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xarray | 数据结构(2)

Dataset xarray.Dataset 是和 DataFrame 相同多维数组。这是一个维度对齐标签数组(DataArray)类字典容器。它用来展示NetCDF文件格式数据。...访问数据集中字典可以获取任意类别的变量。然而,xarray正是利用了索引和计算之间差异。坐标中表示是常数/固定/独立量,而数据中表示是变化/测量/依赖量。...注: 因为数据使用是投影坐标,因此 latitude 和 longitude 表示2D数组,而 reference_time 表示做出预测时参考时间,不是应用预测有效时间 time。...数据转换 除了上述类字典方法外, xarray 还有一些其它方法可以数据转换为其它对象。...使用 xarray 创建新数据不会造成性能损失,即使是从文件中加载。创建新对象代替那些存在”变异“变量,对于理解代码来说是有利

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xarray | 索引及数据选择

类似pandas对象,xarray也对象支持沿着每个维度基于整数和标签查找。 但是xarray对象还具有命名维度,因此您可以选择使用维度名称代替维度整数索引。...比如:mda.sel(x={'one': 'a'}, two=0) 类似 pandas,xarray 可以从多索引中选择部分索引。当多索引将为单索引时,返回对象会重命名维度坐标。...会将 Dataset 或 DataArray 添加到响应维度坐标。...缺省坐标标签 每个维度标签坐标是可选。没有坐标标签时,基于标签索引方法 sel 和 loc 使用标准基于整数和位置索引。...coordinates: x 如果两个 xarray 对象至少有一个没有坐标标签,只要有相同维度名和大小,同样可以执行对齐操作。

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xarray库(一) 】创建xarray对象

与位置描述有同样问题,维度t在Python数组中是从0开始,不是一个现实生活中时间。基于上面同样思想,我们可以定义t=0时,映射时间坐标time = 2021-01-01。...假设Python数组1个步长对应时间坐标的一天,那么当时间维度t=1时,时间坐标time = 2021-01-02。...DataArray维度名称,坐标和属性添加到多维数组,而Dataset则是多个DataArray数组集合。 “什么叫做类,什么叫做实例? 苹果是水果组成部分,那么苹果称为水果类。...每一项包含坐标名称,括号代表与之关联维度(可有多个),坐标数据类型,部分坐标值。 另外,如果坐标名称与维度名称重名,则将标有*。 按字母顺序排序维度名称列表(不含坐标名称)。...多个盘状垛堞图标可以查看对应变量部分数据。如果坐标名称与维度名称重名,则用粗体标记维度名称,而非text形式*。默认情况下,若在笔记本中直接查看某个xarray对象,直接写对象名称即可。

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Meteva笔记:加载GRIB 2要素场

转换 time,step 和 pl 都扩展为维度并将单位转为摄氏度 field = field.expand_dims(["time", "step", "pl"]) field = field...维度坐标值为 0 grid_data = meb.xarray_to_griddata( field, level_dim="pl", time_dim="time",...计算 计算 024 时效与该时刻分析场均方根误差 载入数据 整合函数,实现如下功能: 使用 nwpc-data 从 GRIB 2 文件中加载要素场 返回要素场转换为 xr.DataArray 对象...计算指标 计算均方根误差 RMSE 使用 squeeze 方法删掉长度为 1 维度数据变为二维矩阵 mem.rmse( anal_grid.squeeze(), fcst_grid.squeeze...计算多个预报数据指标 加载另一个数据:48 小时预报 file_path = find_local_file( "grapes_gfs_gmf/grib2/orig", start_time

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xarray | 数据结构(3)

xarray坐标有两种类型: 维度坐标 是名称和唯一维度名称相同1D数组(打印Dataset或 DataArray时 *号标记变量)。...非维度坐标 是包含坐标数据变量,但不是维度坐标。它们可以是多维,而且非维度坐标名称和它维度名称没有关系。非维度坐标在绘图或索引时非常有用。除此之外, xarray 不会限制使用与其相关值。...注: xarray术语和 CF 中术语不同。CF中维度坐标称作坐标变量,而非维度坐标称作辅助坐标变量 [注1]。CF是指 Climate and Forecast [注2]。...转换非维度坐标变量为数据变量: >> ds.reset_coords() Dimensions: (time: 3, x: 2, y: 2) Coordinates...datetime64[ns] 2014-09-05 day (time) int32 6 7 8 注意:除了维度坐标变量之外,其余维度坐标变量均转换为坐标变量。

