首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

如何使用R创建维恩图?

维恩图(Venn diagram)是一种用于可视化集合之间关系的图表。在R语言中,可以使用一些包来创建维恩图,如venneulerVennDiagrameulerr等。

  1. 使用venneuler包创建维恩图:
代码语言:txt
复制
# 安装venneuler包
install.packages("venneuler")

# 加载venneuler包
library(venneuler)

# 创建维恩图数据
sets <- list(A = c("apple", "banana", "cherry"),
             B = c("banana", "durian", "elderberry"),
             C = c("cherry", "durian", "fig"))

# 创建维恩图
venn <- venneuler(sets)

# 绘制维恩图
plot(venn)
  1. 使用VennDiagram包创建维恩图:
代码语言:txt
复制
# 安装VennDiagram包
install.packages("VennDiagram")

# 加载VennDiagram包
library(VennDiagram)

# 创建维恩图数据
set1 <- c("apple", "banana", "cherry")
set2 <- c("banana", "durian", "elderberry")
set3 <- c("cherry", "durian", "fig")

# 创建维恩图
venn.diagram(x = list(A = set1, B = set2, C = set3),
             filename = NULL,
             output = TRUE,
             imagetype = "png",
             main = "Venn Diagram",
             main.cex = 2,
             fill = c("red", "blue", "green"),
             alpha = 0.5,
             label.col = c("black", "white", "darkblue"),
             cex = 1.5,
             fontfamily = "serif",
             cat.col = c("red", "blue", "green"),
             cat.cex = 1.5,
             cat.fontfamily = "serif",
             cat.dist = c(0.03, 0.03, 0.03),
             cat.pos = c(-15, 15, 0),
             cat.just = list(c(0.5, 0.5), c(0.5, 0.5), c(0.5, 0.5)),
             rotation.degree = 0,
             margin = 0.1,
             euler.d = TRUE,
             scaled = FALSE,
             ind = TRUE,
             ext.text = FALSE,
             ext.line = FALSE,
             ext.length = 0.1,
             ext.pos = 1,
             ext.dist = -0.05,
             ext.line.lwd = 1,
             ext.line.lty = "solid",
             ext.line.col = "black",
             lwd = 1,
             lty = "solid",
             col = "black",
             fill.alpha = 0.5,
             cex.prop = 1,
             sep.dist = 0.03,
             sep.lty = "dashed",
             sep.col = "black",
             cat.sep = 0.03,
             cat.lty = "dashed",
             cat.col = "black",
             cat.fontfamily = "serif",
             cat.cex = 1.5,
             rotation.cw = TRUE,
             rotation.degree = 90,
             rotation.ylim = NULL,
             rotation.xlim = NULL,
             rotation.factor = 1,
             rotation.fun = NULL,
             rotation.control = list(),
             zscore = NULL,
             zscore.col = "red",
             zscore.lty = "dashed",
             zscore.lwd = 1,
             zscore.cex = 1.5,
             zscore.fontfamily = "serif",
             zscore.dist = 0.03,
             zscore.pos = 1,
             zscore.side = "both",
             zscore.prop = 0.1,
             zscore.cex.prop = 1,
             zscore.sep.dist = 0.03,
             zscore.sep.lty = "dashed",
             zscore.sep.col = "black",
             zscore.cat.sep = 0.03,
             zscore.cat.lty = "dashed",
             zscore.cat.col = "black",
             zscore.cat.fontfamily = "serif",
             zscore.cat.cex = 1.5,
             zscore.rotation.cw = TRUE,
             zscore.rotation.degree = 90,
             zscore.rotation.ylim = NULL,
             zscore.rotation.xlim = NULL,
             zscore.rotation.factor = 1,
             zscore.rotation.fun = NULL,
             zscore.rotation.control = list())

以上是使用venneulerVennDiagram包创建维恩图的示例代码。你可以根据自己的需求选择其中一种方式来创建维恩图,并根据具体的数据和参数进行调整。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

