无法在电子病历上连接JupyterHub
电子病历（Electronic Medical Record, EMR）是指将患者的医疗信息以电子形式进行记录和管理的系统。而JupyterHub是一个开源的、多用户的交互式计算环境，主要用于数据分析、科学计算和机器学习等领域。目前，无法直接在电子病历上连接JupyterHub的情况可以有以下原因和解决方案：
原因：
- 数据隐私和安全：连接JupyterHub可能涉及敏感的医疗数据和患者隐私信息，因此需要确保在安全的环境下进行访问和使用。
- 技术限制：电子病历系统可能不支持直接集成JupyterHub，或者存在技术上的限制，无法在现有系统中实现该功能。
解决方案：
- 数据隐私和安全保护：在处理敏感数据和患者隐私时，可以采取一系列安全措施，例如加密通信、访问控制、身份认证和审计日志等，以确保数据的保密性和完整性。同时，还需要遵守相关的法律法规和行业标准，如HIPAA（美国健康保险可移植性和责任法案）。
- 建立独立环境：可以在云计算环境中搭建一个独立的JupyterHub实例，将其与电子病历系统进行集成。通过数据集成和接口对接，将医疗数据传输到JupyterHub环境中进行分析和处理。这样可以避免直接在电子病历系统上进行连接，同时保证数据的安全性。
- 数据共享和协作：在医疗团队协作和数据共享方面，可以使用其他适合的工具和平台，如云端协作平台、数据仓库或数据集成平台等。这些工具可以提供更灵活和安全的数据共享和协作环境，同时支持团队成员之间的交流和合作。
推荐的腾讯云产品：
- 腾讯云数据安全服务（https://cloud.tencent.com/product/das）：提供数据加密、防火墙、访问控制等安全服务，保护敏感数据和隐私信息的安全性。
- 腾讯云虚拟专用网络（https://cloud.tencent.com/product/vpc）：提供安全、可靠的私有网络环境，用于搭建独立的JupyterHub实例和医疗数据传输通道。
- 腾讯云数据共享服务（https://cloud.tencent.com/product/dss）：提供数据集成和共享的解决方案，支持不同数据源之间的数据传输和协作。
请注意，以上仅为示例推荐，具体的解决方案和产品选择需要根据实际需求和场景进行评估和决策。另外，还需要与电子病历系统的供应商或开发团队进行沟通和协商，以确保集成和安全性的可行性。
相关·内容
1回答
我刚刚建立了一个EMR集群，内置火花，JupyterHub等等。我能够访问木星笔记本在，但我不知道我可以使用什么凭据登录，或我可以在电子病历设置这一点。
提前谢谢你！
浏览 0提问于2018-07-05得票数 7
回答已采纳
1回答
我有一个Lambda函数，它使用boto3连接到电子病历。我想使用我的s3函数在电子病历上运行"aws lambda cp“命令，将文件从S3复制到电子病历的本地目录。 有没有办法使用Lambda在EMR上运行aws cli命令？
浏览 12提问于2019-06-17得票数 0
我在电子病历上使用JupyterHub，而PySpark或PySpark3内核上没有安装Pandas。这些内核也不允许使用!。我尝试使用以下命令进行安装
import pip
pip.main(['install','pandas])
但这提高了ValueError: I/O operation on closed file.
