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R语言ggplot2作图如何去掉图例NA

遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树时候,我想给进化树枝分组映射颜色,对应推文是跟着Nature Genetics学画图:R语言ggtree给进化树枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧图例最下方式有一个NA,如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...=FALSE) 图例线更改粗一点 ggtree(tree_1)+ geom_tree(aes(color=group))+ geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_manual...image.png 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python

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如何 Java 8 流转换为数组

问题 Java 8 ,什么是流转换为数组最简单方式?...String[] stringArray = stringStream.toArray(size -> new String[size]); 其中 IntFunction generator 目的是数组长度放到到一个新数组中去...我们县创建一个带有 Stream.of 方法 Stream,并将其用 mapToInt Stream 转换为 IntStream,接着再调用 IntStream toArray...toArray(); 紧接着也是一样,只需要使用 IntStream 即可; int[]array2 = IntStream.rangeClosed(1, 10).toArray(); 回答 3 利用如下代码即可轻松一个流转换为一个数组...然后我们在这个流上就可以进行一系列操作了: Stream myNewStream = stringStream.map(s -> s.toUpperCase()); 最后,我们使用就可以使用如下方法将其转换为数组

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PyQt5如何.ui文件转换为.py文件实例代码

PyQt5之如何.ui文件转换为.py文件 一、通过Eric6把.ui文件转换为.py文件 1、首先打开Eric6编辑器,切换到“窗体”选项卡,然后选中需要转换.ui文件,单击鼠标右键,选择“编辑窗体...二、通过命令行把.ui文件转换为.py文件 1、通过PyQt5提供命令行工具pyuic5可以轻松实现,打开cmd,路径切换到你保存.ui文件路径位置,输入以下命令:文件名为你需要转换.ui文件名字...highlight==signal#pyuic5 三、通过Python脚本把.ui文件转换为.py文件 1、这个脚本本质上是用Python代码把上述操作封装起来,如下: import os import...需要注意是:转换之后.py文件存储位置和你所新建Python文件位置一样。...总结 到此这篇关于PyQt5之如何.ui文件转换为.py文件文章就介绍到这了,更多相关PyQt5之如何.ui文件转换为.py文件内容请搜索ZaLou.Cn

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dpois函数_frequency函数

我们保存此数据集,以便我们可以在接下来几个示例重复使用它。 not_cancelled % filter(!is.na(dep_delay), !...在查看此类图时,过滤掉具有最少观察数组通常很有用,因此可以看到更多模式,而不是最小组极端变化。这就是下面的代码所做,并向您展示了ggplot2集成到dplyr流便捷模式。...均值是除以长度总和;中位数是一个值,其中50%x高于它,50%低于它。 聚合与逻辑子集相结合有时很有用。我们还没有谈到这种子集化,但你会在子集中了解更多。...分位数是中位数推广。 例如,quantile(x, 0.25)发现x中值大于25%,并且小于剩余75%值。...当与数字函数一起使用时,TRUE转换为1,FALSE转换为0。这使得sum()和mean()非常有用:sum(x)给出xTRUE数,而mean(x)给出比例。

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我常用缺失值插补方法

有的时候,面对一个有缺失值数据,我只想赶紧把它插补好,此时我并不在乎它到底是怎么缺失、插补质量如何等,我只想赶紧搞定缺失值,这样好继续进行接下来工作。 今天这篇推文就是为这种情况准备!...关于R语言中缺失值插补,大家遇到最多教程应该是mice包,不过我不太常用,所以就不介绍了。 一般来说,如果只是简单均值或中位数填补的话,不需要R包,自己写一行简单代码就搞定了。...均值/中位数/最大值/最小值等 新建一个有缺失值数据集。...(df1)) ## ## FALSE ## 40 中位数插补: # 用每一列中位数插补 df2 <- sapply(df, function(x){ x[is.na(x)] <- median...,如果同时有多列都有缺失值,也要配合其他函数完成