  • R语言学习 - 韦恩图

    韦恩图 韦恩图是用来反映不同集合之间的交集和并集情况的展示图。一般用于展示2-5个集合之间的交并关系。集合数目更多时,将会比较难分辨,更多集合的展示方式一般使用upSetView。...这篇文章讲解下如何用R代码一步出图。 韦恩图一步法 假设有这么一个矩阵,第一列为不同集合中的ID,第二列为集合的名字,无标题行,存储为venn.txt。...ehbio3 a ehbio4 b ehbio4 h ehbio4 d ehbio5 e ehbio5 y ehbio5 x ehbio5 选取所有的5个集合,绘制韦恩图...选取其中4个集合,绘制韦恩图 # -f: 指定输入文件的名字,格式如上 # -a: 指定第一个集合的名字 (-f指定的文件中第二列的某个字符串) # -b: 指定第二个集合的名字 (-f指定的文件中第二列的某个字符串...因此对于这种多集合情况,推荐使用UpSetView展示,看效果如下。

    2K70

    局部整体(二)利用python绘制维恩图

    局部整体(二)利用python绘制维恩图 维恩图( Venn Diagram)简介 维恩图显示集与集之间所有可能存在的逻辑关系,每个集通常以一个圆圈表示,每个集都是一组具有共同之处的物件或数据。...2组 venn2(subsets = (10, 5, 2), set_labels = ('Group A', 'Group B')) plt.show() 定制多样化的维恩图 自定义维恩图一般是结合使用场景对相关参数进行修改..., arrowprops=dict(arrowstyle='->', connectionstyle='arc3,rad=0.5',color='gray')) plt.show() 绘制文本类维恩图...更多方法可参考UpSetPlot documentation[2] 总结 以上通过matplotlib_venn快速绘制维恩图,并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样的维恩图来适应相关使用场景...也介绍了如何使用upset图展示更多集合关系。

    5510

    使用R语言创建自定义桑基图Sankey图

    p=9101 本文将描述如何在R中创建自定义Sankey图。我将首先解释Sankey图的基础,然后提供自动创建和手动控制的布局的示例。 Sankey图的元素 Sankey图是一种可视化数据流的方式。...Sankey图由三组元素组成:  节点,  链接和确定其位置的指令。 首先,有节点。在下面的示例中,方框表示四个节点。 这些链接具有 与之关联的值,该值由链接的厚度表示。...使用R nodes = data.frame("name" = c("Node A", # Node 0... ...第2至6行创建一个数据框。 第7至11行指定链接。 最后几行使用sankeyNetwork函数。 如果要修改此示例,则只需修改节点(此示例中的第3至6行)和链接(第8至11行)即可。...使用自动布局的Sankey图

    2.2K11

    【R语言】复现paper中的韦恩图

    集合数目更多时,将会比较难分辨,更多集合的展示方式一般使用upSetView。绘制韦恩图的工具有很多,这里小编先给没有任何编程基础的人推荐几款比较好用的网络工具。 1....BioVenn http://www.biovenn.nl/index.php BioVenn只能绘制3维及以下的韦恩图,不过圆圈的大小可以随数据集大小而变化,并且对图片的编辑选项也更多。...=========华丽的分割线============ 对于掌控性要求比较高的同学,可以试着自己写R代码来绘制韦恩图。...今天我们就来重现下面这篇学术论文里面的韦恩图 Fig3为韦恩图 下面我们用R里面的VennDiagram包来重现这个图 我们这里就不用原文作者的数据了,而是随机产生了4个gene list,这四个...,小编比较推荐使用R的UpSetR包来画Upset plot,如下