当我打开终端内核时，pandas已经安装好了。
如果有其他方法可以安装到特定的内核，请告诉我。
浏览 18提问于2019-08-17得票数 1
回答已采纳
我有一个电子病历集群
response = emr_client.run_job_flow(
Name="Test dashboards",
ReleaseLabel='emr-6.2.0',
LogUri=f"s3://my-bucket/emr_logs/",
Instances={
'MasterInstanceType': 'm6g.2xlarge',
'SlaveInstanceType': 'm6g.2xlarge&
浏览 8提问于2021-02-05得票数 5
回答已采纳
1回答
我已经用JupyterHub创建了EMR集群(5.23.0)。我在主节点上创建了到9443的ssh隧道。但是，我无法连接到JupyterHub，页面没有resolve.Any的想法是什么缺失的？
浏览 19提问于2019-06-10得票数 0
2回答
我知道EC2比电子病历更灵活，但工作量更大。然而，在成本方面，如果使用EC2，它可能需要EBS卷连接到EC2实例，而AWS只需要从S3中流式输入数据。因此，在亚马逊网络服务计算器上计算数字，即使电子病历也必须支付EC2，电子病历变得比EC2更便宜?？我说错了吗？当然，使用EBS的EC2可能会更快，但这样做值得吗？
谢谢，马特
浏览 1提问于2013-10-02得票数 6
我正在尝试在Docker容器中运行Jupyterhub (参见)。我运行"Docker“下面列出的命令，容器成功运行，但当我转到连接时，我收到一条消息，提示”连接已重置“。
我还尝试创建了一个使用jupyterhub/configurable-http-proxy的either文件，因为我认为这可能是缺少的东西，但我也无法连接到它。此外，我尝试将jupyterhub_config.py添加到容器中，但没有成功。
为了让Jupyterhub在Docker容器中运行，有没有遗漏的步骤或者需要配置的其他东西？
浏览 0提问于2018-06-30得票数 0
亚马逊提供了一个非常详细的文档来将数据从电子病历复制到电子病历(通过S3)，但在其他方面似乎没有任何文档，这让我想知道将数据从电子病历加载到电子病历(直接，或通过某种媒介)是否是一个好的做法。
从理论上讲，我看不出有何不可，但我不知道这会有什么后果
浏览 13提问于2018-08-14得票数 0
1回答
我在Google上运行JupyterHub，但由于某些原因，我现在无法访问运行在VM上的JupyterHub。我不想解决当前JupyterHub的问题，而是想在Google引擎上迁移JupyterHub，所以我使用zero-to-jupyterhub-k8s在Google引擎上安装了另一个JupyterHub。
现在一切都很好，但是我想将保存在旧JupyterHub VM上的数据迁移到我的新JupyterHub上。新的JupyterHub使用持久卷声明作为每个用户荚的存储。有人能告诉我怎么做吗？
浏览 1提问于2020-08-03得票数 0
回答已采纳
我正在使用亚马逊电子病历
我的问题记录如下。
Image name '<account_id>.dkr.ecr.ap-northeast-2.amazonaws.com/pyspark-etl@sha256:3d3a07135.......https://forums.aws.amazon.com/....0.87563e51ef5c841841a5d1a6dde9c' doesn't match docker image name pattern
发行标签:emr-6.2.0
Hadoop发行版:Amazon3.2.1
应用:星火3.0.1，
蜂巢3.1.
浏览 4提问于2021-07-19得票数 0
嗨，我是AWS世界的新手，我在连接Python到Redshift数据库方面需要帮助。在没有使用任何第三方服务的情况下，我如何才能不提供凭据，因为我正在电子病历上运行它。
浏览 2提问于2021-12-06得票数 0
2回答
为什么EC2的列表与电子病历列表不同？
EC2：
电子病历：
为什么EC2中的所有类型的实例都不能用于电子病历？如何获得这个特殊的列表？
浏览 1提问于2018-05-21得票数 1
我已经做了一个电子病历集群，有spark和其他一些工具，但当启动电子病历笔记本并尝试访问s3存储桶文件时，我无法从s3下载该文件获得许可被拒绝错误。所有默认角色都具有s3的访问权限。 ?
