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合并两个不同物种单细胞转录组数据集注意harmony参数

两个数据集分别是人和鼠SMC异质性探索,文献标题是:《Single-Cell Genomics Reveals a Novel Cell State During Smooth Muscle Cell...其实在进行跨物种基因研究时,研究人员需要仔细核对基因命名和序列信息,以确保研究准确性。可以使用Ensembl、UniProt或NCBI Gene等数据库来获取不同物种中基因准确信息。...所以我对两个表达量矩阵取了共有基因交集,然后就可以合并两个矩阵啦, 如下所示: sceList = list( mouse = CreateSeuratObject( counts =..., 如下所示: 两个物种仍然是泾渭分明 但是一般人都会忽略它,其实是RunHarmony函数可以修改参数,比如同时抹去样品和数据差异,代码如下所示; seuratObj <- RunHarmony...: 两个物种就比较好整合在一起 而且也是可以比较好进行亚群命名,跟原文一样两个泾渭分明内皮细胞,然后就是t细胞和巨噬细胞代表淋巴细胞和髓系免疫细胞啦 ,同样文献里面的巨噬细胞和平滑肌细胞界限也是模糊不清

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合并多个Excel文件,Python相当轻松

每个Excel文件都有不同保险单数据字段,保单编号、年龄、性别、投保金额等。这些文件有一个共同,即保单ID。...这里,df_1称为左数据框架,df_2称为右数据框架,将df_2与df_1合并基本上意味着我们将两个数据框架所有数据合并在一起,使用一个公共唯一键匹配df_2到df_1中每条记录。...df_1和df_2中记录数相同,因此我们可以进行一对一匹配,并将两个数据框架合并在一起。...有两个“保单现金值”,保单现金值_x(来自df_2)和保单现金值_y(来自df_3)。当有两个相同时,默认情况下,pandas将为列名末尾指定后缀“_x”、“_y”等。...最终数据框架中只有8行,这是因为df_3只有8条记录。默认情况下,merge()执行”内部”合并,使用来自两个数据框架交集,类似于SQL内部联接。

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Python入门之数据处理——12种有用Pandas技巧

2. .values[0]后缀是必需,因为默认情况下元素返回索引与原数据索引不匹配。在这种情况下,直接赋值会出错。 # 6. 交叉表 此函数用于获取数据一个初始“感觉”(视图)。...# 7–合并数据 当我们需要对不同来源信息进行合并时,合并数据变得很重要。假设对于不同物业类型,有不同房屋均价(INR/平方米)。让我们定义这样一个数据: ? ?...现在,我们可以将原始数据和这些信息合并: ? ? 透视表验证了成功合并操作。请注意,“value”在这里是无关紧要,因为在这里我们只简单计数。...一些算法(逻辑回归)要求所有的输入都是数值型,因此名义变量常被编码为0, 1…(n-1) 2. 有时同一个类别可以用种方式来表示。...这通常在以下情况下发生: 1. 数值类型名义变量被视为数值 2. 带字符数值变量(由于数据错误)被认为是分类变量。 所以手动定义变量类型是一个好主意。如果我们检查所有数据类型: ? ?

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盘点 Pandas 中用于合并数据 5 个最常用函数!

作者:阿南 整理:小五 如何在Pandas合并数据,大家肯定都不陌生。 作为一个初学者,我发现自己学了很多,却没有好好总结一下。...pd.concat([df0, df1], axis=1) 默认情况下,当我们横向合并数据(沿)时,Pandas其实是按照索引来连接。...是指两个数据框中数据交叉匹配,出现n1*n2数据量,具体如下所示。...DataFrame 对象之间执行按合并,它与之前方法还是有很大不同。...在这种情况下,df1 a 和 b 将作为平方,产生最终值,如上面的代码片段所示 5、append 回顾前文,我们讨论大多数操作都是针对按合并数据。 如果按行合并(纵向)该如何操作呢?