    84120

    维恩图 (Venn Diagram) 示例:UML vs. SysML

    什么是维恩图 (Venn Diagram)? 维恩图是集合之间以及共享某些共同点的对象组之间关系的图示。有时,维恩图被用作视觉头脑风暴工具,用于比较和对比两种(有时是三种或更多种)不同的东西。...创建维恩图的指南 维恩图对于展示两个或多个主题或事物之间的关系最有用。主题必须以某种方式相关或可比较,或者它们不适用于维恩图模型。...以下是14 UML图表类型的结构: image.png 以下是SysML图表类型的结构: image.png UML和SysML描述 - 现在使用维恩图突出差异性和共性: 这是UML和SysML的维恩图示例...在这个维恩图中,您可以轻松查看它们支持的各种图表以及它们支持的图表类型。 image.png 使用Visual Paradigm Online的维恩图创建者绘制维恩图。...只需单击“使用此模板”即可从此模板进行编辑,或单击“创建空白”以从头开始。无需事先登记。 绘制图 使用此模板 创建空白 其他例子 维恩图示例 所有图表示例

    2.4K60

    数据可视化之维恩图 Venn diagram

    维恩图的用途: 比较策略:我们可以使用维恩图来比较不同策略、决策或流程的潜在结果。每个圆圈代表一个观点或事物,重叠部分表示相同之处,而各自不重叠的部分则表示各自不同的特征。...突出显示组合和重叠:当我们需要通过消除工作流冗余来削减成本时,可以使用维恩图的重叠部分来定位任务。通过将方案细化并拆分为多个任务,我们可以解决问题或满足需求。...借助 EVenn 可以轻松绘制和分析维恩图。 轻松在线创建可重复、可编辑和可统计的维恩图和维恩-替代图。 支持 5 种类型的集合关系可视化。 开发一个统一的矩阵,作为所有 7 个工具的输入。...此外,您还可以使用 Visio 或 PPT 手动绘制圆形或椭圆形,然后手动设置它们的重叠部分和图例说明,实现更灵活地绘制维恩图并让它美观、直观。 维恩图作为一种强大的可视化工具,也有一些局限性。...如果你关心的是集合元素的百分比或比例,其他图表(如饼图)更适合。 总之,维恩图在展示集合之间的关系方面非常有用,但在使用时需要考虑其局限性,并根据具体情况选择合适的可视化工具。 ️

    1.4K00

    绘图系列|R-VennDiagram包绘制韦恩图

    在得到数据之后,我们经常会用到维恩图来展示各个数据集之间的重叠关系。本文简单的介绍R语言中的VennDiagram包绘制数据集的维恩图。...三 知道各个数据集的个数以及重叠(交叉)的个数 2.1 两个已知数据集的韦恩图 # 圆的大小不会根据数据量多少改变 venn.plot 恩图 venn.plot <- draw.triple.venn(area1 = 80,area2 = 70,area3 = 50,n12 = 38,n23 = 18,n13...= "blank",cex = 2,cat.cex = 2,cat.col = c("blue", "red", "green")) grid.draw(venn.plot) 四 根据数据集合绘制韦恩图...VennDiagram函数包最大能绘制5个数据集合的韦恩图,可以看到已经有点乱了,当更多集合的时候,可以使用之前分享的R|UpSet-集合可视化进行绘制。 韦恩图,走你。

    9.8K40

    利用R包“ggvenn”快速绘制韦恩图(Venn Diagram)

    韦恩图(Venn diagram)是一种能直观展示不同数据集之间的集合关系的图,常见的集合运算主要包括:交集(intersection),并集(union)和补集(complement)。...在R语言中,有很多R包可以实现韦恩图的绘制,米老鼠在这里推荐“ggvenn”和“ggVennDiagram”这两个R包,它们都是基于ggplot2的绘图系统,和其它ggplot2绘制的图兼容性好,这里主要介绍...“ggvenn”这个R包的用法。...,它最主要的就是ggvenn()函数,该函数的参数比较丰富,主要包括如下内容: (1)data:用于绘制韦恩图的数据集,可以是数据框,也可以是列表; (2)columns:针对数据框,可以提取特定的列绘图...cowplot::plot_grid(p1, p2) #将图1和图2合并起来 关于韦恩图的简单绘制就讲到这里,有兴趣的小伙伴可以学学“ggVennDiagram”这个包。

    7.6K20

    【科研猫·绘图】缤纷版·韦恩图(带R代码分享)