浏览 22提问于2020-06-27得票数 2
回答已采纳
看看这篇文章：Visual Studio Working with remote Jupyter Notebook，想知道并尝试使用JupyterHub应用程序接口，但无法从Visual Studio代码建立连接。 是否可以在JupyterHub服务器中打开远程会话？
浏览 25提问于2019-01-30得票数 3
回答已采纳
我已经使用电子病历模板创建了一个AWS，但它没有在电子病历集群上安装DataPipeline。我需要为此设置什么特殊操作吗？我发现spark安装需要一些bootstrapaction，但这也不起作用。
浏览 0提问于2017-09-05得票数 0
我们目前正在为我们的一个应用程序建立电子病历集群，由于我们希望电子病历设置具有弹性，因此我们希望在不同于主要电子病历集群AZ的AZ中创建一个StandBy电子病历集群。但是，如果主EMR群集AZ宕机，我们不确定如何自动故障切换到辅助EMR。
有什么想法吗？
浏览 1提问于2017-06-14得票数 1
电子病历和扫描都将解析整个表并消耗请求配额，但电子病历还需要使用ec2实例，因此成本更高。
所以，我想知道在哪种情况下，EMR比在Amazon的Dynamo-DB上扫描更合适？
浏览 0提问于2012-07-17得票数 1
回答已采纳
1回答
我有两个Azure云机器正在运行，并试图在它们上使用jupyterhub。一种是“标准”的ubuntu服务器，另一种是机器学习版本，其中jupyterhub已经安装并运行。在这两种情况下，我都遇到了无法访问/使用jupyterhub的相同问题。每次我试图通过浏览器访问网站时，我都要暂停一下。我将网络设置设置为允许通过http、https、ssh传入流量。我试图从我的电话(使用我的LTE网络，而不是我的WI)访问它，但似乎没有任何东西给我访问。我得到的只是一页空白..。在“标准机器”上，我立即得到一个“连接拒绝”错误，而在“机器学习vm”上，我得到的是‘内部错误-服务器连接终止’。
有没有人知道
浏览 0提问于2018-11-12得票数 0
回答已采纳
1回答
AWS使用KMS加密S3桶
、、、、
我有下面的情况，我的电子病历，请有人指导如何进行配置相同？
EMR集群跨数据管道执行多个操作：
用S3BUCKET1写电子病历KMSKEY1
用S3BUCKET2写电子病历KMSKEY2
如何在电子病历中配置上述内容？只有我知道的配置电子病历的选项是在emrfs-site.xml & /etc/hadoop/conf.empty/core-site.xml
它们有标记fs.s3.serverSideEncryption.kms.keyId
如何使用上述KMS键实现我的要求？我需要为不同的桶写在KMS键之间切换。
浏览 1提问于2019-06-28得票数 4
我正在向EMR提交一个spark应用程序作业jar，它使用了一些属性文件。所以我可以把它放到S3中，在创建电子病历时，我可以下载它并将其复制到电子病历框中的某个位置，如果这是我在引导时创建电子病历集群本身的最佳方法。
浏览 0提问于2018-12-11得票数 1
我有一个AD插件连接到我的JupyterHub安装，这样用户将通过AD连接器在JupyterHub上进行身份验证。
问题是，如果不同的用户通过JupyterHub上的朱庇特笔记本将他们的星火作业提交给共享的底层星火引擎，那么是否有一种方法可以让每个用户都有他们的独立的火花会话而不是共享的会话？
非常感谢提前！
浏览 0提问于2018-12-23得票数 1
回答已采纳
我正在阅读下面使用Hive在DynamoDB上查询数据的集成。
但根据该链接，蜂巢需要建立在电子病历之上。但我想知道，我是否可以使用这种集成与我已经拥有的独立Hadoop集群，而不是使用EMR。有人做过这个吗？与使用电子病历相比，DynamoDB和HDFS中的数据之间会出现同步问题吗？
浏览 4提问于2012-04-18得票数 2
1回答
我已经在我的子域上安装了一个jupyterhub。每当我必须使用jupyterhub时，我必须在ubuntu终端上运行命令jupyterhub，如果它关闭了，我们就无法访问它。
那么，有什么方法可以在系统启动时自动启动jupyterhub吗？
版本: UBUNTU 16.4，anaconda 5.1.0，jupyter笔记本--版本5.4.0，
浏览 2提问于2018-06-12得票数 1
1回答
我觉得将电子病历连接到亚马逊S3是非常不可靠的，因为它依赖于网络速度。
我只能找到描述S3位置的链接。我想使用EMR与HDFS -我如何做到这一点？
