式,都会有计算软件帮你代劳,而你只需要知道怎么调整参数、控制路径,并且明白每一句代码的实现功能就可以了,无需记住每一串代码的详细内涵和写法。 而且接下来要写的诸多代码,大部分都并非自己写的,而是从网上拼凑,经过整理与汇总后的。坦白的说,绝大部分自己都写不出来,语法也很费解,只是勉强知道大概可以
之前写 datamash 的使用教程 linux 极简统计分析工具 datamash 必看教程,收到了一位读者的私信,内容如上。
众所周知文本数据的分析,一直是EXCEL的天下, 通过多种EXCEL的方法来进行数据的处理. 但如果涉及到几个文本文件的数据的聚合分析,合并分析,函数分析等等这样的情况. 所以怎么能让文本文件进行数据分析成为一个数据分析领域的卖点.
引言 之前介绍过 如何使用TCGAbiolinks下载TCGA数据并整理 , 那么如果手动整理又该如何呢? 下面以 miRNA 数据整理为例示范. 效果展示 过程 输入文件 随便下载一些数据, 下载格
赛题简介:“互联网新闻情感分析”赛题,是CCF大数据与计算智能大赛赛题之一。对新闻情绪进行分类,0代 表正面情绪、1代表中性情绪、2代表负面情绪。(赛题官网https://www.datafountain.cn/competitions/350)
今天要跟大家分享的是数据地图系列6——Stata数据地图(下)! 接着前一篇的节凑,这一篇会给大家介绍比较全面的Stata热力地图代码实现。 版本仍然是基于StataSE12.0。 首先需要下载软件外部命令:spmap #这一条命令是数据地图的专用命令。 ssc install spmap #下载并安装spmap命令。 下载数据地图经纬度数据文件:就是昨天用到的那个 http://fmwww.bc.edu/RePEc/bocode/c/china_map.zip 接下来是作图步骤: 1、锁
尽管Excel在职场和学术界非常流行,但对于一些高级的统计分析、数据可视化、大规模数据处理等任务,可能需要更专业的软件或编程语言,如R、Python、SAS或Stata。此外,对于特定的行业或研究领域,可能会有其他更适合的工具和平台。
每个操作都包含介绍、语法和案例。这些操作涉及数据导入、数据清理、数据分析、数据可视化和机器学习等方面。
如果我们在使用嵌套循环来读取 CSV 文件时遇到了问题,可以提供一些代码示例和出现的具体错误,这样我可以更好地帮助大家解决问题。不过,现在我可以给大家一个基本的示例,演示如何使用嵌套循环来读取 CSV 文件。
Pandas是基于Numpy开发出的,专门用于数据分析的开源Python库 Pandas的两大核心数据结构 Series(一维数据) 允许索引重复 DataFrame(多特征数据,既有行索引,又有列索引) # 创建一个3行4列的DataFrame类型数据 data_3_4 = pd.DataFrame(np.arange(10, 22).reshape(3, 4)) # 打印数据 print(data_3_4) # 打印第一行数据 print(data_3_4[:1]
Python具有极其活跃的社区和覆盖全领域的第三方库工具库,近年来一直位居编程语言热度头部位置,而数据科学领域最受欢迎的python工具库之一是 Pandas。随着这么多年来的社区高速发展和海量的开源贡献者,使得 pandas 几乎可以胜任任何数据处理工作。
由于maven仓库在外网,网络连接较慢,推荐设置国内的源;最常用的就是上面的配置;
今天要跟大家分享的是数据地图系列的第八篇——R语言版数据地图(下),分省(市级)热力地图。 步骤与昨天分享的中国热力地图步骤基本一致,只是需要调用的数据文件和需要自定义的指标文件略有本不同。 R语言系统环境配置: R version 3.2.3 RStudio Version 0.99.484 在正式开始之前,必须确保你的R语言环境中已经安装以下包: ggplot2 plyr maptools 如果还未安装,需要先安装:install.packages("ggplot2","plyr","maptools
笔者寄语:情感分析中对文本处理的数据的小技巧要求比较高,笔者在学习时候会为一些小技巧感到头疼不已。
单细胞专题 | 1.单细胞测序(10×genomics技术)的原理 单细胞专题 | 2.如何开始单细胞RNASeq数据分析 单细胞专题 | 3.单细胞转录组的上游分析-从BCL到FASTQ 单细胞专题 | 4.单细胞转录组的上游分析-从SRA到FASTQ 单细胞专题 | 5.单细胞转录组的上游分析-从FASTQ到count矩阵
