如何在snakemake输出规则中获取通配符的基名？

在snakemake中，可以使用wildcards对象来获取通配符的基名。通配符是在规则中定义的占位符，用于匹配输入和输出文件的模式。基名是指文件名中去除扩展名和通配符的部分。

要在snakemake输出规则中获取通配符的基名，可以使用wildcards对象的属性来访问通配符的值。假设有一个规则定义如下：

rule example_rule:
    input:
        "data/{sample}.txt"
    output:
        "results/{sample}_output.txt"
    shell:
        "echo {wildcards.sample} > {output}"

在这个规则中，{sample}是一个通配符，它匹配data目录下的所有.txt文件。{wildcards.sample}表示通配符的值。

在输出规则中，可以使用{wildcards.sample}来获取通配符的值，并将其用于构建输出文件的路径。例如，如果输入文件为data/sample1.txt，那么输出文件将为results/sample1_output.txt。

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