浏览 1提问于2014-03-12得票数 8
2回答
我对医学领域没有太多的了解。
我们评估使用Cerner EMR系统的客户的需求
根据要求，我们需要公开Cerner电子病历或获取一些电子病历/电子病历数据，并将其显示在SharePoint 2013门户网站中。为了满足这一要求，Cerner提出了什么样的集成选项。是否有公开的API或Web服务可用于构建相同的自定义解决方案？
据我所知，Cerner确实以HL7格式公开了电子病历/电子病历信息，但我不知道如何访问它。
我还要求Cerner提供同样的服务，等待他们的回复。
如果任何人谁与类似的工作可以通过一些光，并提供给我一些见解。
浏览 4提问于2014-01-13得票数 2
在以下代码中，它可以使用EMR id检查EMR状态： import boto3
client = boto3.client('emr')
response = emrClient.describe_cluster(ClusterId='j-XXXXXXXX') 我发现没有使用emr名称查询emr状态的接口。但是，我只有电子病历的名字。如何使用电子病历名称检查我的电子病历状态？
浏览 15提问于2019-04-19得票数 0
回答已采纳
4回答
EMR笔记本安装附加库
、、、、
我有一个令人惊讶的困难的时间与更多的图书馆通过我的电子病历笔记本。EMR的AWS接口允许我创建木星笔记本并将它们附加到正在运行的集群中。我想在里面使用更多的库。SSHing进入机器并以ec2-user或root的形式手动安装不会使笔记本可以使用库，因为它显然使用livy用户。引导操作为hadoop安装东西。我无法从笔记本上安装，因为它的用户显然没有sudo、git等，而且它可能也不会安装到奴隶上。
通过电子病历接口创建的笔记本电脑安装附加库的标准方法是什么？
浏览 0提问于2019-02-14得票数 16
我正在使用终端服务器在电子病历(eCW)中对文档进行输墨。
当连接到同一终端服务器(2008年R2)时，Windows客户端的鼠标移动更新速度非常慢。Mac客户端更新得更快，结果是绘图很流畅。
下面是一个在MS油漆中绘制RDP上的圆圈的例子。
📷
Mac客户端是OSX上的"Microsoft远程桌面版本8.0.16“。
Windows客户端是Windows 8.1上的“远程桌面连接6.3.9600”
浏览 0提问于2015-05-04得票数 3
1回答
由于许可的原因，EMR中的Oozie没有与ExtJ捆绑在一起。因此，web控制台无法开箱即用。 在电子病历中安装ExtJS的步骤有哪些？
浏览 20提问于2019-08-28得票数 0
回答已采纳
我目前有一个运行HBase的AWS EMR集群。我正在将数据保存到S3。我想将数据迁移到同一帐户上的新EMR集群。将数据从一个电子病历迁移到另一个电子病历的正确方法是什么？谢谢
浏览 1提问于2021-03-06得票数 0
我知道你可以在电子病历hive中直接从DynamoDB加载数据，但是电子病历pig呢？
有没有办法在pig中直接从DynamoDB加载数据？而不先将其保存到hdfs？
谢谢。
浏览 1提问于2014-02-01得票数 0
我是亚马逊电子病历的新手，我想在电子病历中使用.pem文件。.pem文件在我的本地文件夹中。当我在EMR实例中创建与pem文件内容相同的文件时，它不工作。如果有人能提供从本地计算机复制文件到电子病历或从S3访问文件步骤，那将是非常有帮助的。
提前做好准备。
浏览 2提问于2014-12-01得票数 1
我使用的是Amazon Elastic Map Reduce 4.7.1、Hadoop 2.7.2、Hive 1.0.0和Spark 1.6.1。
用例:我有一个用于处理数据的Spark集群。这些数据作为拼图文件存储在S3中。我希望工具能够使用在Hive Metastore中注册的名称来查询数据(例如，查找foo表而不是parquet.`s3://bucket/key/prefix/foo/parquet`风格的操作)。我还希望这些数据在Hive Metastore (一个单独的RDS实例)的生命周期中持续存在，即使我拆除EMR集群并启动一个连接到相同Metastore的新集群也是如此。
问题
浏览 10提问于2016-07-21得票数 6
回答已采纳
我有一个电子病历集群。它是由terraform script设置的
resource "aws_emr_cluster" "emr-test" {
name = "emr-test"
applications = [..., "Ganglia", ...]
...