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龙行龘龘!如何批量提取wrfout变量存为nc

为了更好地处理WRF模型输出数据(当然因为wrfout文件太大了!),我们经常需要批量提取其中变量,并将提取数据保存为NetCDF格式(.nc文件),这样可以方便我们后续分析和可视化操作。..., method='cat') # 变量添加到数据 dataset[var] = var_data print(dataset) # # 转换 projection 属性值为字符串..., mode='w', format='NETCDF4', group=None, engine=None, encoding=None): """ xarray 数据写入 NetCDF 格式输出文件...使用适用于 wrf-python xarray 数据结构。投影对象转换为字符串以便作为 NetCDF 属性使用。...=ALL_TIMES, method='cat') var_data = write_xarray_to_netcdf(var_data) # 变量添加到数据 dataset

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xarray系列|数据处理和分析小技巧

函数有 preprocess 参数,这个参数主要是在读取文件之前先进行一定处理,如果批量操作涉及到维度合并等操作时比较有用,比如要合并维度不是坐标,可能会出现以下错误,需要先将合并维度设置为坐标...我答案还是按照时间索引就行了。这里给上代码吧:注意 ds 坐标一定要有 time维度,名称不一定是 time,但一定要有时间格式坐标才行。...ds.sel(time=ds.time.dt.month.isin([1, 2, 3, 4])) 其实xarray 在时间序列处理方面的功能非常强大,而且内置了很多语法糖,比如按照季节筛选和计算,这些官方文档说都非常详细...,以前也说到过 xarray系列|教你更高效进行数据处理和分析。...用 pandas 处理效率太低,就算用了 modin、swifter 和 pandarallel 这些傻瓜式一键加速工具也不能达到效果,猜测可能是在处理数据时有 xarray 数据对象分配导致。

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xarray系列|数据处理和分析小技巧

函数有 preprocess 参数,这个参数主要是在读取文件之前先进行一定处理,如果批量操作涉及到维度合并等操作时比较有用,比如要合并维度不是坐标,可能会出现以下错误,需要先将合并维度设置为坐标...我答案还是按照时间索引就行了。这里给上代码吧:注意 ds 坐标一定要有 time维度,名称不一定是 time,但一定要有时间格式坐标才行。...ds.sel(time=ds.time.dt.month.isin([1, 2, 3, 4])) 其实xarray 在时间序列处理方面的功能非常强大,而且内置了很多语法糖,比如按照季节筛选和计算,这些官方文档说都非常详细...,以前也说到过 xarray系列|教你更高效进行数据处理和分析。...用 pandas 处理效率太低,就算用了 modin、swifter 和 pandarallel 这些傻瓜式一键加速工具也不能达到效果,猜测可能是在处理数据时有 xarray 数据对象分配导致。

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数据处理 | xarray计算距平、重采样、时间窗

一般这个残差称为距平。 对转换(Transformations)操作而言,消除数据气候平均是一个很好例子。转换操作对分组对象进行操作,但不改变原数据维度尺寸。...xarray 通过使用Groupby 算法使这些类型转换变得容易。下面给出了计算去除月份温度差异海温月数据。...ds_anom_rolling 参数time=12指定了对维度time以 12 个月为周期(月数据)变动时间窗,center参数表明以当前窗两侧筛选数据,否则是以当前窗前 12 个月作为筛选目标(包括本身...两者创建区别在于如果用列表创建 DataArray 的话,坐标名称和维度名称是重名(Coordinates 项会加粗或者在名称前加*)。若要创建非索引坐标,则必须通过字典创建。...foo 多个维度dims需用小括号或者方括号包裹。不同 coords 之间参数用逗号间隔,因为用列表创建坐标维度特性,无需写坐标维度名称。坐标维度名称沿用维度名称名字。