    前几天,有同学说想要韦恩图的教程,那么我们就来一期韦恩图吧。 ?...韦·恩·图 定义:Venn diagram, 又称为文氏图、温氏图、维恩图、范氏图,是在所谓的集合论(或者类的理论)数学分支中,用以表示集合(或类)的一种图。...应用场景举例:计算多个组中差异基因的交集 绘制方法:使用 read.table() 函数读入不同列表的数据,构建列表list,使用R的VennDiagram包绘制不同数量的组之间的韦恩图。...绘图操作:使用科研猫提供的 韦恩图·R代码,只要提供几个参数即可: 由于我们常用的韦恩图可能涉及多个组别,如2组、3组乃至4组、5组,为了更全面地展示作图过程,更好地教会大家,我们在这里把不同组别全部做一遍...出来的图是这样的: ? 相当漂亮啊,有木有?同理,如果需要2组,3组,或者5组的韦恩图,需要设置对应数量的列表文件和列表的名称即可。画出来的图是这样的: ?

    1.6K10

    R语言实现高级的韦恩图可视化

    韦恩图大家应该都不陌生,主要用来展示不同事物或者组之间的数学或逻辑关系,主要用于集合的运算结果展示。今天给大家介绍一个在R语言中更加高级的展示形式,实现此功能的R包是UpSetR。...首先看下包的安装: install.packages("UpSetR") 接下来我们直接通过实例来看下如何进行数据的可视化: ##载入包 library(UpSetR) library(ggplot2...red", active = F, query.name = "Decades")), expression ="AvgRating > 3 & Watches > 100") ##通过柱状图增加变量的其它数据信息其中...metadata, plots =list(list(type = "hist", column ="avgRottenTomatoesScore", assign = 20)))) ##增加热图信息...", column = "Cities", assign = 5, colors = c(Boston ="green", NYC = "navy", LA = "purple"))))) ##混合图的绘制

    1.4K30

    【译】使用 JavaScript 创建图

    image.png 图是由具有边的节点集合组成的数据结构。图可以是有向的或者是无向的。 有向图包含功能类似于单行道的边。边缘从一个节点流向另一个节点。...image.png **图(graph)**中没有明确的信息层次结构。 方法 我们将创建一个(关于)人和冰淇凌口味的图表。这将是一个有向图,因为人们可以喜欢某些口味,但是味道可不喜欢人。...我们将创建三个类: PersonNode IceCreamFlavorNode Graph PersonNode PersonNode类将接受一个参数:一个人的名字。这将作为其标识符。...Graph类将包含六个方法: addPersonNode(name):接受一个参数,一个人的名字,创建一个具有此名字的PersonNode对象,并将其推送到peopleNodes数组。...addIceCreamFlavorNode(flavor):接受一个参数,一个冰淇凌口味,创建一个具有这种口味的IceCreamFlavorNode对象,并将其推送到iceCreamFlavorNodes

    77930

    「业务架构」如何创建BPMN图?

    我们将向您介绍BPMN,并让您了解如何使用我们的BPMN软件为流程和工作流设计创建BPMN。 BPMN是什么? 业务流程模型和符号(BPMN)是在业务流程建模中使用的著名建模标准。...BPMN图的用途 BPMN符号是如此简单,他们可以被理解为,每个人,包括业务分析师创建和改进业务流程,技术开发人员实现过程变化,业务经理监视变化,甚至非技术人员像涉众想了解未来的过程。...理解BPMN图 在BPMN中,使用带有一系列图形元素的图来描述流程。这样的可视化表示使用户很容易理解流程的逻辑。BPMN主要用于设计和读取简单和复杂的业务流程关系图。...选择现有的BPMN关系图模板,或者选择Blank从零开始创建。单击Next。 输入图表名称并单击OK。 从关系图工具栏中拖放形状。 使用资源目录来完成图表。将鼠标指针移动到一个形状上。...按下资源图标并将其拖出,然后选择要创建的形状。将自动为您创建一个连接器。

    1.1K10
    领券