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Fast ORB-SLAM

为了在没有描述子情况下建立可靠关键点匹配,我们将关键点匹配方法分为两个阶段: 第一阶段是鲁棒关键点匹配,首先通过均匀加速度模型预测初始关键点对应关系,然后实现了基于金字塔光流跟踪算法,建立了鲁棒关键点对应关系...提出了一种新由粗到精关键点匹配方法,该方法可以在不需要描述子情况下,在相邻之间建立可靠关键点对应关系。...● 内容精华 系统介绍 Fast ORB SLAM,一个完整、健壮、重量轻视觉SLAM系统。与ORB-SLAM2基于描述子匹配在相邻中建立关键点对应关系不同,该系统采用由粗到细描述子匹配方法。...值得注意是,仅当被选为关键时才提取描述子,由粗到精细匹配方法分为两个阶段: 第一阶段是鲁棒关键点匹配: 首先,通过一个有效运动模型来预测关键点对应关系,这给算法一个很好匹配初始值,并且潜在地减少了搜索匹配计算量...最后一行给出了APE和RPE误差比较。从这个图中,我们方法比ORB-SLAM2在两个数据集中产生了比ORB-SLAM2更好精度,包括一个低纹理区域。 ?

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【如何在 Pandas DataFrame 中插入一

在实际数据处理中,我们经常需要在DataFrame中添加新,以便存储计算结果、合并数据或者进行其他操作。...不同插入方法: 在Pandas中,插入列并不仅仅是简单地将数据赋值给一个新。...({'B': ['a', 'b', 'c']}) # 使用concat函数沿着方向合并两个DataFrame,创建新DataFrame result = pd.concat([df1, df2],...axis=1) print(result) 这里我们使用concat函数将两个DataFrame沿着方向连接,创建了一个新DataFrame。...在实际应用中,我们可以根据具体需求使用不同方法,直接赋值或使用assign()方法。 Pandas是Python中必备数据处理和分析库,熟练地使用它能够极大地提高数据处理和分析效率。

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​OA-SLAM:在视觉SLAM中利用物体进行相机重定位

主要贡献 目前先进SLAM方法ORB-SLAM2,依赖于词袋描述子来寻找相似图像,以及基于外观局部特征,ORB或SIFT,用于在查询图像中关键点和地图中地标之间寻找匹配点。...物体融合:在某些情况下,地图中一个物体可能会重复出现,当检测到物体在几内不可见,数据关联无法正确重新匹配它与现有轨迹,并在地图中插入新物体时,这种情况可能会发生。...在这种情况下,关键中为两个对象跟踪检测框被合并,然后初始化一个新椭球,但只在关键上进行。...实验 为了评估我们方法,我们使用了TUM RGB-D数据集中两个场景:fr2/desk和fr3/long office household。...因此,我们创建了两个其他版本,这两个版本在捆集调整中涉及对象(请参见图9)。一个称为Obj dets,其中对象被整合到捆绑调整中,但不更新其椭球模型。

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Python探索性数据分析,这样才容易掌握

为了比较州与州之间 SAT 和 ACT 数据,我们需要确保每个州在每个数据中都被平等地表示。这是一次创新机会来考虑如何在数据之间检索 “State” 值、比较这些值并显示结果。...我方法如下图展示: ? 函数 compare_values() 从两个不同数据中获取一,临时存储这些值,并显示仅出现在其中一个数据集中任何值。...由于 2017 年 SAT 和 2017 年 ACT “州”数据唯一区别在于“国家”值,我们可以假设'华盛顿特区'和'哥伦比亚特区'在两个数据'州'中是一致。...现在再试着运行这段代码,所有的数据都是正确类型: ? 在开始可视化数据之前最后一步是将数据合并到单个数据中。为了实现这一点,我们需要重命名每个数据,以描述它们各自代表内容。...最后,我们可以合并数据。我没有一次合并所有四个数据,而是按年一次合并两个数据,并确认每次合并都没有出现错误。下面是每次合并代码: ? 2017 SAT 与 ACT 合并数据集 ?

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2.2.1、Google Analytics高级应用——过滤器应用

过滤器验证会以预览表格形式显示变更行,分为“应用过滤器之前”和“应用过滤器之后”。“应用过滤器之前”显示原始数据行(如果上周应用了建议过滤器,这些数据行则经过了建议过滤器更改)。...“应用过滤器之后”显示如果应用新过滤器,这些数据行所呈现样子。如果新过滤器在7天前生效,那么“之前”和“之后”这之间差异就是该过滤器所实现效果。...可以利用三个位置选项做任意匹配生成不同过滤器, “排除/仅包含”来自 ISP 域流量:使用此过滤器可以“排除/仅包含”来自特定网域(例如 ISP 或公司网络)流量。...高级过滤器最多可以利用两个字段(字段 A 和字段 B)来构建输出字段。提取 A 表达式应用到字段 A,提取 B 表达式应用到字段 B。这些表达式可使用完整或部分文字匹配,还可包括通配符。...原理是:将两个条件A和B用高级功能将其提取出来分别放到自定义字段1和自定义字段2,然后将自定义字段1和自定义字段2合并,再将其中空排除掉,这样过滤出来就是满足两个条件了。