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利用 pandas 和 xarray 整理气象站点数据

利用 pandas 和 xarray 整理气象站点数据 平时用 xarray 库在处理 nc 格式数据非常方便,但偶尔还是要用到一些站点数据来辅助分析,而站点数据一般都是用文本文件存储,比如下图这种格式...用Python处理这种文本列表就需要用上 pandas 库了, xarray 库就是基于 pandas ,虽然天天在用 xarray ,但是这还是第一次正儿八经用 pandas 处理数据,就当做一次学习过程啦...一、 目标和步骤 将上图示例文件处理为(站点,时间)坐标的 nc 格式数据,方便以后直接读取,主要有以下几个步骤: 文本文件读取为 DataFrame 并将无效值替换为 Nan 时间信息处理为...pandas 可用时间坐标 DataFrame 进一步转换为 Dataset 并补充经纬度、站点名称信息 目标如图所示 ?...plt 定义处理过程中函数: 处理时间坐标,利用 datetime 整形年、月、日转换为 pandas 时间戳 def YMD_todatetime(ds): # 读取年月日数据,转换为

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xarray | 数据结构(1)

:数字,日期或字符串1D数组) attrs:包含元数据信息 xarray 使用 dims 和 coords 实现核心数据操作。...维度提供了xarray使用维度名称,从而代替大多数 numpy 函数所使用 axis(轴) 参数。...如果维度名缺省,默认以dim_N方式创建。坐标是可选,而且维度不会自动扩展坐标标签。 注: 和 pandas 不同是,pandas 中默认轴标签总是以 0, ..., n-1整数。...在 V0.9之前,xarray会仿照这种方式:如果没有指定坐标参数的话,xarray会提供默认值。 以下方式可以指定坐标信息: 值列表和维度数大小相同,为每个维度提供坐标标签。...对象或标量 1D数组或列表 (与坐标名称相同维度名对应1D坐标变量值) {coord_name: coord} 字典,值与列表形式相同。

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数据处理 | xarrayNC数据基础计算(1)

这个数据可追溯到 1854 年海表面温度,并被广泛使用。 ? ERSST v5 下载完毕数据后,我们利用.open_dataset函数导入 NetCDF 数据 path = "......ds.sst.isel(time=0).plot(vmin=-2, vmax=30) 上述代码选取了时间维度第一个变量 sst,同时通过vmin和vmax定义色标的绘制变量数值范围为-2 至 30....sst_kelvin 可以发现再进行计算操作后,数据维度坐标都没有发生变化。...需注意是,许多导入 xarray 数据存在单位(units)属性,这些属性可用于绘图,目前独立于 xarray 项目进行开发包pint[1]可以实现对单位完全感知并进行转换。...类似于上面的np.log函数,我们可以直接 xarray DataArray 对象放在函数括号里。 gsw.t90_from_t68(ds.sst) ?

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xarray走向netCDF处理(一):数据结构及数据读取

里面包含各个坐标 attrs 获取原始数据属性,比如变量名字、单位等 Dataset Dataset可以简单理解为由多个DataArray组成集合,它有如下几个重要属性 dims 获取维度名字...,结果类似于字典,如{'x': 6, 'y': 6, 'time': 8} data_vars 获取物理量名字 coords 获取一个类似于字典结果,里面包含各个坐标 attrs 获取原始数据属性...# 取出ds中名为t2m物理量,可以看到它维度坐标系,以及t2m有单位和名字两个属性 >>>ds['t2m'] <xarray.DataArray 't2m' (time: 12, latitude...: 2 metre temperatur 通过xarray可以清晰了解nc数据维度坐标、物理量以及各种属性等信息。...xarray封装了matplotlib部分绘图函数,一行代码就可以数据画出来,不过作为一个负责公众号,还是用cartopy顺带加载了地图。

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如何快速熟悉一个陌生nc格式数据

前言 首先,要快速熟悉一个陌生nc格式数据,你可以使用Python中xarray库。xarray是一个用于处理多维数组强大工具,特别适用于处理带有标签多维数据。...DataArray类似于NumPy数组,但它包含坐标维度标签,使得数据更易于理解和操作。...Dataset是一种类似于字典数据结构,用于存储多个DataArray,每个DataArray可以共享相同坐标系。...打开数据 import xarray as xr # 数据 f = '/home/mw/input/cru3546/cru_ts4.07.2021.2022.pre.dat.nc' # 打开数据...You are running version 2.14.1 可以看到有pre和stn两个变量,数据单位说是mm/month,那么pre就是月降水 再看维度,(time, lat, lon) 下面对数据进行切片

