前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub，还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...接下来我们要做的就是将第四列中的注释信息，从转录本ID替换成相应的基因名字。我们给大家分享三种不同的方法。..._.*","\\1",bed$V4) #获取转录本号对应的基因名字 symbol=mapping[NM,1] 方法一、使用最原始的gsub函数 #先将bed文件中的内容存放在result1中 result1...参考资料： ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列
在使用excel的过程中，我们知道，根据一个坐标我们很容易直接找到当前坐标的值，但是如果知道一个坐标里的值，反过来求该点的坐标的话，据我所知，excel没有提供现成的函数供使用，所以需要自己用VBA编写函数使用...(代码来自互联网) 在Excel中，ALT+F11打开VBA编辑环境，在左边的“工程”处添加一个模块 把下列代码复制进去，然后关闭编辑器 Public Function iSeek(iRng As Range...False, False): Exit For Next If iAdd = "" Then iSeek = "#无" Else iSeek = iAdd End Function 然后即可在excel的表格编辑器中使用函数...iSeek了，从以上的代码可以看出，iSeek函数带三个参数，其中第一个和第二个参数制定搜索的范围，第三个参数指定搜索的内容，例如 iSeek(A1:P200,20)，即可在A1与P200围成的二维数据表中搜索值
# 关于排序：如何根据函数返回的值对dart中的List进行排序 void main(){ List pojo = [POJO(5), POJO(3),POJO(7),POJO(1)
1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat中配置R环境后，我们知道对于多数企业来说是没有外网环境的，在离线环境下如何安装R的包，能否搭建R的私有源对R的包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...1.Linux已安装Apache2服务并正常运行 2.R已安装完成并正常使用 2.Package的安装 ---- R的Package安装主要分为在线安装和离线安装两种方式，如下： 1.在线安装 在R的控制台输入...搭建需要注意，PACKAGES文件中记录了所有包的描述信息，且每个包只有一个版本。...4.配置R使用私有源 ---- 1.在$R_HOME/ lib64/R/etc目录下增加配置文件Rprofile.site 在Rprofile.site文件中增加如下内容： [root@ip-172-31
JS中的Map如何根据已知的key获取到对应的value值 JS中的Map如何根据已知的key获取到对应的value值？
excelperfect Q：我有一个工作表，在单元格B1中输入有数值，我想根据这个数值动态隐藏行2至行100。...具体地说，就是在工作表中放置一个命令按钮，如果单元格B1中的数值是10时，当我单击这个命令按钮时，会显示前10行，即第2行至第11行；再次单击该按钮后，隐藏全部的行，即第2行至第100行；再单击该按钮，...则又会显示第2行至第11行，又单击该按钮，隐藏第2行至第100行……也就是说，通过单击该按钮，重复显示第2行至第11行与隐藏第2行至第100行的操作。...图1 如何实现？ 注：这是在chandoo.org的论坛上看到的一个贴子，有点意思。...A：使用的VBA代码如下： Public b As Boolean Sub HideUnhide() If b =False Then Rows("2:100").Hidden
例如百度经验中的经验摘要，简短的描述了该经验的主要解决问题。 自动摘要的算法原理 余弦相似度（Cosine Similarity） ?...算法步骤： 获取到需要摘要的文章 对该文章进行词频统计 对该文章进行分句 根据中文的标点符号，一般我们采用。，？...进行分句 计算分句与文章之间的余弦相似度 代码实现： library(tm) library(tmcn) library(Rwordseg) docs <- Corpus( DirSource(...SogouC.mini/SampleNamed/C000024" ) ), readerControl = list( language='UTF-8' ) ) #使用矩阵的方式计算
在目前的数据挖掘领域， 推荐包括相似推荐以及协同过滤推荐。...相似推荐（Similar Recommended） 当用户表现出对某人或者某物感兴趣时，为它推荐与之相类似的人，或者物， 它的核心定理是：人以群分，物以类聚。...协同过滤推荐（Collaborative Filtering Recommendation） 利用已有用户群过去的行为或意见，预测当前用户最可能喜欢哪些东西 或对哪些东西感兴趣。...★相似推荐是基于物品的内容，协同过滤推荐是基于用户群过去的行为， 这是两者最大的区别。 相关文章推荐主要的原理是余弦相似度（Cosine Similarity） ?...利用余弦相似度进行相似文章推荐的代码实现： library(tm) library(tmcn) library(Rwordseg) docs <- Corpus( DirSource( c
遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树的时候，我想给进化树的枝分组映射颜色，对应的推文是跟着Nature Genetics学画图：R语言ggtree给进化树的枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到的R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧的图例最下方式有一个NA的，如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python...做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！
/bert4keras.git 特别感谢腾讯钛提供的免费的32GB显存的机器。...对应的我会给腾讯钛写好多好多的技术博客的呦。 下载 thucnews数据集 thucnews文件需要自己申请才可以下载的呦，非商业用途仅为了技术交流哦。 #!...parallel_apply( func=_tokenize_and_count, iterable=tqdm(_batch_texts(), desc=u'构建词汇表中'...checkpoint_path, application='seq2seq', model='albert', keep_words=keep_words, # 只保留keep_words中的字...从卖家发布的内容看，数据包含华住旗下汉庭、禧玥、桔子、宜必思等10' \ u'余个品牌酒店的住客信息。
金山文档作为老牌文档应用，推出了新的功能轻维表，是一款新式在线协作表格，具有传统表格强大的内核发动机，是专为多人协作场景设计的增强版表格软件，可以支持快速搭建轻量应用。...由于金山文档轻维表是一款以表格为基础，同时引入了数据库理念的「全新协作效率应用」，可以广泛使用在例如项目管理、信息管理、团队任务分配的多种不同场景。金山文档轻维表如何根据日期自动提醒发送表格中的内容？...在团队中，项目PM经常需要及时提醒某一个事项的开始时间和结束时间，如何在项目开始时自动提醒相关人员及时处理呢？...发送效果如下：如何实现金山文档轻维表根据日期自动提醒发送表格中的内容？我们进入腾讯云HiFlow场景连接器，按照以下图示流程进行配置：那么将会在项目开始时，自动在工作群内提醒对应的人员进行跟进。...我们还有更多适合不同职能的场景。
文中利用自己医院的数据进行外部验证，套路简单易模仿，逻辑清晰，当然也有自己的一些特点，最后根据预测结果建立了一个在线的nomogram分析（动态nomogram），便于临床应用，接下来小编详细讲解一下。...在507例患者基础上，研究人员进行了单因素COX回归分析，结果表明11项变量与非典型支气管肺类癌预后相关（图2）。随后，研究人员又排除了43例患者（图3）。...此处虽然在文章结果部分已经呈现了排除的患者具体数量和具体原因，但是并没有解释为什么是在这一步排除这些患者，在文中方法部分也没有具体描述。...经过团队讨论，我们认为最大的可能是排除了那些单因素COX中有意义的变量资料缺失的患者（即上述11项变量资料缺失的患者被排除在外）。...利用survival包中自带的lung数据来操作演示。
excelperfect Q：这个问题很奇怪，需要根据在工作表Sheet1中输入的数值高亮显示工作表Sheet2中相应的单元格。...具体如下： 在一个工作簿中有两个工作表Sheet1和Sheet2，要求在工作表Sheet1中列A的某单元格中输入一个值后，在工作表Sheet2中从列B开始的相应单元格会基于这个值高亮显示相应的单元格。...例如，在工作表Sheet1的单元格A2中输入值2后，工作表Sheet2中从单元格B2开始的两列单元格将高亮显示，即单元格B2和C2高亮显示；在工作表Sheet1的单元格A3中输入值3，工作表Sheet2...中从B3开始的三列单元格将高亮显示，即单元格B3、C3和D3加亮显示，等等。...图1：在工作表Sheet1中输入数值 ? 图2：在工作表Sheet2中的结果 A：可以使用工作表模块中的事件来实现。
R语言如何导入其他统计软件中的数据？ R导入SAS数据集可以使用 foreign 包中的 read.ssd() 和 Hmisc 包中的 sas.get() 。...【说明】如果使用的是SAS的较新版本（SAS 9.1或更高版本） ，你很可能会发 现这些函数并不能正常工作，可以采用如下解决方案。...或者 一款名为Stat/Transfer的商业软件将SAS数据集为R数据框。...R导入SPSS数据集可以通过 foreign 包中的 read.spss()函数 或者Hmisc 包中的 spss.get() 函数。...导入Stata数据集可以通过foreign包中的read.dta()函数。 【温馨提示】foreign包和Hmisc包都是的R的扩展包，因此在使用之前，若是 没有安装，需要先安装。