需求:把一个文件夹下的多个csv文件合并成一个文件,文件的格式是相同的,只是按照不同的月份分成了多个文件,现将文件夹下的文件进行合并
R和ggplot可视化功能非常强大,了解了一下其中的地图做法,发现R做世界地图、美国地图非常容易,但做中国地图就太麻烦了,需要自己DIY。 DIY也有多种方式,但网络上各种帖子教程的出图效果都不太理想,达不到工作用要求。下面是我的摸索过程,记录如下备忘,也请教于R老师们。 参考书目:ggplot2,R graphics cookbook,参考贴:http://site.douban.com/182577/widget/notes/10568279/note/257898418
合并多个CSV文件、文本文件、Excel工作簿等操作是我们日常工作中经常碰到的事,如果一个一个文件复制粘贴,费时费力又容易出错。当然,可以使用VBA来解决,但前提是你必须懂VBA。这里有一个简单快速的方法,使用Power Query。
之前有过一段时间,特别热衷于数据地图,也分享很多篇关于地图制作的教程(涉及到各种作图软件),但大多是整理拼凑,自己发挥的不多。 最近在看哈德利.威科姆的那本火遍全球的R语言数据可视化经典教程——《ggplot2——数据分析与图形艺术》。书内虽然关于数据地图的内容很少,但是ggplot所渗透的可视化图层理念实在让人叹为观止。 书中完全将复杂的地图图表语言拆解成常规图表思维,通过图层叠加、分组填色、空间映射,让我对地图这种深度可视化形式有了更多深入的理解。 今天这一篇主要分享美国地图的绘图代码,同样是我们之前分
原文的数据集是 bit.ly 短网址的,我这里在读取时出问题,不稳定,就帮大家下载下来,统一放到了 data 目录里。
文章目录 一、项目概述 1.项目说明 2.环境配置 二、项目实施 1.导入所需要的库 2.全局变量和参数配置 3.产生随机时间和用户代理 4.获取领导的fid 5.获取领导所有留言链接 6.获取留言详情 7.获取并保存领导所有留言 8.合并文件 9.主函数调用 三、结果、分析及说明 1.结果说明 2.改进分析 3.合法性说明 一、项目概述 1.项目说明 本项目主要是对领导留言板内的所有留言的具体内容进行抓取,对留言详情、回复详情和评价详情进行提取保存,并用于之后的数据分析和进一步处理,可以对政府的决策和电子
在这篇教程中,我们将构建一个深度学习模型,用于个性化推荐和广告优化。我们将使用TensorFlow和Keras库来实现这一目标。通过这个教程,你将学会如何处理数据、构建和训练模型,并将模型应用于实际的推荐和广告优化任务。
Spark是一个通用的大规模数据快速处理引擎。可以简单理解为Spark就是一个大数据分布式处理框架。基于内存计算的Spark的计算速度要比Hadoop的MapReduce快上100倍以上,基于磁盘的计算速度也快于10倍以上。Spark运行在Hadoop第二代的yarn集群管理之上,可以轻松读取Hadoop的任何数据。能够读取HBase、HDFS等Hadoop的数据源。
前几天遇到一个工作,需要将几个分别包含几十万行的csv文件的某3列合并成1个csv文件,当时是手工合并的: 1、csv另存为excel; 2、删除不需要的列,仅保留想要的列 3、excel另存为csv 4、最后,手工合并处理好的csv 不得不说,这样操作效率真的很低,尤其是操作几十万行的文件,当时就想利用python代码肯定可以实现,今天利用周末的时间好好研究了一下,终于实现了,操作几十万行的文件只需要一两分钟,比手工高效多了。 实现思路如下: 1、利用os模块获取文件下所有csv文件(表结构相同) 2、用pandas打开第一个文件; 3、循环打开剩下的文件; 4、利用pd.concat拼接不同的df,该方法可以自动去除多余的标题行; 5、挑选需要的列,去重; 6、将结果输出文csv文件; 完整代码如下:
《2020腾讯广告算法大赛》复赛已经接近尾声,作为一瓶初赛酱油,打算做个复盘,留个笔记,本来初赛结束就打算写的,被各种事情耽搁了,直到今天才动手开写
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。常被用于统计学、计量分析等领域。接下来讲一下我个人认为的R入门知识。
DESeq2是一个用于分析基因表达差异的R包,具体操作姚在R语言中运行 1.R语言安装DESeq2
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