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r语言求平均值_r语言计算中位数

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君 R统计分析通过使用许多内置函数来执行,这些函数大部分是R基础包一部分,并且它们R向量与参数一起作为输入,并在执行计算后给出结果。...先来看如何求平均值。...好啦,来综合看下实例: 输出结果为: 数据系列中间值被称为中位数,在R中使用median()函数来计算中位数,语法如下: median(x, na.rm = FALSE) 参数描述如下: x...na.rm – 用于从输入向量删除缺少值。 众数是指给定一组数据集合中出现次数最多值,不同于平均值和中位数,众数可以同时具有数字和字符数据。...R没有标准内置函数来计算众数,因此,我们创建一个用户自定义函数来计算R数据集众数。该函数向量作为输入,并将众数值作为输出,来分别看下实例: 输出结果为: 好啦,本次记录就到这里了。

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机器学习(二) 如何做到Kaggle排名前2%

摘要 本文详述了如何通过数据预览,探索式数据分析,缺失数据填补,删除关联特征以及派生新特征等方法,在KaggleTitanic幸存预测这一分类问题竞赛获得前2%排名具体方法。...该项目是一个二元分类问题 如何取得排名前2%成绩 加载数据 在加载数据之前,先通过如下代码加载之后会用到所有R库 1234567891011121314151617 library(readr) #...因此,可暂Title作为预测模型一个特征变量。...1 data$Fare[is.na(data$Fare)] <- median(data$Fare, na.rm=TRUE) 缺失Cabin设置为默认值 缺失Cabin信息记录数较多,不适合使用中位数或者平均值填补...由于Cabin信息不太容易从其它变量预测,并且在上一节NA单独对待时,其IV已经比较高。因此这里直接缺失Cabin设置为一个默认值。

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如何字符串子字符串替换为给定字符串?php strtr()函数怎么用?

如何字符串子字符串替换为给定字符串? strtr()函数是PHP内置函数,用于字符串子字符串替换为给定字符串。...该函数返回已转换字符串;如果from和to参数长度不同,则会被格式化为最短长度;如果array参数包含一个空字符串键名,则返回FALSE。 php strtr()函数怎么用?...规定要转换字符串。 ● from:必需(除非使用数组)。规定要改变字符(或子字符串)。 ● to:必需(除非使用数组)。规定要改变为字符(或字符串)。...一个数组,其中键名是原始字符,键值是目标字符。 返回值 返回已转换字符串。...如果 from 和 to 参数长度不同,则会被格式化为最短长度;如果 array 参数包含一个空字符串("")键名,则返回 FALSE。

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R」用purrr实现迭代

,因此代码提取出来,转换为一个函数: col_mean = function(df) { output = vector("double", length(df)) for ( i in...哎呀,我们又复制粘贴了2次代码,因此是不是该思考下如何扩展一个代码让它同时发挥几个函数功能呢?这段代码大部分是一个for循环,而且如果不仔细很难看出3个函数有什么差别。...接下来我们学习和使用purrr包,它提供函数可以替代很多常见for循环应用。R基础包apply应用函数族也可以完成类似的任务,但purrr包函数更一致,也更容易学习。...这种模式太普遍了,因而purrr包提供了一个函数族我们完成这种操作。...当检查多个模型时,有时候我们需要提取像R方这样摘要统计量,要想完成这个任务,我们需要先运行summary()函数,然后提取结果r.squared: models %>% map(summary

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在javascript如何字符串转成变量或可执行代码

有这样一个需求:当前作用域内有未知一些变量,其中一个函数可以拿到某个变量名字符串,怎么能在函数内通过传进来字符串取到作用域链变量值,示例小 demo 如下: const name = '周小黑...return value } const str = fn('name') 要解决上面的问题,主要就是怎么字符串转变成可执行代码?...主要有三种方式: eval() 函数 eval() 函数会将传入字符串当做 JavaScript 代码进行执行,所以下面的字符串可以正确取到变量对应值,eval 对比 new Function 和...setTimeout 定时器 setTimeout 第一个参数我们平时都是传一个函数,它其实也是可以传字符串进去,在浏览器是可以正常执行,在node环境中会报错。...实际上浏览器也是不推荐这么用,另外需要注意是字符串变量只能访问全局作用域,不能访问局部作用域,如果全局作用域中没有,就是 undefined。

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Python—关于Pandas缺失值问题(国内唯一)