让我们退一步讲，你如何描述或定义人工智能驱动的数字病理学？ JS：人工智能在DP中的应用涉及训练计算机和算法，以符合人类病理学家的方式来分析病理切片的扫描。...然后，我们可以在人类无法实现的规模上部署这些算法。人工智能计算技术通常比人类病理学家的读数更敏感、更准确、更精确、更一致。...MM：在病理学中利用人工智能方法，你们实现了什么价值？ JS：一个成功的例子是PD-L1的数字识别。PD-L1是许多适应症的既定生物标志物，用于识别可能对I-O疗法有反应的患者。...现在，真正令人兴奋的是，我们看到通过数字和人工读数识别的PD-L1阳性患者的临床反应率相似。 MM：这真是太棒了，对患者来说是个很好的结果。PD-L1是一个有趣的例子，它改善了人工病理学的性能。...这是一种通过空间计算分析可以独特识别的模式，与PathAI合作，我们已经建立了自动化和可扩展的方法来描述和量化将肿瘤分类为热、冷或排除的必要特征。
主题1 在10年之前已被审查，因此我们不知道他们是否在10年之前有此事件-我们如何将该主题纳入我们的估计中？...注意：应在检查数据之前根据临床信息进行操作 那些人群的子集至少跟踪到里程碑时间。注意：请务必在地标时间之前报告由于关注或审查事件而排除的号码。...使用BMT数据的Cox回归界标示例 在Cox回归中， 可以使用中的subset选项coxph来排除那些在标志性时间内没有被随访的患者 时间相关协变量 界标分析的替代方法是合并时间相关的协变量。...参考文献 1.R语言绘制生存曲线估计|生存分析|如何R作生存曲线图 2.R语言生存分析可视化分析 3.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI，NRI指标 4.r语言中使用Bioconductor...分析芯片数据 5.R语言生存分析数据分析可视化案例 6.r语言ggplot2误差棒图快速指南 7.R 语言绘制功能富集泡泡图 8.R语言如何找到患者数据中具有差异的指标？
背景：2019年的某月末日，三路人开局，兴趣所致组建了“花儿少年”：一个有组织、有纪律的R语言入门交流学习组织。自此，开启了一段小白&大师的成长史。...01 — 如何理解formula中y~.和y~x:z的含义？ y~. 和 y~x:z 是一个简单的formula。~和 : 是formula中的运算符，但它们与通常理解的数学运算符存在一定的差距。...以下是formula中其他一些运算符的含义： ~ ：~连接公式两侧，~的左侧是因变量，右侧是自变量。 + ：模型中不同的项用+分隔。注意R语言中默认表达式带常数项，因此估计 只需要写y~x。...- ：-表示从模型中移除某一项，y~x-1表示从模型中移除常数项，估计的是一个不带截距项的过原点的回归方程。此外，y~x+0或y~0+x也可以表示不带截距项的回归方程。...02 — 参考来源 《R语言实战》 https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/formula.html
3.与其他线性模型一样，固定效应中的共线性可能导致奇异拟合。 那将需要通过删除条款来修改模型。...但是，在lmer中，当估计随机效应方差非常接近零并且（非常宽松地）数据不足以拖动时，也可以在非常简单的模型中触发该警告（或“边界（奇异）拟合”警告）。估计远离零起始值。 两种方法的正式答案大致相似。...删除估计为零的字词。但是有时候，可以忽略不计的方差是合理的，但是希望将其保留在模型中。...4.R语言线性混合效应模型实战案例2 5.R语言线性混合效应模型实战案例 6.线性混合效应模型Linear Mixed-Effects Models的部分折叠Gibbs采样 7.R语言LME4混合效应模型研究教师的受欢迎程度...8.R语言中基于混合数据抽样(MIDAS)回归的HAR-RV模型预测GDP增长 9.使用SAS，Stata，HLM，R，SPSS和Mplus的分层线性模型HLM
3.与其他线性模型一样，固定效应中的共线性可能导致奇异拟合。 那将需要通过删除条款来修改模型。...但是，在lmer中，当估计随机效应方差非常接近零并且（非常宽松地）数据不足以拖动时，也可以在非常简单的模型中触发该警告（或“边界（奇异）拟合”警告）。估计远离零起始值。 两种方法的正式答案大致相似。...删除估计为零的字词。但是有时候，可以忽略不计的方差是合理的，但是希望将其保留在模型中。....R语言线性混合效应模型实战案例2 5.R语言线性混合效应模型实战案例 6.线性混合效应模型Linear Mixed-Effects Models的部分折叠Gibbs采样 7.R语言LME4混合效应模型研究教师的受欢迎程度...8.R语言中基于混合数据抽样(MIDAS)回归的HAR-RV模型预测GDP增长 9.使用SAS，Stata，HLM，R，SPSS和Mplus的分层线性模型HLM
该数据集包括每位患者超过23.5秒的4097个脑电图（EEG）读数，总共500名患者。然后将4097个数据点平均分成每个患者23个块; 每个块都被转换为数据集中的一行。...每行包含178个读数，这些读数被转换为列; 换句话说，有178列构成了EEG读数的一秒。总而言之有11,500行和180列，第一行是患者ID，最后一列包含患者的状态，无论患者是否有癫痫发作。...ID列，一秒钟内有178个EEG读数，以及一个Y输出变量，用于描述患者在该秒钟的状态。...九种模型中的七种具有非常高的性能，这很可能是由于患有癫痫发作且没有癫痫发作的患者之间的EEG读数的极端差异。决策树看起来像预期的那样过度装配，注意到训练AUC和验证AUC之间的差距。...根据您的偏差 - 方差诊断，可以根据此图表选择丢弃特征或通过组合一些来提出新变量。但是，对于模型没有必要这样做。从技术上讲，脑电图读数是我唯一的特征，读数越多，分类模型就越好。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
即时通信 IM
ICP备案
对象存储
实时音视频