}
我想把ganglia和influxDb+Grafana集成起来。找到一个协同配置的例子：。
这需要更新主节点上的gmetad.conf文件。用terraform script可以做到这一点吗？电子病历步骤？
浏览 9提问于2017-12-04得票数 1
2回答
我尝试在Ubuntu 16.04上本地运行jupyterhub；但是，我似乎无法在终端上运行jupyterhub命令，并且我得到命令未找到错误。我已经通过运行以下命令安装了jupyterhub：
sudo npm install -g configurable-http-proxy
pip3 install jupyterhub
pip3 install --upgrade notebook
以上所有包均已成功安装。我在/etc/environment中的PATH变量设置如下：
PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/us
浏览 7提问于2017-08-16得票数 3
我有一个在电子病历上运行的Spark作业，从S3 (嵌套的json文件)读取数据集，将其与其他数据集连接，并显式覆盖一些S3文件。
因此，这不是一个标准的ETL用例，但AWS Glue可以提供相同的功能吗？如果是，Glue比EMR便宜吗？
浏览 2提问于2018-04-29得票数 1
AFAIK，电子病历是高度优化的读写从/到S3 &具有RACK_LOCAL数据局部性时，从S3读取。对我来说，这意味着他们总是在相同的可用区域(AZ)。另一方面，S3没有AZs。
无论您的电子病历部署在哪个AZ上，如何将RACK_LOCAL配置到同一个S3桶中？
浏览 4提问于2019-10-26得票数 1
为了使用test out sqoop，我启动了一个电子病历集群，但它似乎没有安装在最新版本的电子病历(5.19.0)上，因为我在目录/usr/lib/sqoop中找不到它。我也尝试了5.18.0，但也没有。
根据页面，应该在集群上安装sqoop1.4.7。
给了我一个4个“安装”的列表。我选择了核心Hadoop包。它在/usr/lib中安装了蜂窝、色调等。我是不是漏掉了什么？这是我第一次使用EMR或sqoop。
浏览 8提问于2018-12-03得票数 0
4回答
我正在对AWS Glue和AWS EMR进行定价比较，以便在EMR和Glue之间进行选择。 我考虑了6个DPU (4个vCPU+ 16 GB内存)，ETL作业在30天内运行10分钟。假设预期的爬网程序请求数高于空闲层100万次，对于额外的100万次请求计算为$1。 在电子病历上，我考虑了EC2和电子病历的m3.xlarge (价格分别为0.266美元和0.070美元)，有6个节点，运行10分钟，30天。 经过一个月的计算，我发现AWS Glue的价格约为14.64美元，而EMR的价格约为10.08美元。我还没有考虑其他额外的费用，如S3，RDS，Redshift等。和DEV Endpoint
浏览 104提问于2018-02-07得票数 17
回答已采纳
电子病历中JupytherHub的默认安装无法访问Spark中的配置单元上下文。我该如何解决这个问题呢？
浏览 11提问于2018-08-07得票数 1
回答已采纳
所以我对红移的有限理解这是我解决问题的计划…
我想获取查询的结果，并将它们用作EMR作业的输入。最好的编程方式是什么？
目前，我的电子病历作业从S3获取一个平面文件作为输入，我使用Amazon Java SDK来设置此作业和所有内容。
我是否应该将RedShift查询的输出写入S3，并将我的电子病历作业指向那里，然后在电子病历作业完成后删除该文件？
或者，RedShift和AWS SKD提供了一种更足智多谋的方法，可以直接将查询从RedShift传送到电子病历，从而省去了S3步骤？
谢谢
最近与亚马逊Redshift团队的成员进行了交谈，他们表示，解决方案正在进行中。
浏览 2提问于2013-07-18得票数 5
回答已采纳
在ams电子病历管理指南()中，我读到：
..。主实例舰队只是一个实例..。
这是否意味着，我不能提供一个电子病历集群的实例舰队，如高可用？还是我在这里漏掉了什么？
浏览 1提问于2020-10-05得票数 1
回答已采纳
1回答
我有一个文件，它以(a，b)的形式存储了100多万个条目，.My系统必须扫描该文件，找到给定'a‘的'b’，因为我们处理的是亚马逊网络服务的资源和服务，所以人们建议我使用AWS EMR。有人能帮我解决这个问题吗?因为我对电子病历不太了解。我已经了解了电子病历的基本知识。电子病历能解决我的问题吗？