获取文中CSV文件用于代码编程,请看文末,关注我,致力打造别人口中公主 在本文中,我们将使用PythonPandas库逐步完成许多不同数据清理任务。...在此列,有四个缺失值。 n/a NAna 从上面,我们知道Pandas会将“ NA”识别为缺失值,但其他情况呢?让我们来看看。...从前面的示例,我们知道Pandas检测到第7行空单元格为缺失值。让我们用一些代码进行确认。...遍历OWN_OCCUPIED列 尝试条目转换为整数 如果条目可以更改为整数,请输入缺失值 如果数字不能是整数,我们知道它是一个字符串,所以继续 看一下代码,然后我将对其进行详细介绍 # 检测数据 cnt...更换 通常,您必须弄清楚如何处理缺失值。 有时,您只是想删除这些行,而其他时候,您将替换它们。 正如我之前提到,这不应该掉以轻心。我们介绍一些基本推论。

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精品教学案例 | 金融贷款数据清洗

在DataFrame求其一列即Series对象均值方法为mean,众数方法为mode,中位数方法为median。 首先是对字符型填补。...首先查看该列中位数是多少,由于该列存储是字符串数据,且都为年份,但是表达含义是数值型,故而先使用正则表达式将其匹配转换为数值型,然后求其中位数。 首先导入正则表达式所需要包re。...,由此新DataFrame来计算得到所需中位数值,再填补回原数据。...信息补完,再填补回原数据。此处使用简单字符串粘贴即可。...处理异常值过程,较难如何找到,一般来说会绘制箱线图或者该列折线图来进行异常值查看,找到异常值后可以有各种方法来对其进行处理,例如直接删除该数据,或者进行各类填补,此处填补方式与缺失值类似就不多介绍

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R 与 Python 双语解读统计分析基础

本系列文章主要目的是结合 R 和 Python 两种语言代码来理解统计分析一些概念和方法。 主要是理解相关数学概念,不偏倚语言。...第一四分位数与第三四分位数之间差异称为四分位数间距(IQR),有时被用作标准差可靠替代。也可以同时获得其他分位数;这可以通过添加包含所需百分比参数来完成。例如,下面的代码就是获得十等分方法。...R 在默认参数情况下,第 i 个观察值对应 分位数,通过线性插值获得中位数。 对于上面这类基本统计函数,如果数据缺少值,情况变得更加复杂。为了说明,我们使用以下示例。...:30.000 NA's :859 注意因子变量显示如何变化。...在上面,变量 sex、menarche 和 tanner 被转换为具有适当级别名称因子(在原始数据,这些变量使用数字表示)。转换后变量放回数据框,以替换原始变量。

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数据分析|R-描述性统计

前文介绍了脏数据缺失值数据分析|R-缺失值处理和异常值数据分析|R-异常值处理常规处理方法,之后就可以对数据进行简单描述性统计,方便我们对数据有一个整体认识。...常见描述性统计可以通过最小值、下四分位数、中位数、上四分位数和最大值,均值、众数、标准差、极差等查看数据分布和离散程度;通过偏度(数据分布形态呈现左偏或右偏)和峰度(分布形态呈现尖瘦或矮胖)等查看数据正态与否...下面简单介绍如何使用R实现数值型变量上述统计量。 1 基础包summary()函数 可得到数值型变量最小值、下四分位数、中位数、上四分位数和最大值。...:335.0 2 psych包describe()函数 可得到非缺失值个数、均值、标准差、中位数、截尾平均数、绝对位差、最小值、最大值、极差、偏度、丰度和平均值标准误 #install.packages...R结果一致,而且可以根据自己需求选择返回值。

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R语言入门之切尾均值(trimmed mean)与绝对位差(median absolute deviation,mad)

具体R代码实现如下: #创建数据,设定切尾比例 library(psych) d <- c(1,2,3,5) #将上一期内容里变量a去除NA值 d <- sort(d) #排序 r <- 0.1...接下来我们换一组较大数据试试: e <- rnorm(100) #使用rnorm(100)生成100个服从标准正态分布随机数 e <- sort(e) #随机数排好序 r <- 0.1 #设置切尾比例是...绝对位差 绝对位差(median absolute deviation)是指数据点到中位数绝对偏差中位数,实际上就是偏差中位数。...具体R代码实现如下: d <- c(1,2,3,5) #a去除NA值 d <- sort(d) median(abs(d-median(d))) # 计算绝对中位数 # [1] 1 上述结果和psych...在这一期我们详细了解了切尾均值和绝对位差含义和计算,并用R语言基本函数和psych包里函数分别实现了一遍,相信大家应该对此有了更深刻认识了,在下一期我们详细介绍偏度和峰度,敬请期待!

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