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多会话、面向定位轻量级激光雷达(LiDAR)建图方法

内容概述 A. 从点云数据获取线和平面RIPTION LiDAR里程计与语义分割:首先,利用已广泛研究LiDAR里程计技术作为前端工具,获取每个雷达里程计数据和原始点云子地图。...B.全局地图合并 构建语义图:为了合并不同位置子地图,必须全局解决地点识别和相对位姿估计这两个关键挑战,而无需初始猜测。传统方法通常使用完整激光扫描数据构建手工制作或基于学习全局描述符。...在这种情况下,采用GraffMatch算法,这是一种不需要全局描述符方法,它基于开源数据关联框架,用于识别两个子地图之间重叠部分。...为了减小地图大小和后续优化维度,这些地标的实例将根据图匹配结果或质心距离进行合并。...这两个数据集提供了大量语义辅助扫描和地面真实姿势,可以用来构建和评估我们地图制作框架。 图5. CARLA模拟器上地图合并和鸟瞰视图共视连接案例。

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Power Query 真经 - 第 10 章 - 横向合并数据

---- 用户经常需要将两个独立数据表进行合并,以便后续制作透视表。...然而,在 Power Query 中,可以通过【合并】对话框支持多种不同连接类型。这些连接类型不仅可以找到匹配数据,还可以找到不匹配数据,这对任何试图匹配或汇总记录用户来说都是非常重要。...),那么该可以安全用作连接中 “右” 表键,而不会产生问题,如果 “非重复值” 和 “唯一值” 两个统计数据匹配本案例中 “Brand” 一样,那么就会存在 “左” 表列中值与 “右”...这两个词只有一个字母不同,但由于字符较少,无法确定它们是错误。 【注意】 【使用模糊匹配执行合并】功能仅在文本列上操作上受支持。...如果出于任何原因需要对使用不同数据类型执行模糊匹配,则需要首先将数据类型转换为【文本】。

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Pandas Merge函数详解

在日常工作中,我们可能会从多个数据集中获取数据,并且希望合并两个或多个不同数据集。这时就可以使用Pandas包中Merge函数。...pd.merge(customer, order) 默认情况下,merge函数是这样工作: 将按合并,并尝试从两个数据集中找到公共,使用来自两个DataFrame(内连接)值之间交集。...和索引合并 在上面合并数据集中,merge函数在cust_id列上连接两个数据集,因为它是唯一公共。我们也可以指定要在两个数据集上连接列名。...但是如果两个DataFrame都包含两个或多个具有相同名称,则这个参数就很重要。 我们来创建一个包含两个相似数据。...合并类型介绍 默认情况下,当我们合并数据集时,merge函数将执行Inner Join。在Inner Join中,根据键之间交集选择行。匹配两个或索引中找到相同值。

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R语言使用特征工程泰坦尼克号数据分析应用案例

为了提取这些标题以创建新变量,我们需要在训练集和测试集上执行相同操作,以便这些功能可用于增长我们决策树,并对看不见测试数据进行预测。在两个数据集上同时执行相同过程简单方法是合并它们。...在R中我们可以使用rbind,它代表行绑定,只要两个数据具有彼此相同。...所以在这里我们将两个标题“Mme”和“Mlle”组合成一个新临时向量,使用c()运算符并查看整个Title任何现有标题是否与它们中任何一个匹配。然后我们用“Mlle”替换任何一场比赛。...我们刚刚做最好部分是如何在R中处理因子。在幕后,因子基本上存储为整数,但是用它们文本名称掩盖以供我们查看。如果在单独测试和训练集上创建上述因子,则无法保证组中都存在两个组。...我们已根据原始列车和测试集大小隔离了组合数据某些行范围。之后逗号后面没有数字表示我们想要使用此子集获取所有并将其存储到指定数据