浏览 1提问于2015-06-24得票数 0
使用terraform创建电子病历时，我需要通过terraform添加电子病历步骤，因为我需要禁用"keep_job_flow_alive_when_no_steps“。我如何才能做到这一点？
浏览 19提问于2018-01-17得票数 1
1回答
如何从EMR机群中提取AWS参数
、、、、
我们正在使用电子病历。在提交星火作业之前，我们正在尝试从AWS Param Store (我们已经编写了一个java程序)中提取配置参数，并创建一个文件并使用它提交火花。
我们使用aws-java-sdk-ssm API从param存储中提取参数。
当我们试图在主节点上运行这个程序时，它希望是一个令牌(. aws /配置/凭据)连接到aws ssm以获取参数。
我们可以在没有凭据的情况下访问S3存储桶，但不能访问param存储。
我们正在从汇流管道中提升电子病历集群。
下面是我们编写的从参数存储中提取参数的方法：
private static List<Parameter> get
浏览 3提问于2020-09-04得票数 0
我用Scala编写了在EMR中运行集群的代码。另外，我还有一个用Scala编写的Spark应用程序。我想在EMR集群上运行此Spark应用程序。但我可以在第一个脚本(启动EMR集群)中执行此操作吗？我想用SDK完成所有这些操作，而不是通过控制台或CLI。它必须是一种自动化，而不是单一的手工作业(或最小化手动作业)。
基本上；
启动电子病历群集->在电子病历->上运行Spark作业完成后终止
如果可能的话，我该怎么做？谢谢。
浏览 1提问于2020-03-23得票数 0
我在我们的实验室里运行一个小型的科学集群。安装Jupyterhub是为了让多个用户使用python/julia/r运行jupyter笔记本。我们是dask新手 如果我在本地节点上运行它们并通过127.0.0.1访问它们，那么Dask和jupyterlab扩展就可以正常工作，但是我不能让dask很好地使用我们通常用来连接到jupyterhub的nginx代理。状态页仍然指向127.0.0.1，而不是接入节点IP。任何提示都是值得感谢的。 我们的设置 Nginx<->jupyterhub on access node Slurm scheduler 8计算节点都在同一子网上
浏览 11提问于2020-10-31得票数 0
我想把我们的电子病历集群转移到一个新的VPC (新子网)上。当群集启动时，它将失败：
TerminatingService角色EMR_DefaultRole没有足够的ec2权限。有关更多信息，请参阅策略arn:aws:iam::aws:policy/service-role/AmazonElasticMapReduceRole
仅此而已。该角色及其连接的角色没有任何特定于子网或特定于vpc的定义。帮忙？
浏览 0提问于2017-12-14得票数 0
回答已采纳
我正在使用yelp MRjob来编写一些mapreduce程序。我在电子病历上运行它。我的程序有reducer代码，执行起来需要很长时间。我注意到，由于EMR中的默认超时时间，我收到此错误
Task attempt_201301171501_0001_r_000000_0 failed to report status for 600 seconds.Killing!
我想要一种增加电子病历超时的方法。我读了mrjob的官方文档，但我不能理解这个过程。有人能提出一个解决这个问题的方法吗？
浏览 3提问于2013-01-17得票数 1
回答已采纳
我试图让JupyterHub在Azure上运行，Nginx在子域上运行，但是无法连接到集线器。我得到了502坏网关错误与当前的一套张贴在下面。在我尝试过的其他配置中，连接到主机只是挂起。有什么想法吗？
我在Azure上使用Ubuntu，有2vcpus和7GB内存
~$ lsb_release -a
No LSB modules are available.
Distributor ID: Ubuntu
Description: Ubuntu 16.04.4 LTS
Release: 16.04
Codename: xenial
~$ jupyterhub -f /etc/j
浏览 0提问于2018-07-06得票数 0
回答已采纳
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
实时音视频
云直播活动推荐
腾讯云开发者