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利用 pandas 和 xarray 整理气象站点数据

作者:石异 (南京大学大气科学学院,硕士生) 利用 pandas 和 xarray 整理气象站点数据 平时用 xarray 库在处理 nc 格式数据非常方便,但偶尔还是要用到一些站点数据来辅助分析,而站点数据一般都是用文本文件存储...用Python处理这种文本列表就需要用上 pandas 库了, xarray 库就是基于 pandas ,虽然天天在用 xarray ,但是这还是第一次正儿八经用 pandas 处理数据,就当做一次学习过程啦...一、 目标和步骤 将上图示例文件处理为(站点,时间)坐标的 nc 格式数据,方便以后直接读取,主要有以下几个步骤: 文本文件读取为 DataFrame 并将无效值替换为 Nan 时间信息处理为...pandas 可用时间坐标 DataFrame 进一步转换为 Dataset 并补充经纬度、站点名称信息 目标如图所示 二、 具体处理 1....plt 定义处理过程中函数: 处理时间坐标,利用 datetime 整形年、月、日转换为 pandas 时间戳 def YMD_todatetime(ds): # 读取年月日数据,转换为

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xarray走向netCDF处理(一):数据结构及数据读取

里面包含各个坐标 attrs 获取原始数据属性,比如变量名字、单位等 Dataset Dataset可以简单理解为由多个DataArray组成集合,它有如下几个重要属性 dims 获取维度名字...,结果类似于字典,如{'x': 6, 'y': 6, 'time': 8} data_vars 获取物理量名字 coords 获取一个类似于字典结果,里面包含各个坐标 attrs 获取原始数据属性...# 取出ds中名为t2m物理量,可以看到它维度坐标系,以及t2m有单位和名字两个属性 >>>ds['t2m'] <xarray.DataArray 't2m' (time: 12, latitude...: 2 metre temperatur 通过xarray可以清晰了解nc数据维度坐标、物理量以及各种属性等信息。...xarray封装了matplotlib部分绘图函数,一行代码就可以数据画出来,不过作为一个负责公众号,还是用cartopy顺带加载了地图。

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关于WRF插值站点二三事

前言 很多时候我们需要拿模拟数据和站点图作对比,那就需要把模拟数据插值到站点 今天来尝试两种WRF数据插值到站点方法并使用meteva进行简单绘图 方法一:xesmf库重插值后使用meteva进行双线性插值到站点...dy + y0) # 使用 pyproj.transform() 这些网格坐标点从 WRF 模型投影坐标系转换回经纬度坐标系(PlateCarree投影),结果存储在 our_lons 和 our_lats...添加到Dataset中 ds_inter = xr.Dataset({'temp': t}) ds_inter meteva 转换xarray为grid_data(meteva可以绘制格式) In [...12]: tnn =meb.xarray_to_griddata(ds_inter) print(tnn) #对于da0里面的维度坐标名称为lon,lat,程序能够自动识别 *** <xarray.DataArray...无疑是更简单,并且插值后直接是xarray数组省去一步。

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工具推荐|XGCM-大气环流模式后处理工具

XGCM 是一个python包,用于处理由数值大气环流模型(GCMs)和类似网格数据产生数据,这些数据可以进行有限体积分析。...在这些数据集中,不同变量位于不同位置,相对于一个体积或面元素(如单元中心,单元面等) XGCM 解决了如何插值和差异这些变量从一个位置到另一个问题。...XGCM 使用并生成 xarray 数据结构,这是多维数组数据坐标和元数据丰富表示形式。...Xarray 是以多种方式分析 GCM 数据理想工具,它提供了方便索引和分组、坐标感知数据转换以及(通过 dask)并行、核外数组计算。...虽然高度并行超级计算机现在可以轻松地生成兆级和兆级数据,但普通后处理工作流还是要与这些卷做斗争。

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