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精通 Pandas 探索性分析:1~4 全

现在,我们从两个单独数据,中两个工作表中获取数据,如以下屏幕截图所示: [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-LH90uqdh-1681365993784...将多个数据合并并连接成一个 本节重点介绍如何使用 Pandas merge()和concat()方法组合两个或多个数据。 我们还将探讨merge()方法以各种方式加入数据用法。...让我们创建两个数据,其中两个都包含具有相同数据但具有不同记录相同参数: dataset1 = pd.DataFrame({'Age': ['32', '26', '29'],...它仅包含在两个数据中具有通用标签那些行。 接下来,我们进行外部合并。...通过将how参数传递为outer来完成完整外部合并: 现在,即使对于没有值并标记为NaN,它也包含所有行,而不管它们是否存在于一个或另一个数据集中,或存在于两个数据集中。

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直观地解释和可视化每个复杂DataFrame操作

操作数据可能很快会成为一项复杂任务,因此在Pandas中八种技术中均提供了说明,可视化,代码和技巧来记住如何做。 ?...可以按照与堆叠相同方式执行堆叠,但是要使用level参数: df.unstack(level = -1)。 Merge 合并两个DataFrame是在共享“键”之间按(水平)组合它们。...此键允许将表合并,即使它们排序方式不一样。完成合并DataFrame 默认情况下会将后缀_x 和 _y添加 到value。 ?...记住:合并数据就像在水平行驶时合并车道一样。想象一下,每一都是高速公路上一条车道。为了合并,它们必须水平合并。...“inner”:仅包含元件键是存在于两个数据键(交集)。默认合并。 记住:如果您使用过SQL,则单词“ join”应立即与按添加相联系。

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python数据分析——数据选择和运算

True表示按连结主键(on 对应列名)进行升序排列。 【例】创建两个不同数据,并使用merge()对其执行合并操作。 关键技术:merge()函数 首先创建两个DataFrame对象。...关键技术:使用’ id’键合并两个数据,并使用merge()对其执行合并操作。...代码和输出结果如下所示: (2)使用多个键合并两个数据: 关键技术:使用’ id’键及’subject_id’键合并两个数据,并使用merge()对其执行合并操作。...【例】按合并对象。 关键技术:如果需要沿axis=1合并两个对象,则会追加新列到原对象右侧。...按照数据进行排序,首先按照C进行降序排序,在C相同情况下,按照B进行升序排序。

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使用快速密集特征提取和PyTorch加速您CNN

当尝试在图像中相邻重叠补丁上多次执行相同CNN时,通常会使用此方法。这包括基于任务特征提取,相机校准,补丁匹配,光流估计和立体匹配。...这个例子概括是s 是池/步幅大小,u和v是整数,P(x,y)和P(x + su,y + sv)补丁仍然共享由共享像素汇集输出两个补丁。 在不同图像位置(红色)修补P....使用蓝色补丁和使用绿色池补丁之间共享是不可能 这将创建所有一起S×S具有不同情况下独立于所述输入来计算“我们池层,其中I”是用于输入图像1-第i层。...项目结构很简单,有两个实现:pytorch和tensforflow,每个包含以下内容: FDFE.py - 实施所有方法层以及论文中描述前后处理方法 BaseNet.py- 这是指在训练补丁P上实施预先训练...脚本输出以下内容: base_net Cp输出和slim_net输出CI之间聚合差异- 如上所述,两个输出之间应该存在任何主要差异。 对于Cp,每个补丁平均评估 对于CI,每总评估。

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论文翻译 | ORB-SLAM3:一个用于视觉、视觉惯性和多地图SLAM系统

如果找到匹配关键属于活动地图,则执行回环闭合。否则,它是一个多地图数据关联,然后合并活动地图和匹配地图。...) 如果位置识别成功,产生了多地图数据关联,在活动地图中关键和地图集中不同地图中匹配关键之间,使用对齐变换进行地图合并操作.需要确保Mm中信息能被tracking线程及时调用,避免地图重复....) 回环闭合校正算法类似于地图合并,但是位置识别匹配两个关键都是属于活动地图....SLAM性能 两个数据集中多阶段实验 我们使用RMS ATE测量精度,在纯单目情况下使用Sim(3)变换,在其余传感器配置中使用SE(3)变换,将估计轨迹与地面真实情况对齐.所有实验都在3.6千兆赫...该表还与EuRoC数据集中两个唯一发布多节结果进行了比较:CCM-SLAM [73]报告了MH01-MH03中纯单目结果,以及VINS-Mono使用单目惯性在五个机器霍尔序列中结果.在这情况下

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